RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Triap1Q9D8Z2 76 aa8.02□□□□□ -1.12
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem238A9JSM3 176 aa8.02□□□□□ -1.13
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem86bQ497J1 226 aa8.02□□□□□ -1.13
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm10295Q8CCF3 114 aa8.02□□□□□ -1.13
Herc3-201ENSMUST00000031823 BC107364E9Q5A2 140 aa8.01□□□□□ -1.13
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tal2Q62282 108 aa8.01□□□□□ -1.13
Herc3-201ENSMUST00000031823 E130208F15RikQ3UPV3 143 aa8.01□□□□□ -1.13
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trav9d-4A0A0G2JG37 103 aa8.01□□□□□ -1.13
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm11020F6ZGD5 61 aa8.01□□□□□ -1.13
Herc3-201ENSMUST00000031823 Isg15Q64339 161 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
Herc3-201ENSMUST00000031823 PpdpfQ9CR37 115 aa8□□□□□ -1.13
Herc3-201ENSMUST00000031823 Igkv8-24A0A140T8P5 121 aa8□□□□□ -1.13
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn1r197Q8R265 298 aa8□□□□□ -1.13
Herc3-201ENSMUST00000031823 C920008G01RikA0A0B4J1N1 112 aa7.99□□□□□ -1.13
Herc3-201ENSMUST00000031823 SpinklQ8CEK3 90 aa7.99□□□□□ -1.13
Herc3-201ENSMUST00000031823 EnhoQ8K1D8 76 aa7.99□□□□□ -1.13
Herc3-201ENSMUST00000031823 4930442H23RikQ9D5G7 103 aa7.99□□□□□ -1.13
Herc3-201ENSMUST00000031823 Morn5Q9DAI9 170 aa7.99□□□□□ -1.13
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ighv2-9-1A0A075B697 116 aa7.98□□□□□ -1.13
Herc3-201ENSMUST00000031823 Smim1P0C8K7 78 aa7.98□□□□□ -1.13
Herc3-201ENSMUST00000031823 Defa15P50713 93 aa7.98□□□□□ -1.13
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pfn2Q9JJV2 140 aa7.98□□□□□ -1.13
Herc3-201ENSMUST00000031823 Iglc1A0A0G2JE99 106 aa7.97□□□□□ -1.13
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mzt1Q8BUR9 78 aa7.97□□□□□ -1.13
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fgf23Q9EPC2 251 aa7.97□□□□□ -1.13
Herc3-201ENSMUST00000031823 B230359F08RikA0A0B4J1K3 109 aa7.96□□□□□ -1.13
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ighv1-61P01749 117 aa7.96□□□□□ -1.13
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tenm2Q9WTS5 2764 aa7.96□□□□□ -1.14
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfand2aQ9JII7 171 aa7.96□□□□□ -1.14
Herc3-201ENSMUST00000031823 AW011738F6S7Q2 159 aa7.96□□□□□ -1.14
Herc3-201ENSMUST00000031823 Krtap11-1E9Q2E9 183 aa7.95□□□□□ -1.14
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rpl24Q8BP67 157 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm16485Q8C4B7 115 aa7.95□□□□□ -1.14
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm10251J3QPM5 127 aa7.95□□□□□ -1.14
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gatd1Q8BFQ8 220 aa7.95□□□□□ -1.14
Herc3-201ENSMUST00000031823 TnxbO35452 4006 aa7.94□□□□□ -1.14
Herc3-201ENSMUST00000031823 P01755 137 aa7.94□□□□□ -1.14
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dnah6E9Q0B6 4144 aa7.94□□□□□ -1.14
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gemin7Q9CWY4 129 aa7.94□□□□□ -1.14
Herc3-201ENSMUST00000031823 S100a8P27005 89 aa7.94□□□□□ -1.14
Herc3-201ENSMUST00000031823 4930432M17RikQ3V0W9 174 aa7.94□□□□□ -1.14
Herc3-201ENSMUST00000031823 Defa13P50711 93 aa7.93□□□□□ -1.14
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rab37Q9JKM7 223 aa7.93□□□□□ -1.14
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trav4-3A0A0B4J1K1 110 aa7.93□□□□□ -1.14
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tspan13Q9D8C2 204 aa7.92□□□□□ -1.14
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slamf6Q9ET39 351 aa7.92□□□□□ -1.14
Herc3-201ENSMUST00000031823 4930415O20RikQ8CDT5 131 aa7.92□□□□□ -1.14
Herc3-201ENSMUST00000031823 Igkv8-16A0A0G2JDG9 121 aa7.91□□□□□ -1.14
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ube2wQ8VDW4 151 aa7.91□□□□□ -1.14
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ly6g6cQ9Z1Q4 126 aa7.91□□□□□ -1.14
Herc3-201ENSMUST00000031823 Glrp1E9Q9S8 174 aa7.91□□□□□ -1.14
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cops9Q3U898 57 aa7.91□□□□□ -1.14
