RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W PEX1P24004 1043 aa5.84□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W SWI4P25302 1093 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W BEM3P32873 1128 aa5.84□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W SEG2P34250 1132 aa5.84□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W YET1P35723 206 aa5.84□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W ERP2P39704 215 aa5.84□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W SPC72P39723 622 aa5.84□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W YIR042CP40586 236 aa5.84□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W AMA1P50082 593 aa5.84□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W MTL1P53214 551 aa5.84□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W MDR1P53258 950 aa5.84□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W ERG5P54781 538 aa5.84□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W TMA10Q06177 86 aa5.84□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W GET3Q12154 354 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W RIM15P43565 1770 aa5.84□□□□□ -1.47
VHS1YDR247W PHO5P00635 467 aa5.83□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W CDC37P06101 506 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W BMH1P29311 267 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W LST4P34239 828 aa5.83□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W BMH2P34730 273 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W MAC1P35192 417 aa5.83□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W RMA1P36001 430 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W EFM2P38347 419 aa5.83□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W SPT8P38915 602 aa5.83□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W LYS9P38999 446 aa5.83□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W TAH11P47112 604 aa5.83□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W SFH1Q06168 426 aa5.83□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W CDA2Q06703 312 aa5.83□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W VAC14Q06708 880 aa5.83□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W YPL225WQ08971 146 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W RUD3Q12234 484 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W SAC3P46674 1301 aa5.83□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W URA3P03962 267 aa5.82□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W MET3P08536 511 aa5.82□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W ECM32P32644 1121 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W BYE1P36106 594 aa5.82□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W CTM1P38818 585 aa5.82□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W STT3P39007 718 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W BUD16P39988 312 aa5.82□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W FYV8P46949 817 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W CPR6P53691 371 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W DLT1Q04216 342 aa5.82□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W EIS1Q05050 843 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W AIM41Q12032 185 aa5.82□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W MTF2P10849 440 aa5.81□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W GFA1P14742 717 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W COQ1P18900 473 aa5.81□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W SPO11P23179 398 aa5.81□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W MCM3P24279 971 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W TOD6P34219 525 aa5.81□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W SMF1P38925 575 aa5.81□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W NUP60P39705 539 aa5.81□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W EFM4P40516 257 aa5.81□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W BAP3P41815 604 aa5.81□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W MIC19P43594 170 aa5.81□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W IRC8P47046 822 aa5.81□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W MUP1P50276 574 aa5.81□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W MMR1Q06324 491 aa5.81□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W NEW1Q08972 1196 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W LAS17Q12446 633 aa5.81□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W POM152P39685 1337 aa5.81□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W TUF1P02992 437 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W CHO2P05374 869 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W TRP4P07285 380 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W MIS1P09440 975 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W CAF20P12962 161 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W PRE10P21242 288 aaKnown RBP RIP-Chip data5.8□□□□□ -1.48not detected
VHS1YDR247W SIR1P21691 654 aa5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W ARG1P22768 420 aa5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W GFD2P25370 566 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W NFU1P32860 256 aa5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W XRS2P33301 854 aa5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W CDS1P38221 457 aa5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W FTR1P40088 404 aa5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W SHQ1P40486 507 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W YIL077CP40508 320 aa5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W FAF1P40546 346 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W SMK1P41808 388 aa5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W UBA2P52488 636 aa5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W ARC35P53731 342 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W MRPL13Q02204 264 aa5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W VTC3Q02725 835 aa5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W EBS1Q03466 884 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W YMR018WQ04364 514 aa5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W OPY2Q06810 360 aa5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W NBL1Q3E7Y6 73 aa5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W RAD1P06777 1100 aa5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W POL3P15436 1097 aa5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W SPO12P17123 173 aa5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W PRP6P19735 899 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W RPA135P22138 1203 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W RAD57P25301 460 aa5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W YCL049CP25577 312 aa5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W SRB4P32569 687 aa5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W COS111P38308 924 aa5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W BCD1P38772 366 aa5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W FMO1P38866 432 aa5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W PIG2P40187 538 aa5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W ELO3P40319 345 aa5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W HOS4P40480 1083 aa5.8□□□□□ -1.48
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