RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000033598.8

Sh3bgrl-201, Transcript of SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bgrl, Length 2,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Il7P10168 154 aa11.65□□□□□ -0.54
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Nkx2-5P42582 318 aa11.65□□□□□ -0.54
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Gucy2cQ3UWA6 1072 aa11.65□□□□□ -0.54
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Tubb2aQ7TMM9 445 aa11.65□□□□□ -0.54
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Vps16Q920Q4 839 aa11.65□□□□□ -0.54
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Tubb2bQ9CWF2 445 aa11.65□□□□□ -0.54
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Ccdc39Q9D5Y1 937 aa11.65□□□□□ -0.54
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Irx5Q9JKQ4 484 aa11.65□□□□□ -0.54
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Ccne2Q9Z238 404 aa11.65□□□□□ -0.54
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Ubr2Q6WKZ8 1755 aa11.65□□□□□ -0.54
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Tpm3-rs7D3Z2H9 248 aa11.65□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Rnf40Q3U319 1001 aa11.65□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Asic4Q7TNS7 539 aa11.65□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Pip4k2bQ80XI4 416 aa11.65□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Coro7Q9D2V7 922 aa11.65□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Thap2Q9D305 217 aa11.65□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Hic2Q9JLZ6 619 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Ctdp1Q7TSG2 960 aa11.64□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Dnajc5gQ8C632 165 aa11.64□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Sash3Q8K352 380 aa11.64□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 TkfcQ8VC30 578 aa11.64□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Ciao1Q99KN2 339 aa11.64□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Myh1Q5SX40 1942 aa11.64□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Tns2Q8CGB6 1400 aa11.64□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Tubb4bP68372 445 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Zbtb38Q3LR78 1197 aa11.64□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Tsr1Q5SWD9 803 aa11.64□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Csrnp2Q8BGQ2 534 aa11.64□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Emilin1Q99K41 1017 aa11.64□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 ToporslQ9D2F8 683 aa11.64□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 MycbpQ9EQS3 103 aa11.64□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Ltb4r2Q9JJL9 360 aa11.64□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Chaf1aQ9QWF0 911 aa11.64□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Fam50bQ9WTJ8 334 aa11.64□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Cul4bA2A432 970 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Zfand4D3Z3C6 739 aa11.63□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Hap1O35668 628 aa11.63□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 TsksO54887 585 aa11.63□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Foxp1P58462 705 aa11.63□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Fam170aQ66LM6 333 aa11.63□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Sval3Q76I99 144 aa11.63□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Rasal3Q8C2K5 1041 aa11.63□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Alx1Q8C8B0 326 aa11.63□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Trim52Q8CDV4 233 aa11.63□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Smc4Q8CG47 1286 aa11.63□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Sirt2Q8VDQ8 389 aa11.63□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Efcab2Q9CQ46 164 aa11.63□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Ccdc47Q9D024 483 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Ribc1Q9D0B8 379 aa11.63□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Sept12Q9D451 317 aa11.63□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 AK157302I3ITR1 129 aa11.63□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Myd88P22366 296 aa11.63□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Cct5P80316 541 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Zmym1Q3TJB1 983 aa11.63□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Usp27Q8CEG8 438 aa11.63□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Etnk1Q9D4V0 363 aa11.63□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Isca1Q9D924 129 aa11.63□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Itga2bQ9QUM0 1033 aa11.63□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Adamtsl3G3UXC7 1706 aa11.63□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Setdb1O88974 1307 aa11.62□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Pcdhb9E9Q5G2 828 aa11.62□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Foxn2E9Q7L6 429 aa11.62□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Trim55G3X8Y1 545 aa11.62□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Pth1rP41593 591 aa11.62□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Ppp1r7Q3UM45 361 aa11.62□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Ttc19Q8CC21 365 aa11.62□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Arhgef6Q8K4I3 771 aa11.62□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Tspyl4Q8VD63 406 aa11.62□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Prpf6Q91YR7 941 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 PpanQ91YU8 470 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Mfap3Q922T2 349 aa11.62□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Krt23Q99PS0 422 aa11.62□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Tnks1bp1P58871 1720 aa11.62□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Cyp2j7A0A140T8U1 504 aa11.62□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Ppfia4B8QI36 1187 aa11.62□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Dnajc21E9Q8D0 531 aa11.62□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Scgb2b19J3QM75 112 aa11.62□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Cct6bQ61390 531 aa11.62□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Glis3Q6XP49 780 aa11.62□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Dzip1Q8BMD2 852 aa11.62□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 AdarQ99MU3 1178 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Egfl6Q9JJZ5 550 aa11.62□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Myh2G3UW82 1942 aa11.62□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Med23Q80YQ2 1367 aa11.62□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 LtbrP50284 415 aa11.61□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Top1Q04750 767 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Gtf2f1Q3THK3 508 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Zranb3Q6NZP1 1069 aa11.61□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Epn1Q80VP1 575 aa11.61□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 9230110C19RikQ8CC70 267 aa11.61□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Flad1Q8R123 492 aa11.61□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Zkscan3Q91VW9 553 aa11.61□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Fam217aQ9D9W6 419 aa11.61□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Myh6Q02566 1938 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Plekhf1Q3TB82 279 aa11.61□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Apol10aQ8CCA5 318 aa11.61□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Cgref1Q8R1U2 281 aa11.61□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Vmn1r218Q8R261 298 aa11.61□□□□□ -0.55
Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 Nfu1Q9QZ23 255 aa11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 44.7 ms