RNA–Protein interactions for RNA: YLL003W

SFI1, Transcript of Centrin (Cdc31p)-binding protein required for SPB duplication, yeast

Gene SFI1, Length 2,841 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SFI1	YLL003W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	AIM2	P39721	246 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	LOH1	P47055	219 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	LCL3	P53153	274 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	YBP2	P53169	641 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	OKP1	P53298	406 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	MEC3	Q02574	474 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	ISU1	Q03020	165 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	SIL1	Q08199	421 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	SMC5	Q08204	1093 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	NTG2	Q08214	380 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	BDS1	Q08347	646 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	HOS1	Q12214	470 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	DBF4	P32325	704 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	MCM10	P32354	571 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	RCN1	P36054	211 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	STL1	P39932	569 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	CCC1	P47818	322 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	NIT3	P49954	291 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	MNT4	P53745	580 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	VPS9	P54787	451 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	YLR125W	Q12138	136 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	RAD61	Q99359	647 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	KIP1	P28742	1111 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	YKR015C	P36111	568 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	KTR4	P38131	464 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	DDI1	P40087	428 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	KHA1	P40309	873 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	AIM24	P47127	394 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	BRO1	P48582	844 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	RPN14	P53196	417 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	MAL13	P53338	473 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	IRC4	Q03036	179 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	PPM1	Q04081	328 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	YPQ2	Q06328	317 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	YLR358C	O13565	187 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	MET8	P15807	274 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	CDC23	P16522	626 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	IME1	P21190	360 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	CMK2	P22517	447 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	ERT1	P38140	529 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	YHL050C	P38721	697 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	BUD16	P39988	312 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	SER33	P40510	469 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	PAC11	P40960	533 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	YFL034W	P43564	1073 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	ROG3	P43602	733 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	MDE1	P47095	244 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	NUT1	P53114	1132 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	MRM2	P53123	320 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	YGR042W	P53227	271 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	COS6	P53344	381 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	MAK10	Q02197	733 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	RMD1	Q03441	430 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	UFO1	Q04511	668 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	BSC2	Q05611	235 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	MUM3	Q08750	479 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	OSW2	Q12202	724 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	AEP2	P22136	580 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	CWH43	P25618	953 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	SIN4	P32259	974 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	ORC2	P32833	620 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	NIT1	P40447	199 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	GTO1	P48239	356 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	MND1	P53102	219 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	GUP1	P53154	560 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	NHX1	Q04121	633 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SFI1	YLL003W	SSP2	Q08646	371 aa		4.78	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.7 ms