RNA–Protein interactions for RNA: YOR011W

AUS1, Transcript of Plasma membrane sterol transporter of the ATP-binding cassette family, yeast

Gene AUS1, Length 4,185 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AUS1	YOR011W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	CYM1	P32898	989 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	APE4	P38821	490 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	NUP60	P39705	539 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	VHR2	P40041	505 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	RRN7	P40992	514 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	POL31	P46957	487 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	TOM22	P49334	152 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	COQ9	Q05779	260 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	GMC2	Q06201	188 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	YPL191C	Q08930	360 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	REP1	P03871	373 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	HEM2	P05373	342 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	KSS1	P14681	368 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	COX13	P32799	129 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	TIM23	P32897	222 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	YBR032W	P38223	100 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	ERP2	P39704	215 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	AIM20	P40451	204 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	ORC3	P54790	616 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	SPO20	Q04359	397 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	TY3A-G	Q12173	290 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	TY3A-I	Q99219	290 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	TPK2	P06245	380 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	PHO87	P25360	923 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	VBA3	P25594	458 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	PRR1	P28708	518 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	RPC82	P32349	654 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	VBA5	P36172	582 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	TSC10	P38342	320 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	YHL012W	P38709	493 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	YHR054C	P38780	354 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	RSC30	P38781	883 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	YJL007C	P47080	104 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	GPI1	P53306	609 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	RSC4	Q02206	625 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	YMR209C	Q03648	457 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	FMN1	Q03778	218 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	YDR109C	Q04585	715 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	NRT1	Q08485	598 aa		3.37	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	CNA1	P23287	553 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	MSH2	P25847	964 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	MRP8	P35719	219 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	PRM9	P39551	298 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	YTA6	P40328	754 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	NET1	P47035	1189 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	AZR1	P50080	613 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	NMA2	P53204	395 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	DUS4	Q06063	367 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	MUM3	Q08750	479 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	MCH5	Q08777	521 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	CSR2	Q12734	1121 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	FLO11	P08640	1367 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	FLO1	P32768	1537 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	BI2	P03873	423 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	BI4	P03879	638 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.36	□□□□□ -1.87	not detected
AUS1	YOR011W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	FBP1	P09201	348 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	YAK1	P14680	807 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	CSM1	P25651	190 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	NUF2	P33895	451 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	APN2	P38207	520 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	HSL7	P38274	827 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	MAM33	P40513	266 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	RSM26	P47141	266 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	GET1	P53192	235 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	BNI4	P53858	892 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	YCS4	Q06156	1176 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	MET7	Q08645	548 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	YPR089W	O13585	888 aa		3.36	□□□□□ -1.87

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