Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQS3

Mycbp, c-Myc-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MycbpQ9EQS3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
MycbpQ9EQS3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
MycbpQ9EQS3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,22■■■□□ 2,91
MycbpQ9EQS3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,08■■■□□ 2,73
MycbpQ9EQS3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,05■■■□□ 2,72
MycbpQ9EQS3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
MycbpQ9EQS3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
MycbpQ9EQS3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
MycbpQ9EQS3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
MycbpQ9EQS3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
MycbpQ9EQS3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,76■■■□□ 2,51
MycbpQ9EQS3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
MycbpQ9EQS3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
MycbpQ9EQS3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
MycbpQ9EQS3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
MycbpQ9EQS3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
MycbpQ9EQS3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30,03■■■□□ 2,4
MycbpQ9EQS3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,94■■■□□ 2,38
MycbpQ9EQS3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
MycbpQ9EQS3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,37
MycbpQ9EQS3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
MycbpQ9EQS3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
MycbpQ9EQS3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
MycbpQ9EQS3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
MycbpQ9EQS3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29,53■■■□□ 2,32
MycbpQ9EQS3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
MycbpQ9EQS3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
MycbpQ9EQS3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,33■■■□□ 2,29
MycbpQ9EQS3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,26■■■□□ 2,27
MycbpQ9EQS3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
MycbpQ9EQS3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
MycbpQ9EQS3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
MycbpQ9EQS3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,92■■■□□ 2,22
MycbpQ9EQS3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
MycbpQ9EQS3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
MycbpQ9EQS3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
MycbpQ9EQS3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,67■■■□□ 2,18
MycbpQ9EQS3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,66■■■□□ 2,18
MycbpQ9EQS3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
MycbpQ9EQS3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28,62■■■□□ 2,17
MycbpQ9EQS3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
MycbpQ9EQS3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,61■■■□□ 2,17
MycbpQ9EQS3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,55■■■□□ 2,16
MycbpQ9EQS3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
MycbpQ9EQS3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
MycbpQ9EQS3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
MycbpQ9EQS3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
MycbpQ9EQS3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28,36■■■□□ 2,13
MycbpQ9EQS3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
MycbpQ9EQS3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
MycbpQ9EQS3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
MycbpQ9EQS3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
MycbpQ9EQS3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
MycbpQ9EQS3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
MycbpQ9EQS3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28,07■■■□□ 2,08
MycbpQ9EQS3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
MycbpQ9EQS3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27,94■■■□□ 2,06
MycbpQ9EQS3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,05
MycbpQ9EQS3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
MycbpQ9EQS3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
MycbpQ9EQS3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
MycbpQ9EQS3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
MycbpQ9EQS3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
MycbpQ9EQS3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
MycbpQ9EQS3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,69■■■□□ 2,02
MycbpQ9EQS3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
MycbpQ9EQS3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
MycbpQ9EQS3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
MycbpQ9EQS3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,63■■■□□ 2,01
MycbpQ9EQS3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
MycbpQ9EQS3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
MycbpQ9EQS3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
MycbpQ9EQS3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,49■■□□□ 1,99
MycbpQ9EQS3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
MycbpQ9EQS3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
MycbpQ9EQS3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,41■■□□□ 1,98
MycbpQ9EQS3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27,39■■□□□ 1,98
MycbpQ9EQS3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
MycbpQ9EQS3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
MycbpQ9EQS3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
MycbpQ9EQS3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27,34■■□□□ 1,97
MycbpQ9EQS3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
MycbpQ9EQS3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
MycbpQ9EQS3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
MycbpQ9EQS3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
MycbpQ9EQS3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
MycbpQ9EQS3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
MycbpQ9EQS3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
MycbpQ9EQS3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
MycbpQ9EQS3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27,21■■□□□ 1,95
MycbpQ9EQS3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
MycbpQ9EQS3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27,2■■□□□ 1,94
MycbpQ9EQS3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
MycbpQ9EQS3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27,09■■□□□ 1,93
MycbpQ9EQS3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27,08■■□□□ 1,93
MycbpQ9EQS3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
MycbpQ9EQS3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
MycbpQ9EQS3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
MycbpQ9EQS3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,03■■□□□ 1,92
MycbpQ9EQS3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43,8 ms