RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000193170.1

Ccdc71-202, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc71, Length 3,044 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 HampQ9EQ21 83 aa6.6□□□□□ -1.35
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ighv1-58A0A075B5W9 117 aa6.6□□□□□ -1.35
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Igkv4-71A0A0G2JEH0 117 aa6.6□□□□□ -1.35
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Hbb-bsA8DUK4 147 aa6.6□□□□□ -1.35
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ly6lH3BJG9 140 aa6.6□□□□□ -1.35
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Hbb-b1P02088 147 aa6.6□□□□□ -1.35
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Fam19a3Q7TPG6 132 aa6.6□□□□□ -1.35
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Srsf12Q8C8K3 266 aa6.6□□□□□ -1.35
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 D730001G18RikA0A087WQU7 115 aa6.6□□□□□ -1.35
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ighv1-23A0A0A6YVW3 117 aa6.6□□□□□ -1.35
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Defb45Q3V490 66 aa6.6□□□□□ -1.35
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ang5Q5GAN1 145 aa6.6□□□□□ -1.35
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Itpr1P11881 2749 aa6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Foxi2Q3I5G5 311 aa6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Defb10Q8R2I8 73 aa6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Igfn1Q3KNY0 2849 aa6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 FcorP0DJI6 106 aa6.59□□□□□ -1.35
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ccl25O35903 144 aa6.58□□□□□ -1.36
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Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Tmem170bP86050 132 aa6.58□□□□□ -1.36
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 NrepQ07475 68 aa6.58□□□□□ -1.36
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Ccdc71-202ENSMUST00000193170 E130116L18RikQ8BMV6 101 aa6.58□□□□□ -1.36
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Wdr38Q9D994 303 aa6.58□□□□□ -1.36
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ighv14-1A0A075B5R4 117 aa6.58□□□□□ -1.36
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ighv3-8A0A075B5T0 131 aa6.58□□□□□ -1.36
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 9530003J23RikQ8BM26 151 aa6.58□□□□□ -1.36
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Mrpl36Q99N90 102 aa6.58□□□□□ -1.36
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Plac1Q9JI83 173 aa6.58□□□□□ -1.36
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ighv8-12A0A0G2JDE1 119 aa6.58□□□□□ -1.36
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 P01643 108 aa6.58□□□□□ -1.36
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 P01837 106 aa6.58□□□□□ -1.36
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 S100a4P07091 101 aa6.58□□□□□ -1.36
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Prss29Q99MS4 279 aa6.57□□□□□ -1.36
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Lrrk2Q5S006 2527 aa6.57□□□□□ -1.36
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 4930447F04RikA2AFR2 126 aa6.57□□□□□ -1.36
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 P06334 169 aa6.57□□□□□ -1.36
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Psmg4P0C7N9 123 aa6.57□□□□□ -1.36
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Phf5aP83870 110 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Defb30Q30KN4 75 aa6.56□□□□□ -1.36
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Rnase13Q5GAM7 153 aa6.56□□□□□ -1.36
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Odf1Q61999 247 aa6.56□□□□□ -1.36
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Q9CX25 107 aa6.56□□□□□ -1.36
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ndufs7Q9DC70 224 aa6.56□□□□□ -1.36
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ankhd1E9PUR0 2548 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ankrd11E9Q4F7 2643 aa6.56□□□□□ -1.36
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Edn3P48299 214 aa6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 BlcapP62951 87 aa6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Abca2P41234 2434 aa6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ighv3-4A0A0A6YXF1 117 aa6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ccl21bP86792 133 aa6.55□□□□□ -1.36
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ccl21cP86793 133 aa6.55□□□□□ -1.36
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Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Crip2Q9DCT8 208 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
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Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Igkv4-70A0A0B4J1I5 116 aa6.54□□□□□ -1.36
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gcn1E9PVA8 2671 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Igkv4-57-1A0A075B5M4 119 aa6.54□□□□□ -1.36
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Rbm3O89086 153 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
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Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Helz2E9QAM5 2947 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ighv1-80A0A075B5Y3 117 aa6.52□□□□□ -1.36
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Ccdc71-202ENSMUST00000193170 4930564D02RikQ9D4S4 103 aa6.52□□□□□ -1.36
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Ccdc71-202ENSMUST00000193170 C920008G01RikA0A0B4J1N1 112 aa6.52□□□□□ -1.37
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Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Tmem14cQ9CQN6 114 aa6.52□□□□□ -1.37
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Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm16485Q8C4B7 115 aa6.52□□□□□ -1.37
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 RhohQ9D3G9 191 aa6.52□□□□□ -1.37
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ttc28Q80XJ3 2450 aa6.51□□□□□ -1.37
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Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Mrps21P58059 87 aa6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Defb47Q30KN1 79 aa6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm10295Q8CCF3 114 aa6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 CubnQ9JLB4 3623 aa6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Trav6-4A0A075B6B4 115 aa6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm10135F6TEE5 83 aa6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm10271F6WY25 52 aa6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Socs3O35718 225 aa6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Il1f10Q8R459 152 aa6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 OtogO55225 2910 aa6.51□□□□□ -1.37
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm35549A0A0N4SUS7 141 aa6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm11444F6QMA6 170 aa6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm3646F6S692 53 aa6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 MsmbO08540 113 aa6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 LhbO09108 141 aa6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ube2d3P61079 147 aa6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ube2d2P62838 147 aa6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Serp2Q6TAW2 65 aa6.5□□□□□ -1.37
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ube2aQ9Z255 152 aa6.5□□□□□ -1.37
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