RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025989.8

Tm9sf3-201, Transcript of Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Tm9sf3, Length 6,144 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Tmem254aP0DN89 123 aa14,51□□□□□ -0,09
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Tmem254bP0DN90 123 aa14,51□□□□□ -0,09
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Tmem254cP0DN91 123 aa14,51□□□□□ -0,09
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Rpl28P41105 137 aaKnown RBP14,51□□□□□ -0,09
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Cdc42se2Q8BGH7 84 aa14,51□□□□□ -0,09
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Tmem258P61166 79 aa14,5□□□□□ -0,09
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Kiaa1549Q68FD9 1940 aa14,5□□□□□ -0,09
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 P06320 134 aa14,49□□□□□ -0,09
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Gm11011D3Z3L9 86 aa14,49□□□□□ -0,09
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 PtprqP0C5E4 2300 aa14,49□□□□□ -0,09
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Igkv3-12A0A140T8P0 119 aa14,49□□□□□ -0,09
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Ighv8-5A0A0A6YY60 119 aa14,49□□□□□ -0,09
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Defb40Q70KL2 73 aa14,49□□□□□ -0,09
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Arhgap32Q811P8 2089 aa14,48□□□□□ -0,09
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Klk9Q32M27 251 aa14,47□□□□□ -0,09
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Tax1bp3Q9DBG9 124 aa14,45□□□□□ -0,1
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Znf706Q9D115 76 aaKnown RBP14,45□□□□□ -0,1
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 4930535I16RikQ9CUI2 172 aa14,45□□□□□ -0,1
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Timm17bQ9Z0V7 172 aa14,45□□□□□ -0,1
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 PpdpfQ9CR37 115 aa14,45□□□□□ -0,1
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Adm2Q7TNK8 150 aa14,44□□□□□ -0,1
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Gm3250E9Q1M3 230 aa14,44□□□□□ -0,1
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Q9DAQ5 155 aa14,44□□□□□ -0,1
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 PtprbB2RU80 1998 aa14,43□□□□□ -0,1
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Gm10322F7D7I4 111 aa14,43□□□□□ -0,1
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Gm16485Q8C4B7 115 aa14,42□□□□□ -0,1
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 PolqQ8CGS6 2544 aa14,42□□□□□ -0,1
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Ighv2-9-1A0A075B697 116 aa14,42□□□□□ -0,1
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Brk1Q91VR8 75 aa14,42□□□□□ -0,1
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 1700011M02RikB1AX35 88 aa14,41□□□□□ -0,1
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 CtrlQ9ER05 264 aa14,41□□□□□ -0,1
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Igf1P05017 153 aa14,4□□□□□ -0,1
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 B430305J03RikQ8BQQ8 176 aa14,4□□□□□ -0,1
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Col27a1Q5QNQ9 1845 aa14,4□□□□□ -0,1
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Wfdc3Q14AE4 130 aa14,4□□□□□ -0,1
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Ighv8-13A0A075B5Y0 101 aa14,39□□□□□ -0,11
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Defb11Q8R2I7 77 aa14,39□□□□□ -0,11
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Trav14-1A0A0G2JF94 121 aa14,39□□□□□ -0,11
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Ighv8-11A0A075B5X4 119 aa14,37□□□□□ -0,11
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Ighv2-9A0A075B5Q5 116 aa14,37□□□□□ -0,11
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Sec61gP60060 68 aa14,36□□□□□ -0,11
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 CnfnQ6PCW6 111 aa14,36□□□□□ -0,11
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Epg5Q80TA9 2572 aa14,36□□□□□ -0,11
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Abca12E9Q876 2595 aa14,36□□□□□ -0,11
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 EnhoQ8K1D8 76 aa14,35□□□□□ -0,11
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 TroQ6DIC6 2087 aa14,35□□□□□ -0,11
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 BaalcQ8VHV1 145 aa14,35□□□□□ -0,11
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Krtap27-1E9PX37 202 aa14,35□□□□□ -0,11
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Ypel4Q65Z93 127 aa14,35□□□□□ -0,11
