Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.06■■■■■ 4.64
Stx8O88983 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
Stx8O88983 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
Stx8O88983 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Stx8O88983 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
Stx8O88983 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Stx8O88983 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
Stx8O88983 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Stx8O88983 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
Stx8O88983 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Stx8O88983 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Stx8O88983 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Stx8O88983 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Stx8O88983 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
Stx8O88983 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Stx8O88983 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
Stx8O88983 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Stx8O88983 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Stx8O88983 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Stx8O88983 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Stx8O88983 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Stx8O88983 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Stx8O88983 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Stx8O88983 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Stx8O88983 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Stx8O88983 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Stx8O88983 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
Stx8O88983 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
Stx8O88983 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Stx8O88983 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Stx8O88983 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Stx8O88983 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Stx8O88983 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Stx8O88983 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Stx8O88983 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Stx8O88983 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Stx8O88983 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Stx8O88983 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Stx8O88983 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Stx8O88983 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Stx8O88983 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Stx8O88983 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Stx8O88983 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Stx8O88983 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Stx8O88983 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Stx8O88983 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Stx8O88983 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Stx8O88983 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Stx8O88983 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Stx8O88983 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Stx8O88983 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Stx8O88983 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Stx8O88983 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
Stx8O88983 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Stx8O88983 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Stx8O88983 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Stx8O88983 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Stx8O88983 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Stx8O88983 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Stx8O88983 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Stx8O88983 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Stx8O88983 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Stx8O88983 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Stx8O88983 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Stx8O88983 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Stx8O88983 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Stx8O88983 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Stx8O88983 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Stx8O88983 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Stx8O88983 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Stx8O88983 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Stx8O88983 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Stx8O88983 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Stx8O88983 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Stx8O88983 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Stx8O88983 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Stx8O88983 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Stx8O88983 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Stx8O88983 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Stx8O88983 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Stx8O88983 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Stx8O88983 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Stx8O88983 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Stx8O88983 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Stx8O88983 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Stx8O88983 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Stx8O88983 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Stx8O88983 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Stx8O88983 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Stx8O88983 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Stx8O88983 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Stx8O88983 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Stx8O88983 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Stx8O88983 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Stx8O88983 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Stx8O88983 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Stx8O88983 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Stx8O88983 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Stx8O88983 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Stx8O88983 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms