RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249499.7

HOXD9-201, Transcript of homeobox D9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD9, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9-201ENST00000249499 LINC00301Q8NCQ3 95 aa26.58■■□□□ 1.85
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HOXD9-201ENST00000249499 USP17L21D6R901 530 aa26.56■■□□□ 1.84
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HOXD9-201ENST00000249499 CALM2P0DP24 149 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXD9-201ENST00000249499 CALM3P0DP25 149 aa26.55■■□□□ 1.84
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HOXD9-201ENST00000249499 ENGASEQ8NFI3 743 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXD9-201ENST00000249499 FAM200AQ8TCP9 573 aa26.53■■□□□ 1.84
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HOXD9-201ENST00000249499 CCDC39Q9UFE4 941 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXD9-201ENST00000249499 PPP6R2O75170 966 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXD9-201ENST00000249499 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP26.49■■□□□ 1.83
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HOXD9-201ENST00000249499 MMP1P03956 469 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXD9-201ENST00000249499 CKAP2LQ8IYA6 745 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXD9-201ENST00000249499 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXD9-201ENST00000249499 NUP133Q8WUM0 1156 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXD9-201ENST00000249499 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
HOXD9-201ENST00000249499 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXD9-201ENST00000249499 AMOTL1Q8IY63 956 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXD9-201ENST00000249499 TBC1D16Q8TBP0 767 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXD9-201ENST00000249499 C12orf60Q5U649 245 aa26.47■■□□□ 1.83
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