RNA–Protein interactions for RNA: YER104W

RTT105, Transcript of Protein with a role in regulation of Ty1 transposition, yeastyeast

Gene RTT105, Length 627 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTT105YER104W PDX1P16451 410 aa3.34□□□□□ -1.87
RTT105YER104W VPS33P20795 691 aa3.34□□□□□ -1.87
RTT105YER104W VPS34P22543 875 aa3.34□□□□□ -1.87
RTT105YER104W PRE8P23639 250 aa3.34□□□□□ -1.87
RTT105YER104W RPC53P25441 422 aa3.34□□□□□ -1.87
RTT105YER104W GCD7P32502 381 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RTT105YER104W RGT1P32862 1170 aa3.34□□□□□ -1.87
RTT105YER104W BYE1P36106 594 aa3.34□□□□□ -1.87
RTT105YER104W EHT1P38295 451 aa3.34□□□□□ -1.87
RTT105YER104W COS111P38308 924 aa3.34□□□□□ -1.87
RTT105YER104W LYS9P38999 446 aa3.34□□□□□ -1.87
RTT105YER104W YJL193WP39542 402 aa3.34□□□□□ -1.87
RTT105YER104W BAP3P41815 604 aa3.34□□□□□ -1.87
RTT105YER104W MTL1P53214 551 aa3.34□□□□□ -1.87
RTT105YER104W RPT6Q01939 405 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RTT105YER104W YSA1Q01976 231 aa3.34□□□□□ -1.87
RTT105YER104W ERO1Q03103 563 aa3.34□□□□□ -1.87
RTT105YER104W YFT2Q06676 274 aa3.34□□□□□ -1.87
RTT105YER104W SMC6Q12749 1114 aa3.34□□□□□ -1.87
RTT105YER104W YBR126W-AQ8TGU7 68 aa3.34□□□□□ -1.87
RTT105YER104W ARG3P05150 338 aa3.33□□□□□ -1.88
RTT105YER104W CDC43P18898 376 aa3.33□□□□□ -1.88
RTT105YER104W PRP28P23394 588 aa3.33□□□□□ -1.88
RTT105YER104W OCA4P25366 362 aa3.33□□□□□ -1.88
RTT105YER104W FEN2P25621 512 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RTT105YER104W DBF4P32325 704 aa3.33□□□□□ -1.88
RTT105YER104W ERG3P32353 365 aa3.33□□□□□ -1.88
RTT105YER104W YBL029WP38201 376 aa3.33□□□□□ -1.88
RTT105YER104W STB5P38699 743 aa3.33□□□□□ -1.88
RTT105YER104W PCL5P38794 229 aa3.33□□□□□ -1.88
RTT105YER104W NUP60P39705 539 aa3.33□□□□□ -1.88
RTT105YER104W FLC2P39719 783 aa3.33□□□□□ -1.88
RTT105YER104W YEL025CP39991 1188 aa3.33□□□□□ -1.88
RTT105YER104W LSM5P40089 93 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RTT105YER104W PIG2P40187 538 aa3.33□□□□□ -1.88
RTT105YER104W LRO1P40345 661 aa3.33□□□□□ -1.88
RTT105YER104W YIL077CP40508 320 aa3.33□□□□□ -1.88
RTT105YER104W SKP2P42843 763 aa3.33□□□□□ -1.88
RTT105YER104W IDS2P46958 469 aa3.33□□□□□ -1.88
RTT105YER104W ASE1P50275 885 aa3.33□□□□□ -1.88
RTT105YER104W VPS73P53142 486 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RTT105YER104W VPS75P53853 264 aa3.33□□□□□ -1.88
RTT105YER104W YPL071CQ02864 156 aa3.33□□□□□ -1.88
RTT105YER104W RCN2Q12044 265 aa3.33□□□□□ -1.88
RTT105YER104W NUS1Q12063 375 aa3.33□□□□□ -1.88
RTT105YER104W NMD4Q12129 218 aa3.33□□□□□ -1.88
RTT105YER104W ERG27Q12452 347 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RTT105YER104W NOP58Q12499 511 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RTT105YER104W PGA3Q12746 312 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RTT105YER104W ATP2P00830 511 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RTT105YER104W SUI3P09064 285 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RTT105YER104W ROX1P25042 368 aa3.32□□□□□ -1.88
