RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000107060.7

Eftud2-202, Transcript of 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Eftud2, Length 3,339 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2-202ENSMUST00000107060 C2cd3Q52KB6 2323 aa10.65□□□□□ -0.7
Eftud2-202ENSMUST00000107060 H1fxQ80ZM5 188 aa10.65□□□□□ -0.7
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dmbt1Q60997 2085 aa10.65□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 SbpP15501 199 aa10.64□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ube2d3P61079 147 aa10.64□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ube2d2P62838 147 aa10.64□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Defa24Q5G865 93 aa10.64□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hspg2Q05793 3707 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gpha2Q925Q5 128 aa10.64□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vps25Q9CQ80 176 aa10.64□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mfap4Q9D1H9 257 aa10.64□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Phlda3Q9WV95 125 aa10.63□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 P84751 237 aa10.63□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm45213A0A0U1RNZ6 101 aa10.63□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gemin7Q9CWY4 129 aa10.63□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Helz2E9QAM5 2947 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 CdsnQ7TPC1 561 aa10.62□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Esp4A8R0T8 117 aa10.62□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm6812B1AXU1 112 aa10.62□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trav7-2Q5R1I3 112 aa10.62□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nop10Q9CQS2 64 aa10.62□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Atxn7l1Q9CZ05 146 aa10.61□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Crlf1Q9JM58 425 aa10.61□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ighv8-5A0A0A6YY60 119 aa10.61□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rbmxl2Q9DAE2 385 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 MtorQ9JLN9 2549 aa10.61□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Spink13Q3UTS8 97 aa10.61□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm45717A0A1B0GT68 152 aa10.6□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm45753A0A1C7CYU8 86 aa10.6□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hsbp1l1B2RXB2 72 aa10.6□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccl25O35903 144 aa10.6□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 NipblQ6KCD5 2798 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm7849D3YX03 116 aa10.6□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rpl35aO55142 110 aa10.6□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 CrygaP04345 174 aa10.6□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Smrp1Q2MH31 260 aa10.6□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm21748Q3UE70 102 aa10.6□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rbmy1bQ60990 380 aa10.6□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 GfyJ3KML8 504 aa10.6□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Defa13P50711 93 aa10.6□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rpl36aP83882 106 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Myo18bE9PV66 2605 aa10.59□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pxt1Q8K459 51 aa10.59□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ndufa3Q9CQ91 84 aa10.59□□□□□ -0.71
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Esp24A8R0V6 68 aa10.58□□□□□ -0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ly6gP35461 111 aa10.58□□□□□ -0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tspan13Q9D8C2 204 aa10.58□□□□□ -0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tenm4Q3UHK6 2771 aa10.58□□□□□ -0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fgf23Q9EPC2 251 aa10.58□□□□□ -0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Plac8l1Q08EJ0 177 aa10.58□□□□□ -0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Shisa2Q8QZV2 295 aa10.58□□□□□ -0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm45785A0A1B0GT05 94 aa10.57□□□□□ -0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cox6b1P56391 86 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zfp462B1AWL2 2495 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pgpep1Q9ESW8 209 aa10.57□□□□□ -0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm10772F7AIG4 85 aa10.56□□□□□ -0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm3250E9Q1M3 230 aa10.56□□□□□ -0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tfpi2O35536 230 aa10.56□□□□□ -0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 4930442H23RikQ9D5G7 103 aa10.56□□□□□ -0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trav4-3A0A0B4J1K1 110 aa10.56□□□□□ -0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lect2O88803 151 aa10.56□□□□□ -0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fbn1Q61554 2873 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm43218A0A0G2JGT0 114 aa10.55□□□□□ -0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 C920008G01RikA0A0B4J1N1 112 aa10.55□□□□□ -0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ighv8-12A0A0G2JDE1 119 aa10.55□□□□□ -0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cdc42se2Q8BGH7 84 aa10.55□□□□□ -0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tac4Q99N14 128 aa10.55□□□□□ -0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 P01729 129 aa10.55□□□□□ -0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 PolP10400 120 aa10.55□□□□□ -0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Akap13E9Q394 2776 aa10.54□□□□□ -0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igkv4-72A0A0B4J1I4 117 aa10.54□□□□□ -0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tmem238A9JSM3 176 aa10.54□□□□□ -0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igkv4-79A0A075B5L8 119 aa10.54□□□□□ -0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gata3P23772 443 aa10.54□□□□□ -0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cox11Q6P8I6 275 aa10.53□□□□□ -0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Srsf9Q9D0B0 222 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igfn1Q3KNY0 2849 aa10.53□□□□□ -0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cep192E9Q4Y4 2514 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Notch3Q61982 2318 aa10.53□□□□□ -0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ifitm10Q8BR26 201 aa10.53□□□□□ -0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tmem101Q91VP7 257 aa10.53□□□□□ -0.72
Eftud2-202ENSMUST00000107060 NpwA0A1L1STR8 176 aa10.52□□□□□ -0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 P01811 117 aa10.52□□□□□ -0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Timm17bQ9Z0V7 172 aa10.52□□□□□ -0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Morn5Q9DAI9 170 aa10.52□□□□□ -0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm35549A0A0N4SUS7 141 aa10.51□□□□□ -0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm6793B2RXM2 351 aa10.51□□□□□ -0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm9242J3QNY1 357 aa10.51□□□□□ -0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Spink4O35679 86 aa10.51□□□□□ -0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 A830031A19RikQ8BNT5 113 aa10.51□□□□□ -0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rpl24Q8BP67 157 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm3233E9Q2H5 230 aa10.5□□□□□ -0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 4930546C10RikE9Q4Y3 121 aa10.5□□□□□ -0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm933J3QPC1 141 aa10.5□□□□□ -0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Il1f10Q8R459 152 aa10.5□□□□□ -0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 CicQ924A2 2510 aa10.5□□□□□ -0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trav4d-3A0A075B625 110 aa10.5□□□□□ -0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slamf6Q9ET39 351 aa10.49□□□□□ -0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trav9d-3A0A075B695 113 aa10.49□□□□□ -0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Klk9Q32M27 251 aa10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 105.4 ms