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Srsf12Q8C8K3 266 aa14,34□□□□□ -0,11
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Rnf152Q8BG47 203 aa14,34□□□□□ -0,11
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 A830031A19RikQ8BNT5 113 aa14,34□□□□□ -0,11
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Unc79Q0KK59 2596 aa14,33□□□□□ -0,12
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Q9DAB9 146 aa14,32□□□□□ -0,12
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 TeppQ6IMH0 216 aa14,32□□□□□ -0,12
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Igkv8-28A0A0G2JE47 121 aa14,32□□□□□ -0,12
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Gm10577Q3UDV9 132 aa14,3□□□□□ -0,12
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Gm20604F8WIA3 75 aa14,3□□□□□ -0,12
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 4930556J24RikQ9D4U7 146 aa14,29□□□□□ -0,12
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Apoc4Q61268 124 aa14,28□□□□□ -0,12
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Smim1P0C8K7 78 aa14,25□□□□□ -0,13
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 SrarpQ3ULG3 163 aa14,24□□□□□ -0,13
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Atp5eP56382 52 aa14,24□□□□□ -0,13
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Znf580Q9DB38 172 aa14,23□□□□□ -0,13
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Golgb1E9PVZ8 3238 aa14,23□□□□□ -0,13
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Ndufc1Q9CQY9 76 aa14,22□□□□□ -0,13
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Krtap24-1G3X9A2 248 aa14,22□□□□□ -0,13
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Vpreb2P13373 142 aa14,22□□□□□ -0,13
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Smim20D3Z7Q2 69 aa14,21□□□□□ -0,13
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Pla2g2eQ9QUL3 142 aa14,21□□□□□ -0,13
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Gm17509Q9CZ61 145 aa14,21□□□□□ -0,14
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Igkv3-7A0A0G2JE31 119 aa14,2□□□□□ -0,14
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Myo18bE9PV66 2605 aa14,2□□□□□ -0,14
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 CicQ924A2 2510 aa14,2□□□□□ -0,14
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Odf3l2Q3TZ65 277 aa14,19□□□□□ -0,14
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Rtl10D3YWW5 146 aa14,18□□□□□ -0,14
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Wfdc6bF6ULY1 148 aa14,18□□□□□ -0,14
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Ifitm6A0A1B0GS75 124 aa14,17□□□□□ -0,14
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 C130032M10RikQ8C888 123 aa14,16□□□□□ -0,14
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 FlnbQ80X90 2602 aaKnown RBP14,16□□□□□ -0,14
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Spata3Q9D9T6 193 aa14,15□□□□□ -0,14
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Col5a1O88207 1838 aa14,15□□□□□ -0,14
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Usp9yF8VPU6 2556 aa14,15□□□□□ -0,14
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Wdr38Q9D994 303 aa14,15□□□□□ -0,14
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Defb39Q70KL3 74 aa14,15□□□□□ -0,14
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Crip2Q9DCT8 208 aaKnown RBP14,15□□□□□ -0,14
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 NpwA0A1L1STR8 176 aa14,14□□□□□ -0,15
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 P84750 121 aa14,14□□□□□ -0,15
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Gm5142Q8C5X9 133 aa14,14□□□□□ -0,15
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Gm1968Q3T9I3 115 aa14,14□□□□□ -0,15
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Gm9887F6RFI0 207 aa14,14□□□□□ -0,15
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Atox1O08997 68 aaKnown RBP14,13□□□□□ -0,15
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 A0A286YE49 62 aa14,13□□□□□ -0,15
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 BtcQ05928 177 aa14,12□□□□□ -0,15
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Gm16181B0V2H2 73 aa14,12□□□□□ -0,15
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 CdsnQ7TPC1 561 aa14,12□□□□□ -0,15
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 4930432M17RikQ3V0W9 174 aa14,11□□□□□ -0,15
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Wfdc17Q5SSJ1 76 aa14,11□□□□□ -0,15
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 2310009B15RikA0A0A6YWI4 143 aa14,11□□□□□ -0,15
Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 Defb38Q7TNV7 63 aa14,11□□□□□ -0,15
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11,7 ms