RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336180.6

LIMK1-201, Transcript of LIM domain kinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMK1, Length 3,219 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1-201ENST00000336180 MKNK2Q9HBH9 465 aa14.56□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 RTEL1Q9NZ71 1219 aa14.56□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 NRBP1Q9UHY1 535 aa14.56□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa14.56□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 ZSCAN30Q86W11 494 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 IQCA1Q86XH1 822 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 STAG2Q8N3U4 1231 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 DBNDD1Q9H9R9 158 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 SCN7AQ01118 1682 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 CACNA1SQ13698 1873 aa14.55□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 PFKFB1P16118 471 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 USP49Q70CQ1 688 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 CATIPQ7Z7H3 387 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 RASGRP4Q8TDF6 673 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 NHSQ6T4R5 1651 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 CHRNA5P30532 468 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 IRS2Q9Y4H2 1338 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 RAD21O60216 631 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 IFNAR1P17181 557 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 FAM160A1Q05DH4 1040 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 ENGASEQ8NFI3 743 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 TRIM5Q9C035 493 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 VAT1LQ9HCJ6 419 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 FAM196BA6NMK8 535 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 TEX11Q8IYF3 940 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 FAM200AQ8TCP9 573 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 BRIP1Q9BX63 1249 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 ARAP2Q8WZ64 1704 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 CASZ1Q86V15 1759 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 G3V3G9 751 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 DCAF8Q5TAQ9 597 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 SHC4Q6S5L8 630 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 LEMD3Q9Y2U8 911 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 WDR19Q8NEZ3 1342 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 ZNF202O95125 648 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 CASP1P29466 404 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 DPCR1Q3MIW9 517 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 PNOCQ13519 176 aa14.52□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 AOPEPQ8N6M6 819 aa14.52□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 WDR66Q8TBY9 1149 aa14.52□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 IL17RBQ9NRM6 502 aa14.52□□□□□ -0.08
LIMK1-201ENST00000336180 MMP1P03956 469 aa14.52□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 CLCN1P35523 988 aa14.52□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 TROAPQ12815 778 aa14.52□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 ADALQ6DHV7 355 aa14.52□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 HOMER1Q86YM7 354 aa14.52□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 NOSTRINQ8IVI9 506 aa14.52□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 STAMQ92783 540 aa14.52□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 DOCK2Q92608 1830 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 ARID5BQ14865 1188 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 ZNF174Q15697 407 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 PKN1Q16512 942 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 BRAPQ7Z569 592 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 VGLL3A8MV65 326 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 TSPY3P0CV98 308 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 TSPY8P0CW00 308 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 PTGS1P23219 599 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 ATP2B2Q01814 1243 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 LRMPQ12912 555 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 CRY2Q49AN0 593 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 POLR3EQ9NVU0 708 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 TAF1LQ8IZX4 1826 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 SBF2Q86WG5 1849 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 SEMA3EO15041 775 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 KCNG4Q8TDN1 519 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 UIMC1Q96RL1 719 aa14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 PDE4BQ07343 736 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 TCP10Q12799 353 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 SLC39A14Q15043 492 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 PTPAQ15257 358 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 RCSD1Q6JBY9 416 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 CERS5Q8N5B7 392 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 ANAPC4Q9UJX5 808 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 BECN2A8MW95 431 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 COBLO75128 1261 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 DEXIO95424 95 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 CDC25AP30304 524 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 C12orf60Q5U649 245 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMK1-201ENST00000336180 MAP3K14Q99558 947 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms