RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 ANKRD7Q92527 254 aa22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 TSC1Q92574 1164 aa22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 KCNQ2O43526 872 aa22.44■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 BMP15O95972 392 aa22.44■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 TUBB4AP04350 444 aa22.44■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC82Q8N4S0 544 aa22.44■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 TRIML1Q8N9V2 468 aa22.44■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 ZBTB22O15209 634 aa22.43■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 NT5DC1Q5TFE4 455 aa22.43■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 ISM2Q6H9L7 571 aa22.43■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.43■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 ANKRD2Q9GZV1 360 aa22.43■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 HSD3B7Q9H2F3 369 aa22.43■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22.43■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 DDAH1O94760 285 aa22.43■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 UBASH3AP57075 661 aa22.43■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 POSTNQ15063 836 aa22.43■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 COL4A1P02462 1669 aa22.42■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 SERPINC1P01008 464 aa22.42■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 NR5A1Q13285 461 aa22.42■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 MLKLQ8NB16 471 aa22.42■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 BRMS1Q9HCU9 246 aa22.42■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa22.42■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 SCN7AQ01118 1682 aa22.42■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 CCP110O43303 1012 aa22.42■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 IGSF3O75054 1194 aa22.42■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 KRT2P35908 639 aa22.42■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 RPS8P62241 208 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 ARMCX5Q6P1M9 558 aa22.42■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 NLRP3Q96P20 1036 aa22.42■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 TRIM75PA6NK02 468 aa22.41■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 USP27XA6NNY8 438 aa22.41■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 NT5C2P49902 561 aa22.41■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 PHF20Q9BVI0 1012 aa22.41■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 CABP5Q9NP86 173 aa22.41■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 ORC4O43929 436 aa22.41■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 FUT2Q10981 343 aa22.41■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 CTR9Q6PD62 1173 aa22.41■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 KIF18AQ8NI77 898 aa22.41■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 SMARCE1Q969G3 411 aa22.41■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.41■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 SARSP49591 514 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 PKN1Q16512 942 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 NARFQ9UHQ1 456 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 ATP1A3P13637 1013 aa22.39■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 TROAPQ12815 778 aa22.39■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.39■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.39■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 OXER1Q8TDS5 423 aa22.39■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 MAN1B1Q9UKM7 699 aa22.39■■□□□ 1.18
SPNS1-201ENST00000311008 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 CFAP100Q494V2 611 aa22.39■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF592Q92610 1267 aa22.39■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 SETDB2Q96T68 719 aa22.39■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 SPECC1Q5M775 1068 aa22.38■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.38■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 FERMT2Q96AC1 680 aa22.38■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.38■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 USP17L12C9JPN9 530 aa22.38■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 USP17L21D6R901 530 aa22.38■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 VSTM4Q8IW00 320 aa22.38■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF384Q8TF68 577 aa22.38■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 RPS6KA4O75676 772 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 MECOMQ03112 1051 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 MORC3Q14149 939 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 SBK1Q52WX2 424 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 FANCLQ9NW38 375 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 VPS54Q9P1Q0 977 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 MYH6P13533 1939 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 GRIN1Q05586 938 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 CSRNP2Q9H175 543 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 BMP6P22004 513 aa22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms