RNA–Protein interactions for RNA: YNL035C

YNL035C, Transcript of Nuclear protein of unknown function, yeast

Gene YNL035C, Length 1,170 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL035C	YNL035C	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	PUS9	Q12069	462 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	SWC3	P31376	625 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	RPN12	P32496	274 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	CNS1	P33313	385 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	LNP1	P38878	278 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	YJL206C	P39529	758 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	COG1	P53079	417 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	CBK1	P53894	756 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	SNO4	Q04902	237 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	HSP32	Q08992	237 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	CDC5	P32562	705 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	LOT5	P34234	306 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	PIH1	P38768	344 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	CHS7	P38843	316 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	BDH2	P39713	417 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	YEL068C	P39977	110 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	TMA108	P40462	946 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	SKP2	P42843	763 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	TGS1	Q12052	315 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	RRI2	Q12348	645 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	MIT1	P40002	666 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	TIM44	Q01852	431 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.23	□□□□□ -1.73	not detected
YNL035C	YNL035C	ENT1	Q12518	454 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	YLR302C	O13544	120 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	KIN3	P22209	435 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	SAN1	P22470	610 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	TY2A-C	P25383	438 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	URK1	P27515	501 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	NUP120	P35729	1037 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	YPT10	P38146	199 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	MTG2	P38860	518 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	RIC1	P40395	1056 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	SDS3	P40505	327 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	REG1	Q00816	1014 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	YML119W	Q03208	357 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	YDL073W	Q07454	984 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	VAM6	Q07468	1049 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	TAF3	Q12297	353 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNL035C	YNL035C	STE12	P13574	688 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	YMC2	P38087	329 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	LYS14	P40971	790 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	GND2	P53319	492 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	UBP16	Q02863	499 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	TMA16	Q08687	178 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	AAC1	P04710	309 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	CDC43	P18898	376 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	PDE1	P22434	369 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	AMD2	P22580	549 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	CBF2	P32504	956 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	MOH1	P38191	138 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	PSD1	P39006	500 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	IMO32	P53219	342 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	YGR079W	P53249	370 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	SLI1	P53304	468 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	COQ6	P53318	479 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	YNL092W	P53934	400 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	YML053C	Q04978	212 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	ZPS1	Q12512	249 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	TPK2	P06245	380 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	WHI2	P12611	486 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	AAC3	P18238	307 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	PAH1	P32567	862 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	GDA1	P32621	518 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	VPS8	P39702	1274 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	CTF4	Q01454	927 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	YDL242W	Q07746	117 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL035C	YNL035C	CRT10	Q08226	957 aa		4.19	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.7 ms