RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPS26P62854 115 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LRP10Q7Z4F1 713 aa11.21□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARHGEF25Q86VW2 580 aa11.21□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLITRK4Q8IW52 837 aa11.21□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NKD1Q969G9 470 aa11.21□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DZANK1Q9NVP4 752 aa11.21□□□□□ -0.61
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 GRIA4P48058 902 aa11.2□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EVA1CP58658 441 aa11.2□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TTBK2Q6IQ55 1244 aa11.2□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CEP120Q8N960 986 aa11.2□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KCNH5Q8NCM2 988 aa11.2□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 USP54Q70EL1 1684 aa11.2□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LMO7Q8WWI1 1683 aa11.2□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GLI3P10071 1580 aa11.2□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RGS12O14924 1447 aa11.19□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RGPD5Q99666 1765 aa11.19□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CGNL1Q0VF96 1302 aa11.19□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NWD2Q9ULI1 1742 aa11.19□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ACPPP15309 386 aa11.19□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TNP2Q05952 138 aa11.19□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MMRN1Q13201 1228 aa11.19□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VPS72Q15906 364 aa11.19□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM196AQ6ZSG2 479 aa11.19□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ANAPC16Q96DE5 110 aa11.19□□□□□ -0.62
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 LTN1O94822 1766 aa11.18□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COL18A1P39060 1754 aa11.18□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAP3K19Q56UN5 1328 aa11.18□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DCDC2BA2VCK2 349 aa11.18□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GRIN2CQ14957 1233 aa11.18□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP11.18□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TNNI3KQ59H18 835 aa11.18□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DEPDC7Q96QD5 511 aa11.18□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SEC31BQ9NQW1 1179 aa11.18□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SNTG2Q9NY99 539 aa11.18□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AATKQ6ZMQ8 1374 aa11.17□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A096LPE4 126 aa11.17□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A1W2PPZ6 126 aa11.17□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CRKP46108 304 aa11.17□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPEM2Q0P670 501 aa11.17□□□□□ -0.62
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRIM42Q8IWZ5 723 aa11.17□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SHDQ96IW2 340 aa11.17□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LRRC3Q9BY71 257 aa11.17□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MARK1Q9P0L2 795 aa11.17□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DNMT3LQ9UJW3 386 aa11.17□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KNSTRNQ9Y448 316 aa11.17□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa11.16□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa11.16□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAPTP10636 758 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BMP1P13497 986 aa11.16□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NRLP54845 237 aa11.16□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RASA3Q14644 834 aa11.16□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PTPROQ16827 1216 aa11.16□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NXPE3Q969Y0 559 aa11.16□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF576Q9H609 170 aa11.16□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa11.16□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa11.15□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 METTL12A8MUP2 240 aa11.15□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NFKBIEO00221 500 aa11.15□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AVPP01185 164 aa11.15□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AMPHP49418 695 aa11.15□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa11.15□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRIM46Q7Z4K8 759 aa11.15□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KCNB2Q92953 911 aa11.15□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GPATCH3Q96I76 525 aa11.15□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EP400Q96L91 3159 aa11.15□□□□□ -0.62
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PEAK1Q9H792 1746 aa11.15□□□□□ -0.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa11.14□□□□□ -0.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRPA1O75762 1119 aa11.14□□□□□ -0.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 THBS1P07996 1170 aa11.14□□□□□ -0.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HOXC9P31274 260 aa11.14□□□□□ -0.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SEZ6Q53EL9 994 aa11.14□□□□□ -0.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa11.14□□□□□ -0.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MORC1Q86VD1 984 aa11.14□□□□□ -0.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BRINP2Q9C0B6 783 aa11.14□□□□□ -0.63
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
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