RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 VWA3BQ502W6 1294 aa19.19■□□□□ 0.66
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PSMB7Q99436 277 aa19.13■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRT9P35527 623 aa19.13■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 POSTNQ15063 836 aa19.13■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP19.13■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PAK2Q13177 524 aa19.13■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa19.13■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CSRNP2Q9H175 543 aa19.13■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PARP3Q9Y6F1 533 aa19.13■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NLRP1Q9C000 1473 aa19.13■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRAPPC3LQ5T215 181 aa19.13■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 WWC3Q9ULE0 1092 aa19.13■□□□□ 0.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PPFIA1Q13136 1202 aa19.13■□□□□ 0.65
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