RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047904.3

Hoxd4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Hoxd4, Length 2,560 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm9767G3X930 207 aa11.76□□□□□ -0.53
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Sprr1bQ62267 153 aa11.76□□□□□ -0.53
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 E130218I03RikA0A0U1RNU5 63 aa11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm7075D3Z497 112 aa11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Igkv8-34A0A0G2JDU0 121 aa11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 AI606181Q8C7B9 129 aa11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Brwd1Q921C3 2304 aa11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Chchd7Q8K2Q5 85 aa11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Hivep3A2A884 2348 aa11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2010109I03RikQ9CQ11 111 aa11.73□□□□□ -0.53
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm7257D3YX25 99 aa11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm11011D3Z3L9 86 aa11.72□□□□□ -0.53
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 CicQ924A2 2510 aa11.71□□□□□ -0.54
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm43218A0A0G2JGT0 114 aa11.7□□□□□ -0.54
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm9805F6YK59 57 aa11.7□□□□□ -0.54
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Erdr1J3QMM0 206 aa11.7□□□□□ -0.54
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cox7bP56393 80 aa11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm5617Q91VN2 117 aa11.69□□□□□ -0.54
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Msrb1Q9JLC3 116 aa11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Dad1P61804 113 aa11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 4933415A04RikQ9D443 101 aa11.68□□□□□ -0.54
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Krtap24-1G3X9A2 248 aa11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm10518F6UQQ9 182 aa11.67□□□□□ -0.54
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tex15F8VPN2 2785 aa11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Igkv8-28A0A0G2JE47 121 aa11.66□□□□□ -0.54
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tenm1Q9WTS4 2731 aa11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ly6c2P0CW03 131 aa11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Lyrm9Q3UN90 78 aa11.65□□□□□ -0.54
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Wfdc12Q9JHY3 85 aa11.65□□□□□ -0.55
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Prh1P05142 261 aa11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm10770F7D043 238 aa11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Prr15lQ8JZM2 100 aa11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 AtrQ9JKK8 2635 aa11.64□□□□□ -0.55
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm16181B0V2H2 73 aa11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Coa6Q8BGD8 79 aa11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Sox16Q62247 57 aa11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Pla2g1bQ9Z0Y2 146 aa11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Nbeal2Q6ZQA0 2742 aa11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Spink4O35679 86 aa11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 A330070K13RikQ8CA53 115 aa11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Igkv8-16A0A0G2JDG9 121 aa11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Trav14-1A0A0G2JF94 121 aa11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 9230102O04RikA2ASX7 82 aa11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Reg3dQ9QUS9 175 aa11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Igkv8-24A0A140T8P5 121 aa11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 6430550D23RikE9Q1X6 194 aa11.6□□□□□ -0.55
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 FlnbQ80X90 2602 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Itpr2Q9Z329 2701 aa11.57□□□□□ -0.56
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Sfta2E9PXB6 77 aa11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm10160F6Y577 67 aa11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Klk9Q32M27 251 aa11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Defb12Q8K4N3 78 aa11.56□□□□□ -0.56
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Hivep1Q03172 2688 aa11.55□□□□□ -0.56
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Tcl1b5P56845 121 aa11.54□□□□□ -0.56
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Atox1O08997 68 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Defb37Q7TMD2 62 aa11.53□□□□□ -0.56
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Psors1c2Q80ZC9 134 aa11.53□□□□□ -0.56
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 AY074887Q8R5F9 132 aa11.53□□□□□ -0.56
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Coa5Q99M07 74 aa11.53□□□□□ -0.56
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Fam104aA2A6P4 185 aa11.52□□□□□ -0.56
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Igkv3-2A0A075B5P0 119 aa11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Sprr2jO70561 109 aa11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Stab1Q8R4Y4 2571 aa11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Igkv1-88A0A140T8N1 120 aa11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Igkv8-19A0A0G2JFN8 121 aa11.47□□□□□ -0.57
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Igkv4-61A0A0G2JH00 117 aa11.46□□□□□ -0.57
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Elof1P60003 83 aa11.46□□□□□ -0.57
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 9530053A07RikE9PVG8 2581 aa11.46□□□□□ -0.58
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm17509Q9CZ61 145 aa11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Igkv4-54A0A0G2JES9 117 aa11.45□□□□□ -0.58
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 PrcdQ00LT2 53 aa11.44□□□□□ -0.58
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 1700042G07RikB1AUF7 90 aa11.43□□□□□ -0.58
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Nsd1O88491 2588 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Igkv3-9A0A140T8P4 119 aa11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Krtap11-1E9Q2E9 183 aa11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 C130032M10RikQ8C888 123 aa11.42□□□□□ -0.58
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Phxr4P15974 95 aa11.39□□□□□ -0.59
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm7138L7N2C3 230 aa11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm3238W4VSP7 230 aa11.38□□□□□ -0.59
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Leap2Q91V13 76 aa11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm26620Q9CY65 116 aa11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Igkv4-92A0A0B4J1I2 117 aa11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 A0A286YCN5 57 aa11.36□□□□□ -0.59
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Srrm2Q8BTI8 2703 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Igkv1-122A0A140T8M9 119 aa11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Ube2bP63147 152 aa11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 PolqQ8CGS6 2544 aa11.35□□□□□ -0.59
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 BC048502Q80Y74 154 aa11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Fn1P11276 2477 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm17577J3QNF7 156 aa11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Notch2O35516 2470 aa11.34□□□□□ -0.59
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Mrpl34Q99N91 92 aa11.33□□□□□ -0.6
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm10643Q3URG9 111 aa11.32□□□□□ -0.6
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Cox6a2P43023 97 aa11.31□□□□□ -0.6
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 D730001G18RikA0A087WQU7 115 aa11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm7276Q3TYW4 209 aa11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Notch1Q01705 2531 aa11.3□□□□□ -0.6
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 A0A286YE02 88 aa11.29□□□□□ -0.6
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 ApcQ61315 2845 aa11.29□□□□□ -0.6
Hoxd4-201ENSMUST00000047904 Gm10837Q3UTT8 145 aa11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 54.4 ms