Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQS3

Mycbp, c-Myc-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MycbpQ9EQS3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
MycbpQ9EQS3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
MycbpQ9EQS3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
MycbpQ9EQS3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
MycbpQ9EQS3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
MycbpQ9EQS3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
MycbpQ9EQS3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
MycbpQ9EQS3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
MycbpQ9EQS3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
MycbpQ9EQS3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
MycbpQ9EQS3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
MycbpQ9EQS3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
MycbpQ9EQS3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
MycbpQ9EQS3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MycbpQ9EQS3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MycbpQ9EQS3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MycbpQ9EQS3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
MycbpQ9EQS3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
MycbpQ9EQS3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MycbpQ9EQS3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
MycbpQ9EQS3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MycbpQ9EQS3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MycbpQ9EQS3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MycbpQ9EQS3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MycbpQ9EQS3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MycbpQ9EQS3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MycbpQ9EQS3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MycbpQ9EQS3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MycbpQ9EQS3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MycbpQ9EQS3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MycbpQ9EQS3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MycbpQ9EQS3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MycbpQ9EQS3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MycbpQ9EQS3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MycbpQ9EQS3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MycbpQ9EQS3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MycbpQ9EQS3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MycbpQ9EQS3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MycbpQ9EQS3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MycbpQ9EQS3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MycbpQ9EQS3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MycbpQ9EQS3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MycbpQ9EQS3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MycbpQ9EQS3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MycbpQ9EQS3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MycbpQ9EQS3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MycbpQ9EQS3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MycbpQ9EQS3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
MycbpQ9EQS3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MycbpQ9EQS3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MycbpQ9EQS3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MycbpQ9EQS3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MycbpQ9EQS3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MycbpQ9EQS3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MycbpQ9EQS3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MycbpQ9EQS3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MycbpQ9EQS3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MycbpQ9EQS3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MycbpQ9EQS3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MycbpQ9EQS3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MycbpQ9EQS3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MycbpQ9EQS3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MycbpQ9EQS3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MycbpQ9EQS3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MycbpQ9EQS3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MycbpQ9EQS3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MycbpQ9EQS3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MycbpQ9EQS3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MycbpQ9EQS3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MycbpQ9EQS3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MycbpQ9EQS3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MycbpQ9EQS3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MycbpQ9EQS3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MycbpQ9EQS3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MycbpQ9EQS3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MycbpQ9EQS3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MycbpQ9EQS3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
MycbpQ9EQS3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MycbpQ9EQS3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MycbpQ9EQS3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MycbpQ9EQS3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MycbpQ9EQS3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MycbpQ9EQS3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MycbpQ9EQS3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MycbpQ9EQS3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MycbpQ9EQS3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MycbpQ9EQS3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MycbpQ9EQS3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MycbpQ9EQS3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MycbpQ9EQS3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MycbpQ9EQS3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MycbpQ9EQS3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
MycbpQ9EQS3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MycbpQ9EQS3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MycbpQ9EQS3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MycbpQ9EQS3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MycbpQ9EQS3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MycbpQ9EQS3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MycbpQ9EQS3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MycbpQ9EQS3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms