RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000059272.9

Hoxd9-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd9, Length 2,136 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm17577J3QNF7 156 aa15.18■□□□□ 0.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fras1Q80T14 4010 aa15.17■□□□□ 0.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Anapc13Q8R034 74 aa15.17■□□□□ 0.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Atp5eP56382 52 aa15.16■□□□□ 0.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ly6g6cQ9Z1Q4 126 aa15.16■□□□□ 0.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 BC048502Q80Y74 154 aa15.16■□□□□ 0.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 A0A286YCN5 57 aa15.14■□□□□ 0.01
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm10320E9PW43 113 aa15.14■□□□□ 0.01
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cdk2ap2Q9CPY4 127 aa15.14■□□□□ 0.01
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 PlecQ9QXS1 4691 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Igkv4-58A0A0G2JGI6 119 aa15.11■□□□□ 0.01
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2310034G01RikA0A286YDL3 209 aa15.11■□□□□ 0.01
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2310050C09RikG5E8Z3 280 aa15.11■□□□□ 0.01
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ighv10-3A0A075B5T6 119 aa15.1■□□□□ 0.01
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Defa20Q45VN2 95 aa15.1■□□□□ 0.01
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm7102J3QQ10 178 aa15.1■□□□□ 0.01
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 OxtP35454 125 aa15.09■□□□□ 0.01
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Igkv2-109A0A075B5K6 120 aa15.08■□□□□ 0
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sprr1aQ62266 144 aa15.07■□□□□ 0
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Igkv1-88A0A140T8N1 120 aa15.06■□□□□ 0
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm11627A6PWP4 55 aa15.06■□□□□ 0
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Elof1P60003 83 aa15.05■□□□□ 0
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Msrb1Q9JLC3 116 aa15.05■□□□□ 0
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Igkv8-26A0A075B5N5 123 aa15.05■□□□□ -0
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 E130218I03RikA0A0U1RNU5 63 aa15.04■□□□□ -0
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm7276Q3TYW4 209 aa15.04■□□□□ -0
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Inafm2A0A1L1STD6 152 aa15.02□□□□□ -0.01
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Q9DAA7 145 aa15.02□□□□□ -0.01
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Igkv3-12A0A140T8P0 119 aa14.99□□□□□ -0.01
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cd164Q9R0L9 197 aa14.99□□□□□ -0.01
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm10735Q3US96 136 aa14.98□□□□□ -0.01
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 4930519P11RikQ9CUJ8 166 aa14.97□□□□□ -0.01
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 9530003J23RikQ8BM26 151 aa14.96□□□□□ -0.01
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 BB014433Q8C5R5 389 aa14.96□□□□□ -0.01
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Igkv8-27A0A0G2JF28 120 aa14.95□□□□□ -0.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Igkv8-30A0A140T8M3 121 aa14.95□□□□□ -0.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Defa16P50714 93 aa14.95□□□□□ -0.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dnah7aE9Q0T8 4024 aa14.94□□□□□ -0.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Defa1P11477 93 aa14.94□□□□□ -0.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Wfdc6bF6ULY1 148 aa14.93□□□□□ -0.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Lamtor3O88653 124 aa14.93□□□□□ -0.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ntn5Q3UQ22 452 aa14.93□□□□□ -0.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Prol1E9PYQ4 312 aa14.92□□□□□ -0.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pou2af1Q64693 256 aa14.92□□□□□ -0.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ormdl1Q921I0 153 aa14.92□□□□□ -0.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dmac1Q9CQ00 111 aa14.92□□□□□ -0.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ighv2-5A0A0A6YY69 116 aa14.91□□□□□ -0.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pde6gP09174 87 aa14.9□□□□□ -0.02
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nupr2Q497P3 102 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 P84750 121 aa14.87□□□□□ -0.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 BaalcQ8VHV1 145 aa14.87□□□□□ -0.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm10308Q9CVR5 141 aa14.87□□□□□ -0.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Obox2E9PXV9 151 aa14.86□□□□□ -0.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Smim29Q8R043 75 aa14.86□□□□□ -0.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dnah9B1AR51 4484 aa14.86□□□□□ -0.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dnah11E9Q7N9 4488 aa14.85□□□□□ -0.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Defb40Q70KL2 73 aa14.85□□□□□ -0.03
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 U90926O08546 118 aa14.83□□□□□ -0.04
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rbm3O89086 153 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tmem254aP0DN89 123 aa14.83□□□□□ -0.04
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tmem254bP0DN90 123 aa14.83□□□□□ -0.04
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tmem254cP0DN91 123 aa14.83□□□□□ -0.04
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fam168bQ80XQ8 194 aa14.8□□□□□ -0.04
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Igkv8-21A0A140T8P7 120 aa14.8□□□□□ -0.04
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Defb37Q7TMD2 62 aa14.78□□□□□ -0.04
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ubl5Q9EPV8 73 aa14.78□□□□□ -0.04
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Plac8Q9JI48 112 aa14.78□□□□□ -0.04
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Igkv3-2A0A075B5P0 119 aa14.78□□□□□ -0.04
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 A730071L15RikQ8C4X0 137 aa14.78□□□□□ -0.04
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Igf1P05017 153 aa14.77□□□□□ -0.04
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fam19a1Q7TPG8 133 aa14.77□□□□□ -0.05
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Igkv1-122A0A140T8M9 119 aa14.75□□□□□ -0.05
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Defa4P28311 92 aa14.75□□□□□ -0.05
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Hist1h4aP62806 103 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Krtap10-4Q08EG8 221 aa14.75□□□□□ -0.05
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 TgO08710 2766 aa14.75□□□□□ -0.05
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tmem243B2RVB9 118 aa14.74□□□□□ -0.05
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 A930002H24RikQ8C8Y3 163 aa14.74□□□□□ -0.05
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Vpreb2P13373 142 aa14.74□□□□□ -0.05
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm10837Q3UTT8 145 aa14.74□□□□□ -0.05
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dnah7cA0A087WR13 4024 aa14.73□□□□□ -0.05
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm11011D3Z3L9 86 aa14.73□□□□□ -0.05
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ighv2-2A0A075B5P8 116 aa14.72□□□□□ -0.05
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 P01821 116 aa14.72□□□□□ -0.05
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fam19a5Q91WE9 132 aa14.72□□□□□ -0.05
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Krtap10-10A0A1W2P7T6 217 aa14.71□□□□□ -0.05
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 PscaP57096 123 aa14.71□□□□□ -0.05
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Prr13Q9CQJ5 137 aa14.71□□□□□ -0.06
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sfta2E9PXB6 77 aa14.69□□□□□ -0.06
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 SycnQ8VCK7 134 aa14.69□□□□□ -0.06
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Igkv8-28A0A0G2JE47 121 aa14.69□□□□□ -0.06
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fam104aA2A6P4 185 aa14.69□□□□□ -0.06
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zcchc13Q9D548 170 aa14.69□□□□□ -0.06
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 A830005F24RikQ8BRT5 167 aa14.68□□□□□ -0.06
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 4930535I16RikQ9CUI2 172 aa14.68□□□□□ -0.06
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 SvipQ3UZP4 77 aa14.66□□□□□ -0.06
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Vps13dB1ART2 4390 aa14.66□□□□□ -0.06
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sprr2jO70561 109 aa14.65□□□□□ -0.06
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 A0A286YE02 88 aa14.63□□□□□ -0.07
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 PkigO70139 76 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 48.4 ms