RTT105YER104W LCB1P25045 558 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RTT105YER104W PRE2P30656 287 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RTT105YER104W DSS4P32601 143 aa3.32□□□□□ -1.88
RTT105YER104W BCS1P32839 456 aa3.32□□□□□ -1.88
RTT105YER104W HIS7P33734 552 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RTT105YER104W MUM2P38236 366 aa3.32□□□□□ -1.88
RTT105YER104W LRP1P38801 184 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RTT105YER104W FMO1P38866 432 aa3.32□□□□□ -1.88
RTT105YER104W FMP10P40098 244 aa3.32□□□□□ -1.88
RTT105YER104W YIL161WP40449 235 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RTT105YER104W SPO22P40511 975 aa3.32□□□□□ -1.88
RTT105YER104W AAD10P47182 288 aa3.32□□□□□ -1.88
RTT105YER104W MRX6P48564 524 aa3.32□□□□□ -1.88
RTT105YER104W COS12P53053 380 aa3.32□□□□□ -1.88
RTT105YER104W YGR054WP53235 642 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RTT105YER104W REG1Q00816 1014 aa3.32□□□□□ -1.88
RTT105YER104W ARP9Q05123 467 aa3.32□□□□□ -1.88
RTT105YER104W ARO10Q06408 635 aa3.32□□□□□ -1.88
RTT105YER104W ARR3Q06598 404 aa3.32□□□□□ -1.88
RTT105YER104W ENT4Q07872 247 aa3.32□□□□□ -1.88
RTT105YER104W IRC13Q08630 104 aa3.32□□□□□ -1.88
RTT105YER104W CTI6Q08923 506 aa3.32□□□□□ -1.88
RTT105YER104W HIF1Q12373 385 aa3.32□□□□□ -1.88
RTT105YER104W MET17P06106 444 aa3.31□□□□□ -1.88
RTT105YER104W PWP1P21304 576 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
RTT105YER104W ERG8P24521 451 aa3.31□□□□□ -1.88
RTT105YER104W YCR061WP25639 631 aa3.31□□□□□ -1.88
RTT105YER104W NTH1P32356 751 aa3.31□□□□□ -1.88
RTT105YER104W ARB1P40024 610 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
RTT105YER104W TMN3P40071 706 aa3.31□□□□□ -1.88
RTT105YER104W UBP7P40453 1071 aa3.31□□□□□ -1.88
RTT105YER104W DJP1P40564 432 aa3.31□□□□□ -1.88
RTT105YER104W RFX1P48743 811 aa3.31□□□□□ -1.88
RTT105YER104W TAM41P53230 385 aa3.31□□□□□ -1.88
RTT105YER104W SSL2Q00578 843 aa3.31□□□□□ -1.88
RTT105YER104W MTG1Q03151 367 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
RTT105YER104W YMR155WQ03795 547 aa3.31□□□□□ -1.88
RTT105YER104W RAD30Q04049 632 aa3.31□□□□□ -1.88
RTT105YER104W RGC1Q06108 1083 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
RTT105YER104W CHS5Q12114 671 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
RTT105YER104W RTN2Q12443 393 aa3.31□□□□□ -1.88
RTT105YER104W VCX1Q99385 411 aa3.31□□□□□ -1.88
RTT105YER104W SPT7P35177 1332 aa3.3□□□□□ -1.88
RTT105YER104W KIN3P22209 435 aa3.3□□□□□ -1.88
RTT105YER104W YCK1P23291 538 aa3.3□□□□□ -1.88
RTT105YER104W MVD1P32377 396 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RTT105YER104W VPH1P32563 840 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RTT105YER104W ECM32P32644 1121 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
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