RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469034.1

SUMO1-210, Transcript of small ubiquitin-like modifier 1, human

TSL 3

Gene SUMO1, Length 511 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUMO1-210	ENST00000469034	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	6.65	□□□□□ -1.34
SUMO1-210	ENST00000469034	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	6.65	□□□□□ -1.34
SUMO1-210	ENST00000469034	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
SUMO1-210	ENST00000469034	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
SUMO1-210	ENST00000469034	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
SUMO1-210	ENST00000469034	GLI1	P08151	1106 aa		6.64	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	C1QTNF9	P0C862	333 aa		6.64	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	SSFA2	P28290	1259 aa		6.64	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	NPHS2	Q9NP85	383 aa		6.64	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		6.64	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	CCER2	I3L3R5	266 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	NFIB	O00712	420 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	NEFM	P07197	916 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	6.63	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	ISL2	Q96A47	359 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	ABCB6	Q9NP58	842 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	6.63	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	KRT82	Q9NSB4	513 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	ABL1	P00519	1130 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	NEFL	P07196	543 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	ITGAE	P38570	1179 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	FAAP100	Q0VG06	881 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	KIRREL1	Q96J84	757 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	MTMR7	Q9Y216	660 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	KRT1	P04264	644 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	KCNB2	Q92953	911 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	6.6	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	6.6	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	RNF214	Q8ND24	703 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	DIRC2	Q96SL1	478 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SUMO1-210	ENST00000469034	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		6.59	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		6.59	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	INHBB	P09529	407 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	ORC1	Q13415	861 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	TMEM253	P0C7T8	217 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	CLCN7	P51798	805 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	ERVK-24	P63145	666 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	PDZD3	Q86UT5	571 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	PTPRK	Q15262	1439 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	CUL7	Q14999	1698 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	GDNF	P39905	211 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	CTSW	P56202	376 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	KCNA10	Q16322	511 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SUMO1-210	ENST00000469034	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		6.55	□□□□□ -1.36

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