RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000171737.2

Odc1-201, Transcript of Ornithine decarboxylase, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Odc1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odc1-201ENSMUST00000171737 TicrrQ8BQ33 1889 aa28.41■■■□□ 2.14
Odc1-201ENSMUST00000171737 Bcorl1A2AQH4 1781 aa28.41■■■□□ 2.14
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tekt3Q6X6Z7 490 aa28.41■■■□□ 2.14
Odc1-201ENSMUST00000171737 Fam186bD3Z420 943 aa28.41■■■□□ 2.14
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ces1aE9PYP1 563 aa28.41■■■□□ 2.14
Odc1-201ENSMUST00000171737 Arid4aF8VPQ2 1261 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
Odc1-201ENSMUST00000171737 Vcam1P29533 739 aa28.41■■■□□ 2.14
Odc1-201ENSMUST00000171737 Znf428Q8C1M2 176 aa28.41■■■□□ 2.14
Odc1-201ENSMUST00000171737 Yipf1Q91VU1 306 aa28.41■■■□□ 2.14
Odc1-201ENSMUST00000171737 MyrflQ3UN70 904 aa28.4■■■□□ 2.14
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ubash3aQ3V3E1 624 aa28.4■■■□□ 2.14
Odc1-201ENSMUST00000171737 GnptabQ69ZN6 1235 aa28.4■■■□□ 2.14
Odc1-201ENSMUST00000171737 Zfp317Q8C0Q5 607 aa28.4■■■□□ 2.14
Odc1-201ENSMUST00000171737 Klrc1Q9Z202 244 aa28.4■■■□□ 2.14
Odc1-201ENSMUST00000171737 Foxp1P58462 705 aa28.39■■■□□ 2.14
Odc1-201ENSMUST00000171737 TrhQ62361 256 aa28.39■■■□□ 2.14
Odc1-201ENSMUST00000171737 KhnynQ80U38 671 aa28.39■■■□□ 2.14
Odc1-201ENSMUST00000171737 Sept14Q9DA97 430 aa28.39■■■□□ 2.14
Odc1-201ENSMUST00000171737 Npr3P70180 536 aa28.39■■■□□ 2.14
Odc1-201ENSMUST00000171737 OplahQ8K010 1288 aa28.39■■■□□ 2.14
Odc1-201ENSMUST00000171737 Glrx3Q9CQM9 337 aa28.39■■■□□ 2.14
Odc1-201ENSMUST00000171737 Lbhd1A0A087WPA0 259 aa28.38■■■□□ 2.13
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ccdc82Q6PG04 518 aa28.38■■■□□ 2.13
Odc1-201ENSMUST00000171737 DlatQ8BMF4 642 aa28.38■■■□□ 2.13
Odc1-201ENSMUST00000171737 Clstn1Q9EPL2 979 aa28.38■■■□□ 2.13
Odc1-201ENSMUST00000171737 Vmn2r68L7N2B3 851 aa28.37■■■□□ 2.13
Odc1-201ENSMUST00000171737 Dpf2Q61103 391 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm2163Q6PCY5 473 aa28.37■■■□□ 2.13
Odc1-201ENSMUST00000171737 Stac3Q8BZ71 360 aa28.37■■■□□ 2.13
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rtn1Q8K0T0 780 aa28.37■■■□□ 2.13
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mcm4P49717 862 aa28.37■■■□□ 2.13
Odc1-201ENSMUST00000171737 Slitrk3Q810B9 980 aa28.37■■■□□ 2.13
Odc1-201ENSMUST00000171737 Hirip3Q8BLH7 601 aa28.37■■■□□ 2.13
Odc1-201ENSMUST00000171737 SdsQ8VBT2 327 aa28.37■■■□□ 2.13
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cyp2c69E9PXC3 491 aa28.36■■■□□ 2.13
Odc1-201ENSMUST00000171737 Stx8O88983 236 aa28.36■■■□□ 2.13
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cyp2c40P56657 491 aa28.36■■■□□ 2.13
Odc1-201ENSMUST00000171737 Eya3P97480 510 aa28.36■■■□□ 2.13
Odc1-201ENSMUST00000171737 Psmd1Q3TXS7 953 aa28.36■■■□□ 2.13
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cdkl5Q3UTQ8 938 aa28.36■■■□□ 2.13
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tor1aip2Q8BYU6 502 aa28.36■■■□□ 2.13
Odc1-201ENSMUST00000171737 Lonrf3Q9D4H7 753 aa28.36■■■□□ 2.13
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tmem79Q9D709 391 aa28.36■■■□□ 2.13
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ccdc88aQ5SNZ0 1873 aa28.36■■■□□ 2.13
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mknk2Q8CDB0 459 aa28.35■■■□□ 2.13
Odc1-201ENSMUST00000171737 Clip2Q9Z0H8 1047 aa28.35■■■□□ 2.13
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cd22P35329 862 aa28.35■■■□□ 2.13
Odc1-201ENSMUST00000171737 LyarQ08288 388 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
Odc1-201ENSMUST00000171737 Lamc2Q61092 1191 aa28.35■■■□□ 2.13
Odc1-201ENSMUST00000171737 Flvcr1B2RXV4 560 aa28.34■■■□□ 2.13