Herc3-201ENSMUST00000031823 Try10Q792Z1 246 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
Herc3-201ENSMUST00000031823 1700010B08RikQ9DAI7 102 aa7.91□□□□□ -1.14
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sprr1bQ62267 153 aa7.9□□□□□ -1.14
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trav13-2A0A075B649 110 aa7.9□□□□□ -1.14
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rpl13aP19253 203 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
Herc3-201ENSMUST00000031823 CckP09240 115 aa7.9□□□□□ -1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tax1bp3Q9DBG9 124 aa7.9□□□□□ -1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cox7b2Q9D2H1 82 aa7.89□□□□□ -1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pgpep1Q9ESW8 209 aa7.89□□□□□ -1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 P01843 105 aa7.89□□□□□ -1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Defb45Q3V490 66 aa7.89□□□□□ -1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 1700011M02RikB1AX35 88 aa7.88□□□□□ -1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Defa3P28310 93 aa7.88□□□□□ -1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Defa10P50708 93 aa7.88□□□□□ -1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tac4Q99N14 128 aa7.88□□□□□ -1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ighv2-9A0A075B5Q5 116 aa7.88□□□□□ -1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm6793B2RXM2 351 aa7.88□□□□□ -1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Defa20Q45VN2 95 aa7.88□□□□□ -1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 MturnQ8CGA4 131 aa7.88□□□□□ -1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm17509Q9CZ61 145 aa7.88□□□□□ -1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hrct1Q9D6B9 109 aa7.87□□□□□ -1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q9DAQ5 155 aa7.87□□□□□ -1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 A0A286YCN5 57 aa7.87□□□□□ -1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Camk2n2Q78WH7 79 aa7.87□□□□□ -1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Igkv3-2A0A075B5P0 119 aa7.87□□□□□ -1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trav4d-3A0A075B625 110 aa7.87□□□□□ -1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ndufa12Q7TMF3 145 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Wfdc12Q9JHY3 85 aa7.86□□□□□ -1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ighv1-56A0A0A6YXG2 117 aa7.86□□□□□ -1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm11213A0A1B0GR83 88 aa7.86□□□□□ -1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm867A0A1W2P7T4 151 aa7.86□□□□□ -1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Igkv4-92A0A0B4J1I2 117 aa7.86□□□□□ -1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm9507D3Z5T3 223 aa7.86□□□□□ -1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm10518F6UQQ9 182 aa7.85□□□□□ -1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 4930556J24RikQ9D4U7 146 aa7.85□□□□□ -1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Reg3dQ9QUS9 175 aa7.85□□□□□ -1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Timm17bQ9Z0V7 172 aa7.85□□□□□ -1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Defa1P11477 93 aa7.85□□□□□ -1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 BtcQ05928 177 aa7.85□□□□□ -1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Defb50Q6TU36 73 aa7.85□□□□□ -1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lst1O08843 95 aa7.85□□□□□ -1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 MifP34884 115 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ufsp1Q9CZP0 217 aa7.84□□□□□ -1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mc5rP41149 325 aa7.84□□□□□ -1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kmt2aP55200 3966 aa7.84□□□□□ -1.15
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hbb-b2P02089 147 aa7.83□□□□□ -1.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 Defa16P50714 93 aa7.83□□□□□ -1.16
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dppa2Q9CWH0 301 aa7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 72 ms