RNA–Protein interactions for RNA: Q0050

AI1, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI1, Length 2,505 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI1	Q0050	PEX6	P33760	1030 aa		0.59	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	TGL1	P34163	548 aa		0.59	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	RSM22	P36056	628 aa		0.59	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	SRX1	P36077	127 aa		0.59	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	SET3	P36124	751 aa		0.59	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YMC2	P38087	329 aa		0.59	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	DTR1	P38125	572 aa		0.59	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	GPI16	P38875	610 aa		0.59	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	FAU1	P40099	211 aa		0.59	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	FYV10	P40492	516 aa		0.59	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.59	□□□□□ -2.32	not detected
AI1	Q0050	ASG7	P46993	209 aa		0.59	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	AMA1	P50082	593 aa		0.59	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	NRM1	P53718	249 aa		0.59	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	0.59	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	PNG1	Q02890	363 aa		0.59	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	FCP1	Q03254	732 aa		0.59	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	SLD5	Q03406	294 aa		0.59	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	SPR28	Q04921	423 aa		0.59	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	ARP9	Q05123	467 aa		0.59	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	FAR10	Q06001	478 aa		0.59	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	SKG3	Q06315	1026 aa		0.59	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	0.59	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	RKM4	Q12504	494 aa		0.59	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	PCD1	Q12524	340 aa		0.59	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	ATG11	Q12527	1178 aa		0.59	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	SEC39	Q12745	709 aa		0.59	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	MDN1	Q12019	4910 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	PEX34	P25584	144 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	ADK2	P26364	225 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	CIN8	P27895	1000 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	LYP1	P32487	611 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	SEC6	P32844	805 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	MAL32	P38158	584 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	SAK1	P38990	1142 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	BDH2	P39713	417 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	SIT1	P39980	628 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	MAM1	P40065	302 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	VHR1	P40522	640 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	MRPS18	P42847	217 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	GSM1	P42950	618 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	VPS25	P47142	202 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	ADA2	Q02336	434 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	RNH1	Q04740	348 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	THI3	Q07471	609 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	RTT10	Q08924	1013 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	HIF1	Q12373	385 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	MPH2	P0CD99	609 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YER190C-B	P0CX94	160 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	INO1	P11986	533 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	CDC34	P14682	295 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	PRE8	P23639	250 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	GRR1	P24814	1151 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	GAC1	P28006	793 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	SWC3	P31376	625 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YEL1	P34225	687 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	TAF14	P35189	244 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	MCM7	P38132	845 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YBR062C	P38239	180 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	VID28	P40547	921 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YIR016W	P40572	265 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	CHS6	P40955	746 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	ASK10	P48361	1146 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	FLC3	P53121	802 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	TYW3	P53177	273 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YKR011C	Q02209	353 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	YPL014W	Q02606	381 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	IOC4	Q04213	475 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	RRN11	Q04712	507 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	GAD1	Q04792	585 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	HUA2	Q12134	243 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	HAL9	Q12180	1030 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	PHO5	P00635	467 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
AI1	Q0050	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32

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