RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000107060.7

Eftud2-202, Transcript of 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Eftud2, Length 3,339 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2-202ENSMUST00000107060 BC048502Q80Y74 154 aa9.72□□□□□ -0.85
Eftud2-202ENSMUST00000107060 2310061N02RikQ9D6S9 174 aa9.72□□□□□ -0.85
Eftud2-202ENSMUST00000107060 BB014433Q8C5R5 389 aa9.72□□□□□ -0.85
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cd164Q9R0L9 197 aa9.71□□□□□ -0.86
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Defa20Q45VN2 95 aa9.71□□□□□ -0.86
Eftud2-202ENSMUST00000107060 B9d2Q3UK10 175 aa9.7□□□□□ -0.86
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm10308Q9CVR5 141 aa9.7□□□□□ -0.86
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igkv1-88A0A140T8N1 120 aa9.69□□□□□ -0.86
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Inafm2A0A1L1STD6 152 aa9.69□□□□□ -0.86
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Prr13Q9CQJ5 137 aa9.69□□□□□ -0.86
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ighv2-5A0A0A6YY69 116 aa9.69□□□□□ -0.86
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm3618D3Z4P5 127 aa9.68□□□□□ -0.86
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hist1h4aP62806 103 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
Eftud2-202ENSMUST00000107060 9530003J23RikQ8BM26 151 aa9.68□□□□□ -0.86
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cdk2ap2Q9CPY4 127 aa9.68□□□□□ -0.86
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm2916Q9D9B9 127 aa9.68□□□□□ -0.86
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Huwe1Q7TMY8 4377 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Smim29Q8R043 75 aa9.67□□□□□ -0.86
Eftud2-202ENSMUST00000107060 A730071L15RikQ8C4X0 137 aa9.67□□□□□ -0.86
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igkv3-12A0A140T8P0 119 aa9.67□□□□□ -0.86
Eftud2-202ENSMUST00000107060 E130218I03RikA0A0U1RNU5 63 aa9.66□□□□□ -0.86
Eftud2-202ENSMUST00000107060 P84750 121 aa9.66□□□□□ -0.86
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pou2af1Q64693 256 aa9.66□□□□□ -0.86
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Defa16P50714 93 aa9.66□□□□□ -0.86
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igkv8-21A0A140T8P7 120 aa9.65□□□□□ -0.86
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Wfdc6bF6ULY1 148 aa9.65□□□□□ -0.86
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Prol1E9PYQ4 312 aa9.65□□□□□ -0.86
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dmac1Q9CQ00 111 aa9.65□□□□□ -0.86
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ormdl1Q921I0 153 aa9.64□□□□□ -0.87
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fras1Q80T14 4010 aa9.64□□□□□ -0.87
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm17349F7BGH6 99 aa9.61□□□□□ -0.87
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lamtor3O88653 124 aa9.6□□□□□ -0.87
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pde6gP09174 87 aa9.6□□□□□ -0.87
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm10735Q3US96 136 aa9.6□□□□□ -0.87
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vpreb2P13373 142 aa9.6□□□□□ -0.87
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tmem254aP0DN89 123 aa9.59□□□□□ -0.87
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tmem254bP0DN90 123 aa9.59□□□□□ -0.87
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tmem254cP0DN91 123 aa9.59□□□□□ -0.87
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fam168bQ80XQ8 194 aa9.59□□□□□ -0.87
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igf1P05017 153 aa9.59□□□□□ -0.87
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Defb37Q7TMD2 62 aa9.59□□□□□ -0.87
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tenm2Q9WTS5 2764 aa9.58□□□□□ -0.88
Eftud2-202ENSMUST00000107060 BaalcQ8VHV1 145 aa9.57□□□□□ -0.88
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm4707V9GXN5 68 aa9.57□□□□□ -0.88
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rbm3O89086 153 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Megf8P60882 2789 aa9.57□□□□□ -0.88
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pcp4P63054 62 aa9.56□□□□□ -0.88
Eftud2-202ENSMUST00000107060 A930002H24RikQ8C8Y3 163 aa9.56□□□□□ -0.88
