RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000023054.13

Apobec3-201, Transcript of DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Apobec3, Length 1,842 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3-201ENSMUST00000023054 1700011M02RikB1AX35 88 aa6.4□□□□□ -1.38
Apobec3-201ENSMUST00000023054 P84750 121 aa6.4□□□□□ -1.38
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Cox6cQ9CPQ1 76 aa6.4□□□□□ -1.38
Apobec3-201ENSMUST00000023054 PolqQ8CGS6 2544 aa6.4□□□□□ -1.39
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Nsd1O88491 2588 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Lst1O08843 95 aa6.39□□□□□ -1.39
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Tcl1b5P56845 121 aa6.39□□□□□ -1.39
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm11020F6ZGD5 61 aa6.39□□□□□ -1.39
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm7138L7N2C3 230 aa6.39□□□□□ -1.39
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm10767Q3TQP0 103 aa6.39□□□□□ -1.39
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Defb50Q6TU36 73 aa6.39□□□□□ -1.39
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Prss58Q8BW11 241 aa6.39□□□□□ -1.39
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm3238W4VSP7 230 aa6.39□□□□□ -1.39
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm29423A0A087WRM1 55 aa6.38□□□□□ -1.39
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm36176A0A1W2P8D5 158 aa6.38□□□□□ -1.39
Apobec3-201ENSMUST00000023054 MalO09198 153 aa6.38□□□□□ -1.39
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Tcl1b3P56842 122 aa6.38□□□□□ -1.39
Apobec3-201ENSMUST00000023054 SpinklQ8CEK3 90 aa6.38□□□□□ -1.39
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Srrm2Q8BTI8 2703 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Sslp1Q3UN54 99 aa6.37□□□□□ -1.39
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm10549Q3URY4 149 aa6.37□□□□□ -1.39
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Phpt1Q9DAK9 124 aa6.37□□□□□ -1.39
Apobec3-201ENSMUST00000023054 AW011738F6S7Q2 159 aa6.36□□□□□ -1.39
Apobec3-201ENSMUST00000023054 P01755 137 aa6.36□□□□□ -1.39
Apobec3-201ENSMUST00000023054 E130208F15RikQ3UPV3 143 aa6.36□□□□□ -1.39
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Snhg11Q4G0K9 87 aa6.36□□□□□ -1.39
Apobec3-201ENSMUST00000023054 ApcQ61315 2845 aa6.36□□□□□ -1.39
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Reg3bP35230 175 aa6.36□□□□□ -1.39
Apobec3-201ENSMUST00000023054 SelenowP63300 88 aa6.36□□□□□ -1.39
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Sostdc1Q9CQN4 206 aa6.36□□□□□ -1.39
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Pfn2Q9JJV2 140 aa6.36□□□□□ -1.39
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Prh1P05142 261 aa6.35□□□□□ -1.39
Apobec3-201ENSMUST00000023054 EnhoQ8K1D8 76 aa6.35□□□□□ -1.39
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Bles03Q8VD62 251 aa6.35□□□□□ -1.39
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ighv2-9A0A075B5Q5 116 aa6.34□□□□□ -1.39
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Trav13-1A0A075B644 110 aa6.34□□□□□ -1.39
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Zc2hc1bQ9D534 172 aa6.34□□□□□ -1.39
Apobec3-201ENSMUST00000023054 AplnQ9R0R4 77 aa6.34□□□□□ -1.39
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ighv1-56A0A0A6YXG2 117 aa6.34□□□□□ -1.4
Apobec3-201ENSMUST00000023054 B230359F08RikA0A0B4J1K3 109 aa6.34□□□□□ -1.4
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Igkv8-24A0A140T8P5 121 aa6.34□□□□□ -1.4
Apobec3-201ENSMUST00000023054 ScxQ64124 207 aa6.34□□□□□ -1.4
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ndufa12Q7TMF3 145 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
Apobec3-201ENSMUST00000023054 2010109I03RikQ9CQ11 111 aa6.34□□□□□ -1.4
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ly6hQ9WUC3 139 aa6.34□□□□□ -1.4
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm10647E9Q8X0 124 aa6.33□□□□□ -1.4
Apobec3-201ENSMUST00000023054 B9d2Q3UK10 175 aa6.33□□□□□ -1.4
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm9903Q8C9Y8 129 aa6.33□□□□□ -1.4
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm4707V9GXN5 68 aa6.32□□□□□ -1.4
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm11213A0A1B0GR83 88 aa6.32□□□□□ -1.4
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Rpl28P41105 137 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
Apobec3-201ENSMUST00000023054 4930556J24RikQ9D4U7 146 aa6.32□□□□□ -1.4
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ighv13-2A0A0A6YWN3 119 aa6.31□□□□□ -1.4
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Krtap11-1E9Q2E9 183 aa6.31□□□□□ -1.4
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Dnal4Q9DCM4 105 aa6.31□□□□□ -1.4
Apobec3-201ENSMUST00000023054 PtprqP0C5E4 2300 aa6.3□□□□□ -1.4
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Defa1P11477 93 aa6.3□□□□□ -1.4
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Defa2P28309 93 aa6.3□□□□□ -1.4
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm5617Q91VN2 117 aa6.3□□□□□ -1.4
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Cox7b2Q9D2H1 82 aa6.3□□□□□ -1.4
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm16381A0A1Y7VKT9 73 aa6.29□□□□□ -1.4
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Hist1h4aP62806 103 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Pglyrp4Q0VB07 374 aa6.29□□□□□ -1.4
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Smim26Q3V460 107 aa6.29□□□□□ -1.4
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Defa25Q5G864 92 aa6.29□□□□□ -1.4
Apobec3-201ENSMUST00000023054 TeppQ6IMH0 216 aa6.29□□□□□ -1.4
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Igkv8-16A0A0G2JDG9 121 aa6.29□□□□□ -1.4
Apobec3-201ENSMUST00000023054 9430015G10RikA2ASP7 199 aa6.29□□□□□ -1.4
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Defa16P50714 93 aa6.29□□□□□ -1.4
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Rps28P62858 69 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Eif4ebp3Q80VV3 101 aa6.29□□□□□ -1.4
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Col6a5A6H584 2640 aa6.28□□□□□ -1.4
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Trav14d-3-dv8A0A075B619 120 aa6.28□□□□□ -1.4
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm28374F6SG70 93 aa6.28□□□□□ -1.4
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm7137J3QMW1 236 aa6.28□□□□□ -1.4
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm17509Q9CZ61 145 aa6.28□□□□□ -1.4
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Mrpl52Q9D0Y8 121 aa6.28□□□□□ -1.4
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Igkv8-18A0A0B4J1J3 123 aa6.27□□□□□ -1.41
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Hbb-b2P02089 147 aa6.27□□□□□ -1.41
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Igkv1-117A0A140T8M0 119 aa6.27□□□□□ -1.41
Apobec3-201ENSMUST00000023054 C530025M09RikF6RGA8 229 aa6.27□□□□□ -1.41
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm10518F6UQQ9 182 aa6.27□□□□□ -1.41
Apobec3-201ENSMUST00000023054 P01819 144 aa6.27□□□□□ -1.41
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Kmt2aP55200 3966 aa6.27□□□□□ -1.41
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Trav13-2A0A075B649 110 aa6.26□□□□□ -1.41
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Igkv4-92A0A0B4J1I2 117 aa6.26□□□□□ -1.41
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Xcl1P47993 114 aa6.26□□□□□ -1.41
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Acyp1P56376 99 aa6.26□□□□□ -1.41
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Cox7bP56393 80 aa6.26□□□□□ -1.41
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Reg3dQ9QUS9 175 aa6.26□□□□□ -1.41
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Igf1P05017 153 aa6.25□□□□□ -1.41
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ube2d4D3YUH6 135 aa6.24□□□□□ -1.41
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm5153P01627 120 aa6.24□□□□□ -1.41
Apobec3-201ENSMUST00000023054 MifP34884 115 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm16485Q8C4B7 115 aa6.24□□□□□ -1.41
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Camk2n2Q78WH7 79 aa6.23□□□□□ -1.41
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Defb29Q8BGW9 78 aa6.23□□□□□ -1.41
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Notch1Q01705 2531 aa6.23□□□□□ -1.41
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Trav14-1A0A0G2JF94 121 aa6.22□□□□□ -1.41
Apobec3-201ENSMUST00000023054 7530416G11RikJ3QJX6 159 aa6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 41.7 ms