Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43.89■■■■■ 4.62
Irx5Q9JKQ4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Irx5Q9JKQ4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Irx5Q9JKQ4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
Irx5Q9JKQ4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Irx5Q9JKQ4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Irx5Q9JKQ4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
Irx5Q9JKQ4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Irx5Q9JKQ4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Irx5Q9JKQ4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
Irx5Q9JKQ4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Irx5Q9JKQ4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Irx5Q9JKQ4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Irx5Q9JKQ4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Irx5Q9JKQ4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Irx5Q9JKQ4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Irx5Q9JKQ4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Irx5Q9JKQ4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Irx5Q9JKQ4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Irx5Q9JKQ4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Irx5Q9JKQ4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Irx5Q9JKQ4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Irx5Q9JKQ4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Irx5Q9JKQ4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Irx5Q9JKQ4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Irx5Q9JKQ4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Irx5Q9JKQ4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Irx5Q9JKQ4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Irx5Q9JKQ4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Irx5Q9JKQ4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
Irx5Q9JKQ4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Irx5Q9JKQ4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Irx5Q9JKQ4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Irx5Q9JKQ4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Irx5Q9JKQ4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Irx5Q9JKQ4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Irx5Q9JKQ4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Irx5Q9JKQ4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Irx5Q9JKQ4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Irx5Q9JKQ4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Irx5Q9JKQ4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Irx5Q9JKQ4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
Irx5Q9JKQ4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Irx5Q9JKQ4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Irx5Q9JKQ4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Irx5Q9JKQ4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Irx5Q9JKQ4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Irx5Q9JKQ4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Irx5Q9JKQ4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Irx5Q9JKQ4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Irx5Q9JKQ4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Irx5Q9JKQ4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Irx5Q9JKQ4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Irx5Q9JKQ4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Irx5Q9JKQ4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Irx5Q9JKQ4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Irx5Q9JKQ4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Irx5Q9JKQ4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Irx5Q9JKQ4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Irx5Q9JKQ4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Irx5Q9JKQ4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Irx5Q9JKQ4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Irx5Q9JKQ4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Irx5Q9JKQ4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Irx5Q9JKQ4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Irx5Q9JKQ4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Irx5Q9JKQ4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Irx5Q9JKQ4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Irx5Q9JKQ4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Irx5Q9JKQ4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Irx5Q9JKQ4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Irx5Q9JKQ4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Irx5Q9JKQ4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Irx5Q9JKQ4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Irx5Q9JKQ4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Irx5Q9JKQ4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Irx5Q9JKQ4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Irx5Q9JKQ4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Irx5Q9JKQ4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Irx5Q9JKQ4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Irx5Q9JKQ4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Irx5Q9JKQ4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Irx5Q9JKQ4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Irx5Q9JKQ4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Irx5Q9JKQ4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Irx5Q9JKQ4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Irx5Q9JKQ4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Irx5Q9JKQ4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Irx5Q9JKQ4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Irx5Q9JKQ4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Irx5Q9JKQ4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Irx5Q9JKQ4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Irx5Q9JKQ4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Irx5Q9JKQ4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Irx5Q9JKQ4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Irx5Q9JKQ4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Irx5Q9JKQ4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Irx5Q9JKQ4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Irx5Q9JKQ4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Irx5Q9JKQ4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms