RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028157.8

Gtf3c5-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c5, Length 2,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Smim20D3Z7Q2 69 aa8.63□□□□□ -1.03
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vpreb3D3Z6J4 130 aa8.63□□□□□ -1.03
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm37389A0A0A6YW05 95 aa8.62□□□□□ -1.03
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fam104aA2A6P4 185 aa8.62□□□□□ -1.03
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ube2bP63147 152 aa8.62□□□□□ -1.03
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 U90926O08546 118 aa8.61□□□□□ -1.03
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fam19a3Q7TPG6 132 aa8.61□□□□□ -1.03
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Defa21Q8C1P2 93 aa8.6□□□□□ -1.03
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dnah9B1AR51 4484 aa8.6□□□□□ -1.03
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zcchc13Q9D548 170 aa8.6□□□□□ -1.03
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm10401E9Q3K6 71 aa8.59□□□□□ -1.03
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Defa28D3Z1V9 94 aa8.58□□□□□ -1.04
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm9507D3Z5T3 223 aa8.58□□□□□ -1.04
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nupr2Q497P3 102 aa8.57□□□□□ -1.04
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fras1Q80T14 4010 aa8.57□□□□□ -1.04
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 PrkdcP97313 4128 aa8.57□□□□□ -1.04
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 C130032M10RikQ8C888 123 aa8.57□□□□□ -1.04
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Phf5aP83870 110 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm17521F6QAC8 156 aa8.55□□□□□ -1.04
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 HrnrQ8VHD8 2496 aa8.55□□□□□ -1.04
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Wfdc13Q5DQQ6 81 aa8.55□□□□□ -1.04
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm44790A0A0N4SV91 103 aa8.54□□□□□ -1.04
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 1700018G05RikA0A1B0GSI2 66 aa8.54□□□□□ -1.04
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mrpl34Q99N91 92 aa8.53□□□□□ -1.04
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 PlecQ9QXS1 4691 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Plac8Q9JI48 112 aa8.53□□□□□ -1.04
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Igkv3-4A0A140T8Q4 119 aa8.52□□□□□ -1.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Scgb1b2O35176 93 aa8.52□□□□□ -1.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ndufc1Q9CQY9 76 aa8.52□□□□□ -1.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm10139O88245 57 aa8.51□□□□□ -1.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm9918Q8BUR5 174 aa8.51□□□□□ -1.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 B230307C23RikQ8BLB2 64 aa8.51□□□□□ -1.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 1700012A03RikQ9DAF1 130 aa8.5□□□□□ -1.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Prr15lQ8JZM2 100 aa8.49□□□□□ -1.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Defb9Q8R2I6 67 aa8.49□□□□□ -1.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 GhrhP16043 103 aa8.49□□□□□ -1.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Odf3bQ5M8M2 238 aa8.48□□□□□ -1.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Wfdc10Q3V2J9 124 aa8.47□□□□□ -1.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Q8BT88 171 aa8.47□□□□□ -1.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm37013Q8K491 104 aa8.47□□□□□ -1.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm12353A2AGJ4 60 aa8.47□□□□□ -1.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 BikO70337 150 aa8.47□□□□□ -1.05
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 FasnP19096 2504 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Igkv8-19A0A0G2JFN8 121 aa8.44□□□□□ -1.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm10570F6VB42 170 aa8.44□□□□□ -1.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 AI606181Q8C7B9 129 aa8.44□□□□□ -1.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 UqcrqQ9CQ69 82 aa8.44□□□□□ -1.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 6030445D17RikE9Q8F9 148 aa8.44□□□□□ -1.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Igkv3-7A0A0G2JE31 119 aa8.43□□□□□ -1.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm21886J3QJU9 214 aa8.43□□□□□ -1.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tmem258P61166 79 aa8.42□□□□□ -1.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ube2aQ9Z255 152 aa8.42□□□□□ -1.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm28230A0A0A0MQ91 144 aa8.41□□□□□ -1.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 FcgbpE9Q0B5 2583 aa8.41□□□□□ -1.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Igkv3-10A0A0G2JGN0 119 aa8.4□□□□□ -1.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm10065F6TJM2 114 aa8.4□□□□□ -1.06
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Spink8Q09TK9 105 aa8.39□□□□□ -1.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Krtap29-1A2A5X4 342 aa8.38□□□□□ -1.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm10642Q3TWM1 71 aa8.38□□□□□ -1.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm19935A0A1B0GSF9 52 aa8.38□□□□□ -1.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Chchd10Q7TNL9 138 aa8.38□□□□□ -1.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2310050C09RikG5E8Z3 280 aa8.37□□□□□ -1.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Defb11Q8R2I7 77 aa8.37□□□□□ -1.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Reg3aO09037 175 aa8.36□□□□□ -1.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm27235Q3UW50 83 aa8.36□□□□□ -1.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Igkv3-5A0A140T8M6 119 aa8.34□□□□□ -1.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dnah5Q8VHE6 4621 aa8.34□□□□□ -1.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 SnurfQ9WU12 71 aa8.33□□□□□ -1.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ly6g6cQ9Z1Q4 126 aa8.32□□□□□ -1.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rpl37aP61514 92 aa8.31□□□□□ -1.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rps28P62858 69 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Q8K1L6 76 aa8.31□□□□□ -1.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dnah7aE9Q0T8 4024 aa8.3□□□□□ -1.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Krtap10-4Q08EG8 221 aa8.3□□□□□ -1.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dnah7cA0A087WR13 4024 aa8.29□□□□□ -1.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Adm2Q7TNK8 150 aa8.29□□□□□ -1.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Samd13D3YUG0 102 aa8.29□□□□□ -1.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 1600014C23RikQ9DAX4 101 aa8.29□□□□□ -1.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 NbdyA0A0N4SUI7 68 aa8.26□□□□□ -1.09
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Brk1Q91VR8 75 aa8.24□□□□□ -1.09
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Anapc11Q9CPX9 84 aa8.24□□□□□ -1.09
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 A0A286YE49 62 aa8.23□□□□□ -1.09
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm20604F8WIA3 75 aa8.21□□□□□ -1.1
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Coa6Q8BGD8 79 aa8.21□□□□□ -1.1
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pet100P0DJE0 76 aa8.2□□□□□ -1.1
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gpr15lA0A0B4J1N3 78 aa8.2□□□□□ -1.1
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm2310J3QNJ2 377 aa8.2□□□□□ -1.1
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Defb12Q8K4N3 78 aa8.2□□□□□ -1.1
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Smlr1J3QMJ4 66 aa8.19□□□□□ -1.1
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 SvipQ3UZP4 77 aa8.19□□□□□ -1.1
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Krtap14O08640 167 aa8.19□□□□□ -1.1
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tnp2P11378 117 aa8.18□□□□□ -1.1
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Spint4Q9D263 159 aa8.18□□□□□ -1.1
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Serp1Q9Z1W5 66 aa8.17□□□□□ -1.1
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cypt14J3QPF7 87 aa8.16□□□□□ -1.1
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 1700074P13RikQ9D9G7 251 aa8.16□□□□□ -1.1
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Defb39Q70KL3 74 aa8.15□□□□□ -1.11
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Znf706Q9D115 76 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.11
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vps13dB1ART2 4390 aa8.13□□□□□ -1.11
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hectd4E9Q2E4 4418 aa8.13□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 106.8 ms