Protein–RNA interactions for Protein: A2AQH4

Bcorl1, BCL-6 corepressor-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcorl1A2AQH4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46.18■■■■■ 4.98
Bcorl1A2AQH4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
Bcorl1A2AQH4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
Bcorl1A2AQH4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40.32■■■■■ 4.04
Bcorl1A2AQH4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
Bcorl1A2AQH4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
Bcorl1A2AQH4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Bcorl1A2AQH4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Bcorl1A2AQH4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Bcorl1A2AQH4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Bcorl1A2AQH4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Bcorl1A2AQH4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
Bcorl1A2AQH4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Bcorl1A2AQH4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
Bcorl1A2AQH4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Bcorl1A2AQH4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Bcorl1A2AQH4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Bcorl1A2AQH4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Bcorl1A2AQH4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Bcorl1A2AQH4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Bcorl1A2AQH4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Bcorl1A2AQH4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Bcorl1A2AQH4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
Bcorl1A2AQH4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Bcorl1A2AQH4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Bcorl1A2AQH4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Bcorl1A2AQH4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Bcorl1A2AQH4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Bcorl1A2AQH4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Bcorl1A2AQH4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Bcorl1A2AQH4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Bcorl1A2AQH4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Bcorl1A2AQH4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
Bcorl1A2AQH4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Bcorl1A2AQH4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.33
Bcorl1A2AQH4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Bcorl1A2AQH4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Bcorl1A2AQH4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Bcorl1A2AQH4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Bcorl1A2AQH4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Bcorl1A2AQH4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Bcorl1A2AQH4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Bcorl1A2AQH4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Bcorl1A2AQH4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Bcorl1A2AQH4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
Bcorl1A2AQH4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Bcorl1A2AQH4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Bcorl1A2AQH4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Bcorl1A2AQH4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Bcorl1A2AQH4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
Bcorl1A2AQH4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Bcorl1A2AQH4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Bcorl1A2AQH4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Bcorl1A2AQH4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Bcorl1A2AQH4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Bcorl1A2AQH4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Bcorl1A2AQH4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Bcorl1A2AQH4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Bcorl1A2AQH4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Bcorl1A2AQH4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Bcorl1A2AQH4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Bcorl1A2AQH4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Bcorl1A2AQH4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Bcorl1A2AQH4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Bcorl1A2AQH4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Bcorl1A2AQH4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Bcorl1A2AQH4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Bcorl1A2AQH4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Bcorl1A2AQH4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Bcorl1A2AQH4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Bcorl1A2AQH4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Bcorl1A2AQH4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Bcorl1A2AQH4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Bcorl1A2AQH4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Bcorl1A2AQH4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Bcorl1A2AQH4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Bcorl1A2AQH4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Bcorl1A2AQH4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Bcorl1A2AQH4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Bcorl1A2AQH4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Bcorl1A2AQH4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
Bcorl1A2AQH4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Bcorl1A2AQH4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Bcorl1A2AQH4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Bcorl1A2AQH4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Bcorl1A2AQH4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Bcorl1A2AQH4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Bcorl1A2AQH4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Bcorl1A2AQH4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Bcorl1A2AQH4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Bcorl1A2AQH4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Bcorl1A2AQH4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Bcorl1A2AQH4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Bcorl1A2AQH4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Bcorl1A2AQH4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Bcorl1A2AQH4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Bcorl1A2AQH4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Bcorl1A2AQH4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Bcorl1A2AQH4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Bcorl1A2AQH4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms