RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000059272.9

Hoxd9-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd9, Length 2,136 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm10509O88255 85 aa16.82■□□□□ 0.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 AngP21570 145 aa16.82■□□□□ 0.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Col6a5A6H584 2640 aa16.82■□□□□ 0.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 P18527 97 aa16.81■□□□□ 0.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Spag11Q8K4N2 71 aa16.81■□□□□ 0.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tex48Q9DA81 110 aa16.81■□□□□ 0.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Defa30E9QPZ2 93 aa16.8■□□□□ 0.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Vmn1r197Q8R265 298 aa16.8■□□□□ 0.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Notch2O35516 2470 aa16.79■□□□□ 0.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tmem170bP86050 132 aa16.79■□□□□ 0.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cd164l2Q9D6W7 172 aa16.79■□□□□ 0.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm10300Q8C8P7 189 aa16.78■□□□□ 0.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 TirapQ99JY1 241 aa16.78■□□□□ 0.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 B230217C12RikE9Q3Z1 139 aa16.78■□□□□ 0.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fgfbp3Q1HCM0 245 aa16.78■□□□□ 0.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Il19Q8CJ70 176 aa16.78■□□□□ 0.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 TtrP07309 147 aa16.77■□□□□ 0.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Defa6P50704 93 aa16.77■□□□□ 0.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Crip2Q9DCT8 208 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Timm17aQ9Z0V8 171 aa16.77■□□□□ 0.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Defa34D3Z0J0 93 aa16.76■□□□□ 0.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Defa37K9J724 93 aa16.76■□□□□ 0.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fgf6P21658 208 aa16.76■□□□□ 0.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Defa5P28312 93 aa16.76■□□□□ 0.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ube2v1Q9CZY3 147 aa16.76■□□□□ 0.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rpl39P62892 51 aa16.76■□□□□ 0.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ss18Q62280 418 aa16.76■□□□□ 0.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 March3Q8BRX9 218 aa16.76■□□□□ 0.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Notch3Q61982 2318 aa16.75■□□□□ 0.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Smim13E9Q942 88 aa16.75■□□□□ 0.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mustn1Q99JI1 82 aa16.75■□□□□ 0.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Q99M08 65 aa16.75■□□□□ 0.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ifitm1Q9D103 106 aa16.75■□□□□ 0.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm815Q3UWS2 115 aa16.74■□□□□ 0.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm9922Q8C3P1 144 aa16.74■□□□□ 0.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 BC107364E9Q5A2 140 aa16.73■□□□□ 0.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 P01837 106 aa16.73■□□□□ 0.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 A530064D06RikQ8BNV8 229 aa16.73■□□□□ 0.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ighv1-5A0A0A6YWG2 117 aa16.73■□□□□ 0.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 P01738 130 aa16.73■□□□□ 0.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 P01741 114 aa16.72■□□□□ 0.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Lyrm9Q3UN90 78 aa16.72■□□□□ 0.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tal2Q62282 108 aa16.72■□□□□ 0.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 CrygfQ9CXV3 174 aa16.72■□□□□ 0.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Igsf10Q3V1M1 2594 aa16.71■□□□□ 0.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tcrg-C3L7N479 172 aa16.71■□□□□ 0.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 P03985 172 aa16.71■□□□□ 0.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fxyd5P97808 178 aa16.71■□□□□ 0.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 F11rO88792 300 aa16.7■□□□□ 0.26
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Defb42Q8BVB5 75 aa16.7■□□□□ 0.26
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Brd3osA0A1B0GRB6 84 aa16.7■□□□□ 0.26
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fam240aJ3QNP9 97 aa16.7■□□□□ 0.26
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 PpdpfQ9CR37 115 aa16.7■□□□□ 0.26
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Lypd5Q9D7Z7 256 aa16.7■□□□□ 0.26
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ndufs7Q9DC70 224 aa16.7■□□□□ 0.26
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Erg28Q9ERY9 140 aa16.7■□□□□ 0.26
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Q9D727 114 aa16.69■□□□□ 0.26
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Higd1aQ9JLR9 95 aa16.69■□□□□ 0.26
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm7138L7N2C3 230 aa16.68■□□□□ 0.26
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 FcorP0DJI6 106 aa16.68■□□□□ 0.26
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm3238W4VSP7 230 aa16.68■□□□□ 0.26
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Brwd1Q921C3 2304 aa16.68■□□□□ 0.26
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gata1P17679 413 aa16.67■□□□□ 0.26
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 BtcQ05928 177 aa16.67■□□□□ 0.26
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pradc1Q9D9N8 188 aa16.67■□□□□ 0.26
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Smim1P0C8K7 78 aa16.66■□□□□ 0.26
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cks1brtQ3UNC9 96 aa16.66■□□□□ 0.26
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Q5BN45 167 aa16.66■□□□□ 0.26
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Hivep3A2A884 2348 aa16.66■□□□□ 0.26
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 G0s2Q61585 103 aa16.66■□□□□ 0.26
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Srrm2Q8BTI8 2703 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Trav9n-2A0A0G2JDP3 113 aa16.65■□□□□ 0.26
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Morn3Q8C5T4 241 aa16.65■□□□□ 0.26
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm14137Q8CE97 175 aa16.65■□□□□ 0.26
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tmem263Q9DAM7 115 aa16.65■□□□□ 0.26
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 S100a8P27005 89 aa16.64■□□□□ 0.25
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cysltr1Q99JA4 352 aa16.64■□□□□ 0.25
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Atp5lQ9CPQ8 103 aa16.64■□□□□ 0.25
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ighv1-62-2A0A0A6YXZ4 119 aa16.64■□□□□ 0.25
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 PrlhG3UWC3 86 aa16.64■□□□□ 0.25
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm21693J3QK27 380 aa16.64■□□□□ 0.25
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Snx22Q8C084 192 aa16.64■□□□□ 0.25
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm10295Q8CCF3 114 aa16.64■□□□□ 0.25
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tnfrsf23Q9ER63 176 aa16.64■□□□□ 0.25
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ighv2-6-8A0A0A6YWY9 116 aa16.63■□□□□ 0.25
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm1553Q66VB7 94 aa16.63■□□□□ 0.25
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Igkv2-137A0A0B4J1H6 120 aa16.63■□□□□ 0.25
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Vamp8O70404 101 aa16.63■□□□□ 0.25
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Defa9P50707 93 aa16.63■□□□□ 0.25
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Bak1O08734 209 aa16.61■□□□□ 0.25
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Plac1Q9JI83 173 aa16.61■□□□□ 0.25
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tcrg-C1A0A075B5Z0 172 aa16.61■□□□□ 0.25
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tm4sf20Q9CQY8 226 aa16.61■□□□□ 0.25
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Scgb1b24B1B0N6 92 aa16.6■□□□□ 0.25
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 SbpP15501 199 aa16.6■□□□□ 0.25
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Eif4ebp1Q60876 117 aa16.6■□□□□ 0.25
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Trav4n-4A0A075B615 110 aa16.6■□□□□ 0.25
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rpl35aO55142 110 aa16.6■□□□□ 0.25
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tmem97Q8VD00 176 aa16.6■□□□□ 0.25
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nat8b-psE0CYC6 232 aa16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 126.4 ms