RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bap1Q99PU7 728 aa13.68□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccer1Q9CQL2 403 aa13.68□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 D1Pas1P16381 660 aa13.67□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam196bQ6GQV1 535 aa13.67□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tbc1d5Q80XQ2 815 aa13.67□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Alg3Q8K2A8 438 aa13.67□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dnm1P39053 867 aa13.67□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 1700013D24RikQ0P521 120 aa13.67□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tm4sf1Q64302 202 aa13.67□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc93Q7TQK5 629 aa13.67□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Myh3P13541 1940 aa13.67□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm36210A0A1B0GS00 229 aa13.67□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mageb2A2AHM0 380 aa13.67□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rc3h1Q4VGL6 1130 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trmt2aQ8BNV1 574 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ubac1Q8VDI7 409 aa13.67□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pde4aO89084 844 aa13.66□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gadd45bP22339 160 aa13.66□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pcmtd1P59913 357 aa13.66□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Leo1Q5XJE5 667 aa13.66□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dpf2Q61103 391 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 PaoxQ8C0L6 504 aa13.66□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp113Q8C689 439 aa13.66□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gimap7Q8R379 293 aa13.66□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Calm1P0DP26 149 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Calm2P0DP27 149 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Calm3P0DP28 149 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cep63Q3UPP8 700 aa13.66□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mdh1bQ5F204 500 aa13.66□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dpp8Q80YA7 892 aa13.66□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 VmacQ8BP01 174 aa13.66□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 FktnQ8R507 461 aa13.66□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 SdsQ8VBT2 327 aa13.66□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dnai2A2AC93 623 aa13.66□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zscan18E9PUD6 809 aa13.66□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 TrdnE9Q9K5 693 aa13.66□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ftl1P29391 183 aa13.66□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Eme2Q56A04 373 aa13.66□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Smarcc2Q6PDG5 1213 aa13.66□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mboat7Q8CHK3 473 aa13.65□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atxn7Q8R4I1 867 aa13.65□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Wasf1Q8R5H6 559 aa13.65□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gripap1Q8VD04 806 aa13.65□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Acnat2Q8BGG9 420 aa13.65□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gjd4Q8BSD4 364 aa13.65□□□□□ -0.22
Herc3-201ENSMUST00000031823 Foxp1P58462 705 aa13.65□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gas1Q01721 343 aa13.65□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ubash3aQ3V3E1 624 aa13.65□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc10a5Q5PT54 434 aa13.65□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prss51A0A286YDY8 319 aa13.64□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fdx1P46656 188 aa13.64□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mtx1P47802 317 aa13.64□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lins1Q3U1D0 764 aa13.64□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Srek1Q8BZX4 494 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 CerkQ8K4Q7 531 aa13.64□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 A0A1W2P6Q8 802 aa13.64□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm9048A0A1W2P7H4 802 aa13.64□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 A0A1W2P7Z8 802 aa13.64□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm9046A0A1W2P855 802 aa13.64□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tbc1d8bA3KGB4 1114 aa13.64□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Flvcr1B2RXV4 560 aa13.64□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ddit3P35639 168 aa13.64□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sec23aQ01405 765 aa13.64□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Casc1Q6TDU8 730 aa13.64□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trmt112Q9DCG9 125 aa13.64□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Krt85Q9Z2T6 507 aa13.64□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Myh7Q91Z83 1935 aa13.64□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp831A2ADM8 1628 aa13.64□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tigd5Q499M4 642 aa13.63□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmtc2Q56A06 836 aa13.63□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 MycbpapQ5SUV2 932 aa13.63□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 LrmpQ60664 539 aa13.63□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 CbarpQ66L44 698 aa13.63□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tor1aip2Q8BYU6 502 aa13.63□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mtcl1Q3UHU5 1945 aa13.63□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm30191A0A0U1RNT7 187 aa13.63□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Clrn2B2RVW2 232 aa13.63□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mybl2P48972 704 aa13.63□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zbtb22Q9Z0G7 638 aa13.63□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 A0A1Y7VML8 143 aa13.63□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nfil3O08750 462 aa13.63□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rgs9O54828 675 aa13.63□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vil1Q62468 827 aa13.63□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ces3aQ63880 571 aa13.63□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kif1bpQ6ZPU9 617 aa13.63□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc178Q8CDV0 866 aa13.63□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ces3bQ8VCU1 571 aa13.63□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nfe2l3Q9WTM4 660 aa13.63□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Homer1Q9Z2Y3 366 aa13.63□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Alppl2P24823 529 aa13.62□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Scg2Q03517 617 aa13.62□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Psmd1Q3TXS7 953 aa13.62□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Klhdc9Q3USL1 350 aa13.62□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Srgap1Q91Z69 1062 aa13.62□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ltn1Q6A009 1767 aa13.62□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fxr1Q61584 677 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ppp2r5bQ6PD28 497 aa13.62□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmc4Q7TQ65 694 aa13.62□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccar2Q8VDP4 922 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
Herc3-201ENSMUST00000031823 Akap8Q9DBR0 687 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18 ms