RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419593.5

SYS1-DBNDD2-201, Transcript of SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2

Gene SYS1-DBNDD2, Length 1,313 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 TREML2Q5T2D2 321 aa20.29■□□□□ 0.84
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SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 DEFB118Q96PH6 123 aa20.28■□□□□ 0.84
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SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 TRIM27P14373 513 aa20.16■□□□□ 0.82
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 JAG1P78504 1218 aa20.16■□□□□ 0.82
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 C20orf194Q5TEA3 1177 aa20.16■□□□□ 0.82
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa20.16■□□□□ 0.82
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 SNRKQ9NRH2 765 aa20.16■□□□□ 0.82
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.16■□□□□ 0.82
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 ALPK3Q96L96 1907 aa20.16■□□□□ 0.82
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 ASNSP08243 561 aa20.15■□□□□ 0.82
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 PLCG2P16885 1265 aa20.15■□□□□ 0.82
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 PPP4CP60510 307 aa20.15■□□□□ 0.82
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa20.15■□□□□ 0.82
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 LRCH3Q96II8 777 aa20.15■□□□□ 0.82
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