RNA–Protein interactions for RNA: YLL006W

MMM1, Transcript of ER integral membrane protein, ERMES complex subunit, yeast

Gene MMM1, Length 1,281 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MMM1	YLL006W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	ARA2	Q04212	335 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	USV1	Q12132	391 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	HOS1	Q12214	470 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	PCK1	P10963	549 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
MMM1	YLL006W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	FUB1	P25659	250 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	NPL6	P32832	435 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	YLF2	P38746	405 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	YER010C	P40011	234 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	GET2	P40056	285 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	JEM1	P40358	645 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	IRC6	P43615	237 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	MDR1	P53258	950 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	RIM13	Q03792	727 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	TAF11	Q04226	346 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	YKU80	Q04437	629 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	VHS3	Q08438	674 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	OSW1	Q08692	278 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	SEM1	O94742	89 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	CDC16	P09798	840 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	GMH1	P36125	273 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	YHR033W	P38690	423 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	AXL2	P38928	823 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	PRM2	P40534	656 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
MMM1	YLL006W	MRK1	P50873	501 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	REC102	Q02721	264 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	PPN1	Q04119	674 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	VTI1	Q04338	217 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	TRI1	Q05024	226 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	YDR286C	Q05530	114 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	PGC1	Q08959	321 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	SKM1	Q12469	655 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	SIR1	P21691	654 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	PEX1	P24004	1043 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	DBF4	P32325	704 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	PET127	P32606	800 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	SET3	P36124	751 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	MUP3	P38734	546 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	POP2	P39008	433 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	RIC1	P40395	1056 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	AXL1	P40851	1208 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	IMA5	P40884	581 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	PXA1	P41909	870 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	CIR1	P42940	261 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	CTF18	P49956	741 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	SEG1	Q04279	960 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	TRM8	Q12009	286 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	NBP2	Q12163	236 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	MET8	P15807	274 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	PDX1	P16451	410 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	BET2	P20133	325 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	IFA38	P38286	347 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	TAF4	P50105	388 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	MNT2	P53059	558 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	BSC5	P53755	489 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	YPS7	Q06325	596 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	HUA2	Q12134	243 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	SFI1	Q12369	946 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	TPK1	P06244	397 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	CWH43	P25618	953 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	BYE1	P36106	594 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	CAB2	P40506	365 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	MAD2	P40958	196 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	LYS14	P40971	790 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	COX18	P53239	316 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	ATG21	Q02887	496 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	SNO4	Q04902	237 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	CRD1	Q07560	283 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	AAD4	Q07747	329 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	HSP32	Q08992	237 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MMM1	YLL006W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MMM1	YLL006W	RED1	P14291	827 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MMM1	YLL006W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MMM1	YLL006W	SEC15	P22224	910 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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