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ighv2-2A0A075B5P8 116 aa9.56□□□□□ -0.88
Eftud2-202ENSMUST00000107060 P01821 116 aa9.56□□□□□ -0.88
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Defa1P11477 93 aa9.56□□□□□ -0.88
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cystm1Q8K353 104 aa9.56□□□□□ -0.88
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm9508A0A1W2P7W0 230 aa9.56□□□□□ -0.88
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igkv8-28A0A0G2JE47 121 aa9.55□□□□□ -0.88
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Obox2E9PXV9 151 aa9.55□□□□□ -0.88
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Defb40Q70KL2 73 aa9.55□□□□□ -0.88
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igsf10Q3V1M1 2594 aa9.54□□□□□ -0.88
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dnah11E9Q7N9 4488 aa9.52□□□□□ -0.88
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fam104aA2A6P4 185 aa9.52□□□□□ -0.89
Eftud2-202ENSMUST00000107060 4930535I16RikQ9CUI2 172 aa9.52□□□□□ -0.89
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ubl5Q9EPV8 73 aa9.52□□□□□ -0.89
Eftud2-202ENSMUST00000107060 7530416G11RikJ3QJX6 159 aa9.51□□□□□ -0.89
Eftud2-202ENSMUST00000107060 U90926O08546 118 aa9.51□□□□□ -0.89
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zcchc13Q9D548 170 aa9.51□□□□□ -0.89
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Apoc4Q61268 124 aa9.5□□□□□ -0.89
Eftud2-202ENSMUST00000107060 SmcpP15265 143 aa9.5□□□□□ -0.89
Eftud2-202ENSMUST00000107060 A830005F24RikQ8BRT5 167 aa9.5□□□□□ -0.89
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm11011D3Z3L9 86 aa9.49□□□□□ -0.89
Eftud2-202ENSMUST00000107060 PrkdcP97313 4128 aa9.49□□□□□ -0.89
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tmem243B2RVB9 118 aa9.49□□□□□ -0.89
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dnah9B1AR51 4484 aa9.49□□□□□ -0.89
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Muc6Q80T03 2850 aa9.49□□□□□ -0.89
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igkv1-122A0A140T8M9 119 aa9.48□□□□□ -0.89
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fam19a1Q7TPG8 133 aa9.48□□□□□ -0.89
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fam19a5Q91WE9 132 aa9.48□□□□□ -0.89
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sprr2jO70561 109 aa9.46□□□□□ -0.89
Eftud2-202ENSMUST00000107060 PlecQ9QXS1 4691 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Defa4P28311 92 aa9.46□□□□□ -0.9
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cox6a2P43023 97 aa9.46□□□□□ -0.9
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vpreb1P13372 142 aa9.45□□□□□ -0.9
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm28539A0A087WSL9 92 aa9.45□□□□□ -0.9
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igkv1-110A0A0B4J1I0 119 aa9.44□□□□□ -0.9
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm10837Q3UTT8 145 aa9.44□□□□□ -0.9
Eftud2-202ENSMUST00000107060 TgO08710 2766 aa9.44□□□□□ -0.9
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm17689B3GLJ4 109 aa9.43□□□□□ -0.9
Eftud2-202ENSMUST00000107060 P06320 134 aa9.43□□□□□ -0.9
Eftud2-202ENSMUST00000107060 SycnQ8VCK7 134 aa9.43□□□□□ -0.9
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igkv3-2A0A075B5P0 119 aa9.42□□□□□ -0.9
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vpreb3D3Z6J4 130 aa9.42□□□□□ -0.9
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sfta2E9PXB6 77 aa9.41□□□□□ -0.9
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Defa25Q5G864 92 aa9.41□□□□□ -0.9
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm37013Q8K491 104 aa9.41□□□□□ -0.9
Eftud2-202ENSMUST00000107060 A0A286YE02 88 aa9.41□□□□□ -0.9
Eftud2-202ENSMUST00000107060 MplkipQ9D011 178 aa9.41□□□□□ -0.9
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm9918Q8BUR5 174 aa9.4□□□□□ -0.9
Eftud2-202ENSMUST00000107060 A330070K13RikQ8CA53 115 aa9.4□□□□□ -0.9
Eftud2-202ENSMUST00000107060 PscaP57096 123 aa9.4□□□□□ -0.9
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Serp2Q6TAW2 65 aa9.4□□□□□ -0.9
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm10139O88245 57 aa9.39□□□□□ -0.91
Eftud2-202ENSMUST00000107060 4930518I15RikQ3V2W7 57 aa9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 75.8 ms