RNA–Protein interactions for RNA: YMR229C

RRP5, Transcript of RNA binding protein involved in synthesis of both 18S and 5.8S rRNAs, yeast

Gene RRP5, Length 5,190 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP5	YMR229C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	OPT1	P40897	799 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	ELP2	P42935	788 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YGR127W	P53275	312 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MEH1	Q02205	184 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	RPN4	Q03465	531 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	GAD1	Q04792	585 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	GMC2	Q06201	188 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YOL036W	Q08206	761 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.37	□□□□□ -1.87	not detected
RRP5	YMR229C	SPE4	Q12455	300 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SFL1	P20134	766 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	URA10	P30402	227 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YKL063C	P35725	167 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	BCH2	P36122	765 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SWC5	P38326	303 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	GAA1	P39012	614 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	CLA4	P48562	842 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	AZR1	P50080	613 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	PEX12	Q04370	399 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	CUR1	Q06469	252 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SLX4	Q12098	748 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	ATG34	Q12292	412 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	PTC5	Q12511	572 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MRPL32	P25348	183 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	VMA22	P38784	181 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	NUP84	P52891	726 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	USE1	P53146	245 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	DIP5	P53388	608 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	PUS5	Q06244	254 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	GYP1	Q08484	637 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MST1	P07236	462 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	ATR1	P13090	542 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	CNA1	P23287	553 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MEI4	P29467	408 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SLA2	P33338	968 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	HMT1	P38074	348 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	TDP1	P38319	544 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	PCA1	P38360	1216 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	RFC3	P38629	340 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YHR045W	P38775	560 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YLL056C	Q12177	298 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	PSY3	Q12318	242 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	HEM2	P05373	342 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	GCR1	P07261	785 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	TUP1	P16649	713 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	RER1	P25560	188 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SPR1	P32603	445 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	UTR4	P32626	227 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	VPS51	P36116	164 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	GID8	P40208	455 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SNL1	P40548	159 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	PEX8	P53248	589 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YNR065C	P53751	1116 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	GOR1	P53839	350 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	GUD1	Q07729	489 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	PCD1	Q12524	340 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MBR1	P23493	339 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	PEX3	P28795	441 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	PHA2	P32452	334 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	RIB7	P33312	244 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	TPO5	P36029	618 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SLM4	P38247	162 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	RCK2	P38623	610 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	ATG7	P38862	630 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MSS2	P40990	351 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	KEL2	P50090	882 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	PEX31	P53203	462 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	HDA1	P53973	706 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.35	□□□□□ -1.87	not detected

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