Odc1-201ENSMUST00000171737 Zbtb21E9Q444 1094 aa28.34■■■□□ 2.13
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cplx2P84086 134 aa28.34■■■□□ 2.13
Odc1-201ENSMUST00000171737 1700013D24RikQ0P521 120 aa28.34■■■□□ 2.13
Odc1-201ENSMUST00000171737 Kcnq2Q9Z351 759 aa28.34■■■□□ 2.13
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ptrh1Q8BW00 204 aa28.34■■■□□ 2.13
Odc1-201ENSMUST00000171737 Spryd3E9Q9B3 442 aa28.33■■■□□ 2.13
Odc1-201ENSMUST00000171737 Vil1Q62468 827 aa28.33■■■□□ 2.13
Odc1-201ENSMUST00000171737 Atxn7Q8R4I1 867 aa28.33■■■□□ 2.13
Odc1-201ENSMUST00000171737 Myh14Q6URW6 2000 aa28.33■■■□□ 2.13
Odc1-201ENSMUST00000171737 LrmpQ60664 539 aa28.33■■■□□ 2.12
Odc1-201ENSMUST00000171737 NynrinQ5DTZ0 1840 aa28.32■■■□□ 2.12
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mad2l2Q9D752 211 aa28.32■■■□□ 2.12
Odc1-201ENSMUST00000171737 Myh8P13542 1937 aa28.31■■■□□ 2.12
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tigd5Q499M4 642 aa28.31■■■□□ 2.12
Odc1-201ENSMUST00000171737 Pip5kl1Q6U7H8 395 aa28.31■■■□□ 2.12
Odc1-201ENSMUST00000171737 Lins1Q3U1D0 764 aa28.31■■■□□ 2.12
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tmc4Q7TQ65 694 aa28.31■■■□□ 2.12
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ppp1r11Q8K1L5 131 aa28.31■■■□□ 2.12
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ubac1Q8VDI7 409 aa28.31■■■□□ 2.12
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mrps5Q99N87 432 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
Odc1-201ENSMUST00000171737 Scg2Q03517 617 aa28.3■■■□□ 2.12
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cnnm3Q32NY4 713 aa28.3■■■□□ 2.12
Odc1-201ENSMUST00000171737 Esyt1Q3U7R1 1092 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ncbp1Q3UYV9 790 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
Odc1-201ENSMUST00000171737 Fam196bQ6GQV1 535 aa28.3■■■□□ 2.12
Odc1-201ENSMUST00000171737 Srgap1Q91Z69 1062 aa28.3■■■□□ 2.12
Odc1-201ENSMUST00000171737 Atp8b3Q6UQ17 1335 aa28.3■■■□□ 2.12
Odc1-201ENSMUST00000171737 Traf3ip1Q149C2 625 aa28.3■■■□□ 2.12
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gxylt1Q3UHH8 404 aa28.3■■■□□ 2.12
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tacc1Q6Y685 774 aa28.3■■■□□ 2.12
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tmem47Q9JJG6 181 aa28.3■■■□□ 2.12
Odc1-201ENSMUST00000171737 Stk39Q9Z1W9 556 aa28.3■■■□□ 2.12
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cdc45Q9Z1X9 566 aa28.3■■■□□ 2.12
Odc1-201ENSMUST00000171737 A0A1Y7VML8 143 aa28.29■■■□□ 2.12
Odc1-201ENSMUST00000171737 D830030K20RikE9PYQ5 218 aa28.29■■■□□ 2.12
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm3043K7N693 218 aa28.29■■■□□ 2.12
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm16440K7N6G6 218 aa28.29■■■□□ 2.12
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm2244L7N2A3 218 aa28.29■■■□□ 2.12
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm3278L7N2D2 218 aa28.29■■■□□ 2.12
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm8271L7N2E2 218 aa28.29■■■□□ 2.12
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gimap7Q8R379 293 aa28.29■■■□□ 2.12
Odc1-201ENSMUST00000171737 Plcd1Q8R3B1 756 aa28.29■■■□□ 2.12
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cep89Q9CZX2 791 aa28.29■■■□□ 2.12
Odc1-201ENSMUST00000171737 Akap8Q9DBR0 687 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mical3Q8CJ19 1993 aa28.29■■■□□ 2.12
Odc1-201ENSMUST00000171737 D1Pas1P16381 660 aa28.28■■■□□ 2.12
Odc1-201ENSMUST00000171737 Fdx1P46656 188 aa28.28■■■□□ 2.12
Odc1-201ENSMUST00000171737 CebpaP53566 359 aa28.28■■■□□ 2.12
Odc1-201ENSMUST00000171737 Map3k9Q3U1V8 1077 aa28.28■■■□□ 2.12
Odc1-201ENSMUST00000171737 Nap1l3Q794H2 544 aa28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 43.9 ms