RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 LY9Q9HBG7 655 aa4.65□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC12A7Q9Y666 1083 aa4.65□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 GOLGA8AA7E2F4 631 aa4.64□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 C6orf229H3BNL8 230 aa4.64□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 BBOX1O75936 387 aa4.64□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 LDHBP07195 334 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 LIFRP42702 1097 aa4.64□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 WTAPQ15007 396 aa4.64□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa4.64□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 CRY2Q49AN0 593 aa4.64□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC183Q5T5S1 534 aa4.64□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF804AQ7Z570 1209 aa4.64□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 SGMS1Q86VZ5 419 aa4.64□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP4.64□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 GGA1Q9UJY5 639 aa4.64□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 CFAP45Q9UL16 551 aa4.64□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 PLSCR1O15162 318 aa4.64□□□□□ -1.67
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LRRTM4-201ENST00000409088 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 RXRBP28702 533 aa4.64□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 NLGN1Q8N2Q7 840 aa4.64□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC82Q8N4S0 544 aa4.64□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 WDR66Q8TBY9 1149 aa4.64□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 NUP133Q8WUM0 1156 aa4.64□□□□□ -1.67
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LRRTM4-201ENST00000409088 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
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LRRTM4-201ENST00000409088 UBAC1Q9BSL1 405 aa4.64□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 ZBED2Q9BTP6 218 aa4.64□□□□□ -1.67
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LRRTM4-201ENST00000409088 TSPY26PQ9H489 355 aa4.64□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 HCSTQ9UBK5 93 aa4.64□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa4.64□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 COL24A1Q17RW2 1714 aa4.64□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 IRS2Q9Y4H2 1338 aa4.64□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 CDKL5O76039 1030 aa4.64□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 LIG1P18858 919 aa4.64□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 PTPREP23469 700 aa4.64□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 ATP2B4P23634 1241 aa4.64□□□□□ -1.67
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LRRTM4-201ENST00000409088 MSL1Q68DK7 614 aa4.64□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 GIMAP6Q6P9H5 292 aa4.64□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 CTR9Q6PD62 1173 aa4.64□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa4.64□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 BICD2Q8TD16 824 aa4.64□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 ESR2Q92731 530 aa4.64□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 USP28Q96RU2 1077 aa4.64□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 BRIP1Q9BX63 1249 aa4.64□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 CD209Q9NNX6 404 aa4.64□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
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LRRTM4-201ENST00000409088 DPYSL4O14531 572 aa4.63□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
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LRRTM4-201ENST00000409088 TMTC2Q8N394 836 aa4.63□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 PGBD1Q96JS3 809 aa4.63□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 ALG1Q9BT22 464 aa4.63□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC26A6Q9BXS9 759 aa4.63□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 MCM9Q9NXL9 1143 aa4.63□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 POLLQ9UGP5 575 aa4.63□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 ANAPC4Q9UJX5 808 aa4.63□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 BRWD3Q6RI45 1802 aa4.63□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 DOCK2Q92608 1830 aa4.63□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 UBE2Q2LH0YL09 131 aa4.63□□□□□ -1.67
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LRRTM4-201ENST00000409088 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 MMP10P09238 476 aa4.63□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 CYP2D6P10635 497 aa4.63□□□□□ -1.67
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LRRTM4-201ENST00000409088 NTRK3Q16288 839 aa4.63□□□□□ -1.67
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LRRTM4-201ENST00000409088 TBC1D16Q8TBP0 767 aa4.63□□□□□ -1.67
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LRRTM4-201ENST00000409088 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa4.63□□□□□ -1.67
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LRRTM4-201ENST00000409088 USP17L8P0C7I0 530 aa4.63□□□□□ -1.67
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LRRTM4-201ENST00000409088 RTN1Q16799 776 aa4.63□□□□□ -1.67
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LRRTM4-201ENST00000409088 IQCA1Q86XH1 822 aa4.63□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 RCOR1Q9UKL0 485 aa4.63□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 PARP3Q9Y6F1 533 aa4.63□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 UBR3Q6ZT12 1888 aa4.62□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 BAG3O95817 575 aa4.62□□□□□ -1.67
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