Protein–RNA interactions for Protein: Q0P521

1700013D24Rik, MCG1037134, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700013D24RikQ0P521 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43,77■■■■■ 4,6
1700013D24RikQ0P521 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40,36■■■■■ 4,05
1700013D24RikQ0P521 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,76■■■■□ 3,96
1700013D24RikQ0P521 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,27■■■■□ 3,88
1700013D24RikQ0P521 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38,51■■■■□ 3,76
1700013D24RikQ0P521 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,35■■■■□ 3,73
1700013D24RikQ0P521 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,92■■■■□ 3,66
1700013D24RikQ0P521 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37,83■■■■□ 3,65
1700013D24RikQ0P521 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37,75■■■■□ 3,63
1700013D24RikQ0P521 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,22■■■■□ 3,55
1700013D24RikQ0P521 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,91■■■■□ 3,5
1700013D24RikQ0P521 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,83■■■■□ 3,49
1700013D24RikQ0P521 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36,55■■■■□ 3,44
1700013D24RikQ0P521 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36,52■■■■□ 3,44
1700013D24RikQ0P521 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,36■■■■□ 3,41
1700013D24RikQ0P521 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36,34■■■■□ 3,41
1700013D24RikQ0P521 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36,3■■■■□ 3,4
1700013D24RikQ0P521 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
1700013D24RikQ0P521 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,96■■■■□ 3,35
1700013D24RikQ0P521 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,94■■■■□ 3,34
1700013D24RikQ0P521 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,9■■■■□ 3,34
1700013D24RikQ0P521 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,88■■■■□ 3,33
1700013D24RikQ0P521 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,74■■■■□ 3,31
1700013D24RikQ0P521 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,66■■■■□ 3,3
1700013D24RikQ0P521 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,49■■■■□ 3,27
1700013D24RikQ0P521 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35,47■■■■□ 3,27
1700013D24RikQ0P521 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,46■■■■□ 3,27
1700013D24RikQ0P521 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35,46■■■■□ 3,27
1700013D24RikQ0P521 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35,36■■■■□ 3,25
1700013D24RikQ0P521 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,1■■■■□ 3,21
1700013D24RikQ0P521 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
1700013D24RikQ0P521 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35,04■■■■□ 3,2
1700013D24RikQ0P521 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34,92■■■■□ 3,18
1700013D24RikQ0P521 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
1700013D24RikQ0P521 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,79■■■■□ 3,16
1700013D24RikQ0P521 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,7■■■■□ 3,15
1700013D24RikQ0P521 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,59■■■■□ 3,13
1700013D24RikQ0P521 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,59■■■■□ 3,13
1700013D24RikQ0P521 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,5■■■■□ 3,11
1700013D24RikQ0P521 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34,48■■■■□ 3,11
1700013D24RikQ0P521 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,37■■■■□ 3,09
1700013D24RikQ0P521 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34,33■■■■□ 3,09
1700013D24RikQ0P521 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,3■■■■□ 3,08
1700013D24RikQ0P521 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
1700013D24RikQ0P521 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34,23■■■■□ 3,07
1700013D24RikQ0P521 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
1700013D24RikQ0P521 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
1700013D24RikQ0P521 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34,07■■■■□ 3,05
1700013D24RikQ0P521 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
1700013D24RikQ0P521 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
1700013D24RikQ0P521 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,03
1700013D24RikQ0P521 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
1700013D24RikQ0P521 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
1700013D24RikQ0P521 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33,8■■■■□ 3
1700013D24RikQ0P521 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33,79■■■■□ 3
1700013D24RikQ0P521 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
1700013D24RikQ0P521 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33,73■■■□□ 2,99
1700013D24RikQ0P521 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
1700013D24RikQ0P521 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33,61■■■□□ 2,97
1700013D24RikQ0P521 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33,54■■■□□ 2,96
1700013D24RikQ0P521 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
1700013D24RikQ0P521 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
1700013D24RikQ0P521 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
1700013D24RikQ0P521 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,43■■■□□ 2,94
1700013D24RikQ0P521 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
1700013D24RikQ0P521 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
1700013D24RikQ0P521 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33,36■■■□□ 2,93
1700013D24RikQ0P521 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33,32■■■□□ 2,92
1700013D24RikQ0P521 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,3■■■□□ 2,92
1700013D24RikQ0P521 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33,28■■■□□ 2,92
1700013D24RikQ0P521 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
1700013D24RikQ0P521 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,22■■■□□ 2,91
1700013D24RikQ0P521 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,18■■■□□ 2,9
1700013D24RikQ0P521 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
1700013D24RikQ0P521 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33,16■■■□□ 2,9
1700013D24RikQ0P521 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,89
1700013D24RikQ0P521 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33,11■■■□□ 2,89
1700013D24RikQ0P521 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,99■■■□□ 2,87
1700013D24RikQ0P521 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,99■■■□□ 2,87
1700013D24RikQ0P521 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32,98■■■□□ 2,87
1700013D24RikQ0P521 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32,95■■■□□ 2,87
1700013D24RikQ0P521 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,93■■■□□ 2,86
1700013D24RikQ0P521 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32,88■■■□□ 2,85
1700013D24RikQ0P521 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32,83■■■□□ 2,85
1700013D24RikQ0P521 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32,81■■■□□ 2,84
1700013D24RikQ0P521 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32,79■■■□□ 2,84
1700013D24RikQ0P521 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
1700013D24RikQ0P521 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
1700013D24RikQ0P521 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32,67■■■□□ 2,82
1700013D24RikQ0P521 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
1700013D24RikQ0P521 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32,63■■■□□ 2,81
1700013D24RikQ0P521 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32,59■■■□□ 2,81
1700013D24RikQ0P521 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
1700013D24RikQ0P521 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
1700013D24RikQ0P521 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
1700013D24RikQ0P521 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
1700013D24RikQ0P521 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
1700013D24RikQ0P521 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
1700013D24RikQ0P521 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
1700013D24RikQ0P521 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,35■■■□□ 2,77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,3 ms