RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000074721.5

Hoxd8-202, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ighv2-9A0A075B5Q5 116 aa20.18■□□□□ 0.82
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Scgb1b10A0A087WPW0 93 aa20.17■□□□□ 0.82
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm10604Q3V0X7 143 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Cks1brtQ3UNC9 96 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ndufc2Q9CQ54 120 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Bsph2Q0Q236 131 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 BaalcQ8VHV1 145 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Tmem238A9JSM3 176 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Defb40Q70KL2 73 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm5868Q8BJG1 145 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm20730A0A075B5J6 119 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm42674D3YUT9 64 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Trappc1Q5NCF2 145 aa20.11■□□□□ 0.81
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Plac8Q9JI48 112 aa20.11■□□□□ 0.81
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ighv1-56A0A0A6YXG2 117 aa20.1■□□□□ 0.81
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Wfdc3Q14AE4 130 aa20.1■□□□□ 0.81
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm5148Q8BGG2 154 aa20.1■□□□□ 0.81
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 PpdpfQ9CR37 115 aa20.09■□□□□ 0.81
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Igkv3-12A0A140T8P0 119 aa20.07■□□□□ 0.8
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 AponG3X9D6 251 aa20.07■□□□□ 0.8
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Defb50Q6TU36 73 aa20.07■□□□□ 0.8
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Igkv4-92A0A0B4J1I2 117 aa20.06■□□□□ 0.8
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 SrarpQ3ULG3 163 aa20.06■□□□□ 0.8
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 P0C913 63 aa20.04■□□□□ 0.8
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 CnbpP53996 178 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Dnah2P0C6F1 4456 aa20.04■□□□□ 0.8
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm9242J3QNY1 357 aa20.03■□□□□ 0.8
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Defa9P50707 93 aa20.03■□□□□ 0.8
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Hnrnpa3Q8BG05 379 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Igkv8-24A0A140T8P5 121 aa20.03■□□□□ 0.8
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ube2wQ8VDW4 151 aa20.03■□□□□ 0.8
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ryr3A2AGL3 4863 aa20.02■□□□□ 0.8
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 CrxO54751 299 aa20.02■□□□□ 0.8
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Tmem86bQ497J1 226 aa20.01■□□□□ 0.79
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Tspo2Q9CRZ8 162 aa20.01■□□□□ 0.79
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gnb1lQ9EQ15 326 aa20■□□□□ 0.79
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 PscaP57096 123 aa20■□□□□ 0.79
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Plac1Q9JI83 173 aa19.99■□□□□ 0.79
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Hsbp1l1B2RXB2 72 aa19.98■□□□□ 0.79
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 P01755 137 aa19.98■□□□□ 0.79
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Prelid3aQ8VE85 172 aa19.98■□□□□ 0.79
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Cks1bP61025 79 aa19.98■□□□□ 0.79
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 A730009L09RikA0A1B0GS82 72 aa19.97■□□□□ 0.79
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Rmi2Q3UPE3 149 aa19.97■□□□□ 0.79
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 4930432M17RikQ3V0W9 174 aa19.97■□□□□ 0.79
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Cox7b2Q9D2H1 82 aa19.96■□□□□ 0.79
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Iglc1A0A0G2JE99 106 aa19.95■□□□□ 0.78
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Isg15Q64339 161 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 4930519P11RikQ9CUJ8 166 aa19.95■□□□□ 0.78
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm44965A0A0N4SVR3 59 aa19.95■□□□□ 0.78
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Hbb-bsA8DUK4 147 aa19.95■□□□□ 0.78
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Hbb-b1P02088 147 aa19.95■□□□□ 0.78
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm10837Q3UTT8 145 aa19.95■□□□□ 0.78
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Sprr4Q8CGN8 76 aa19.95■□□□□ 0.78
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ryr2E9Q401 4966 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Pkd1O08852 4293 aa19.94■□□□□ 0.78
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Scgb1b15A0A087WP50 93 aa19.94■□□□□ 0.78
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 C530025M09RikF6RGA8 229 aa19.94■□□□□ 0.78
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Hrct1Q9D6B9 109 aa19.94■□□□□ 0.78
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Lect2O88803 151 aa19.92■□□□□ 0.78
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm35549A0A0N4SUS7 141 aa19.91■□□□□ 0.78
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Scgb1b19F6WYW0 93 aa19.9■□□□□ 0.78
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 B230359F08RikA0A0B4J1K3 109 aa19.89■□□□□ 0.77
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Defa10P50708 93 aa19.89■□□□□ 0.77
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Hist2h2beQ64524 126 aa19.89■□□□□ 0.77
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Cox8cA6H666 72 aa19.88■□□□□ 0.77
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Sprr1aQ62266 144 aa19.88■□□□□ 0.77
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm10295Q8CCF3 114 aa19.88■□□□□ 0.77
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ssbp1Q9CYR0 152 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm28374F6SG70 93 aa19.87■□□□□ 0.77
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm45753A0A1C7CYU8 86 aa19.86■□□□□ 0.77
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Trav9d-4A0A0G2JG37 103 aa19.85■□□□□ 0.77
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 4930442H23RikQ9D5G7 103 aa19.85■□□□□ 0.77
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Morn5Q9DAI9 170 aa19.85■□□□□ 0.77
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Trav4n-4A0A075B615 110 aa19.84■□□□□ 0.77
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Camk2n2Q78WH7 79 aa19.84■□□□□ 0.77
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 BB014433Q8C5R5 389 aa19.83■□□□□ 0.77
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Erg28Q9ERY9 140 aa19.83■□□□□ 0.77
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Triap1Q9D8Z2 76 aa19.83■□□□□ 0.76
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm6812B1AXU1 112 aa19.82■□□□□ 0.76
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm26727M0QWT1 121 aa19.82■□□□□ 0.76
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm10735Q3US96 136 aa19.82■□□□□ 0.76
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 4930544G11RikQ9CR99 193 aa19.82■□□□□ 0.76
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Trav4-3A0A0B4J1K1 110 aa19.81■□□□□ 0.76
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Smim1P0C8K7 78 aa19.81■□□□□ 0.76
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Dppa2Q9CWH0 301 aa19.81■□□□□ 0.76
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm2696A0A1W2P709 240 aa19.8■□□□□ 0.76
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Dpm2Q9Z324 84 aa19.8■□□□□ 0.76
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 9430015G10RikA2ASP7 199 aa19.8■□□□□ 0.76
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 A0A286YCN5 57 aa19.79■□□□□ 0.76
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm867A0A1W2P7T4 151 aa19.78■□□□□ 0.76
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ccl17F6R5P4 103 aa19.78■□□□□ 0.76
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 2310009B15RikA0A0A6YWI4 143 aa19.78■□□□□ 0.76
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Plscr4P58196 326 aa19.78■□□□□ 0.76
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Mzt1Q8BUR9 78 aa19.78■□□□□ 0.76
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Igkv3-2A0A075B5P0 119 aa19.74■□□□□ 0.75
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1700011M02RikB1AX35 88 aa19.73■□□□□ 0.75
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Trav14-1A0A0G2JF94 121 aa19.72■□□□□ 0.75
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm17577J3QNF7 156 aa19.72■□□□□ 0.75
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Defb45Q3V490 66 aa19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 100.9 ms