Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43,89■■■■■ 4,62
Irx5Q9JKQ4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41,19■■■■■ 4,18
Irx5Q9JKQ4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,44■■■■■ 4,06
Irx5Q9JKQ4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38,74■■■■□ 3,79
Irx5Q9JKQ4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37,35■■■■□ 3,57
Irx5Q9JKQ4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,14■■■■□ 3,54
Irx5Q9JKQ4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37,14■■■■□ 3,54
Irx5Q9JKQ4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,08■■■■□ 3,53
Irx5Q9JKQ4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,56■■■■□ 3,44
Irx5Q9JKQ4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36,54■■■■□ 3,44
Irx5Q9JKQ4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36,48■■■■□ 3,43
Irx5Q9JKQ4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,46■■■■□ 3,43
Irx5Q9JKQ4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,29■■■■□ 3,4
Irx5Q9JKQ4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36,27■■■■□ 3,4
Irx5Q9JKQ4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36,09■■■■□ 3,37
Irx5Q9JKQ4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35,94■■■■□ 3,34
Irx5Q9JKQ4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,22■■■■□ 3,23
Irx5Q9JKQ4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35,16■■■■□ 3,22
Irx5Q9JKQ4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35,04■■■■□ 3,2
Irx5Q9JKQ4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,92■■■■□ 3,18
Irx5Q9JKQ4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,8■■■■□ 3,16
Irx5Q9JKQ4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34,57■■■■□ 3,12
Irx5Q9JKQ4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34,37■■■■□ 3,09
Irx5Q9JKQ4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34,34■■■■□ 3,09
Irx5Q9JKQ4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34,25■■■■□ 3,07
Irx5Q9JKQ4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,23■■■■□ 3,07
Irx5Q9JKQ4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34,19■■■■□ 3,06
Irx5Q9JKQ4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
Irx5Q9JKQ4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33,87■■■■□ 3,01
Irx5Q9JKQ4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33,78■■■■□ 3
Irx5Q9JKQ4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33,76■■■□□ 2,99
Irx5Q9JKQ4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33,67■■■□□ 2,98
Irx5Q9JKQ4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33,51■■■□□ 2,95
Irx5Q9JKQ4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,51■■■□□ 2,95
Irx5Q9JKQ4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Irx5Q9JKQ4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33,34■■■□□ 2,93
Irx5Q9JKQ4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
Irx5Q9JKQ4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Irx5Q9JKQ4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33,09■■■□□ 2,89
Irx5Q9JKQ4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32,96■■■□□ 2,87
Irx5Q9JKQ4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Irx5Q9JKQ4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,85
Irx5Q9JKQ4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Irx5Q9JKQ4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
Irx5Q9JKQ4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32,63■■■□□ 2,81
Irx5Q9JKQ4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32,53■■■□□ 2,8
Irx5Q9JKQ4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Irx5Q9JKQ4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Irx5Q9JKQ4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,77
Irx5Q9JKQ4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,31■■■□□ 2,76
Irx5Q9JKQ4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32,31■■■□□ 2,76
Irx5Q9JKQ4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32,3■■■□□ 2,76
Irx5Q9JKQ4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,76
Irx5Q9JKQ4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32,25■■■□□ 2,75
Irx5Q9JKQ4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32,15■■■□□ 2,74
Irx5Q9JKQ4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,11■■■□□ 2,73
Irx5Q9JKQ4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC32,04■■■□□ 2,72
Irx5Q9JKQ4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32,03■■■□□ 2,72
Irx5Q9JKQ4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Irx5Q9JKQ4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31,91■■■□□ 2,7
Irx5Q9JKQ4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31,9■■■□□ 2,7
Irx5Q9JKQ4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Irx5Q9JKQ4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC31,84■■■□□ 2,69
Irx5Q9JKQ4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Irx5Q9JKQ4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,83■■■□□ 2,69
Irx5Q9JKQ4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,78■■■□□ 2,68
Irx5Q9JKQ4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Irx5Q9JKQ4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31,72■■■□□ 2,67
Irx5Q9JKQ4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Irx5Q9JKQ4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Irx5Q9JKQ4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,69■■■□□ 2,66
Irx5Q9JKQ4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC31,67■■■□□ 2,66
Irx5Q9JKQ4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,61■■■□□ 2,65
Irx5Q9JKQ4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31,6■■■□□ 2,65
Irx5Q9JKQ4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,58■■■□□ 2,65
Irx5Q9JKQ4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31,53■■■□□ 2,64
Irx5Q9JKQ4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Irx5Q9JKQ4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Irx5Q9JKQ4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Irx5Q9JKQ4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,37■■■□□ 2,61
Irx5Q9JKQ4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Irx5Q9JKQ4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Irx5Q9JKQ4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Irx5Q9JKQ4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Irx5Q9JKQ4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31,3■■■□□ 2,6
Irx5Q9JKQ4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Irx5Q9JKQ4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,25■■■□□ 2,59
Irx5Q9JKQ4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC31,25■■■□□ 2,59
Irx5Q9JKQ4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC31,16■■■□□ 2,58
Irx5Q9JKQ4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Irx5Q9JKQ4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Irx5Q9JKQ4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Irx5Q9JKQ4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Irx5Q9JKQ4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Irx5Q9JKQ4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC31,08■■■□□ 2,57
Irx5Q9JKQ4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31,07■■■□□ 2,56
Irx5Q9JKQ4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,04■■■□□ 2,56
Irx5Q9JKQ4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31,04■■■□□ 2,56
Irx5Q9JKQ4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC30,99■■■□□ 2,55
Irx5Q9JKQ4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC30,9■■■□□ 2,54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,8 ms