RNA–Protein interactions for RNA: YDR093W

DNF2, Transcript of Aminophospholipid translocase (flippase), yeast

Gene DNF2, Length 4,839 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DNF2	YDR093W	YIL166C	P40445	542 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	YRB2	P40517	327 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	CSN9	Q03981	162 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	VTI1	Q04338	217 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	CSG2	P35206	410 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	ATG14	P38270	344 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	PHO90	P39535	881 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	VFA1	P40080	203 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	GID8	P40208	455 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	MAL13	P53338	473 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	GET4	Q12125	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	RRT12	P25381	491 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	ADY2	P25613	283 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	MYO3	P36006	1272 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	PXL1	P36166	706 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	ERG5	P54781	538 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	SIL1	Q08199	421 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	RSB1	Q08417	382 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
DNF2	YDR093W	APC1	P53886	1748 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	PEX34	P25584	144 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	CPR7	P47103	393 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	CLA4	P48562	842 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	ORC4	P54791	529 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	DCS2	Q12123	353 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	NBP2	Q12163	236 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	SPO12	P17123	173 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	PEX3	P28795	441 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	ATG12	P38316	186 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	MET18	P40469	1032 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	CHS6	P40955	746 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	AVT1	P47082	602 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	TGL2	P54857	326 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	PEX12	Q04370	399 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	PIG1	Q06216	648 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	GRS2	Q06817	618 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	YVC1	Q12324	675 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	RPP1B	P10622	106 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	SYN8	P31377	255 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	TKL2	P33315	681 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	HSL7	P38274	827 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	YHR202W	P38887	602 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	PNT1	P38969	423 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	FAA3	P39002	694 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	MON1	P53129	644 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	YNL146W	P53906	100 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	MLC2	Q06580	163 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	MCM21	Q06675	368 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	CDC73	Q06697	393 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	FRA1	Q07825	749 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	GPM2	Q12008	311 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	YPR011C	Q12251	326 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	CDC6	P09119	513 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	COY1	P34237	679 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	PEX28	P38848	579 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	RIC1	P40395	1056 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	MAM33	P40513	266 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	KAR5	Q04746	504 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	ENT4	Q07872	247 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	RTT10	Q08924	1013 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	GAL80	P04387	435 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	COS2	P0CX12	379 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	COS3	P0CX13	379 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	COS4	P43542	379 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	YLR036C	Q07986	203 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	ESA1	Q08649	445 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	NUR1	Q12066	484 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNF2	YDR093W	PRC1	P00729	532 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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