RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640640.1

SCARB2-223, Transcript of scavenger receptor class B member 2, human

TSL 5 BASIC

Gene SCARB2, Length 4,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCARB2-223	ENST00000640640	KRTAP12-4	P60329	112 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SCARB2-223	ENST00000640640	SPRR2D	P22532	72 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SCARB2-223	ENST00000640640	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SCARB2-223	ENST00000640640	MT1M	Q8N339	61 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SCARB2-223	ENST00000640640	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SCARB2-223	ENST00000640640	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		5.58	□□□□□ -1.52
SCARB2-223	ENST00000640640	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		5.52	□□□□□ -1.53
SCARB2-223	ENST00000640640	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SCARB2-223	ENST00000640640	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SCARB2-223	ENST00000640640	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SCARB2-223	ENST00000640640	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
SCARB2-223	ENST00000640640	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		5.28	□□□□□ -1.56
SCARB2-223	ENST00000640640	MT3	P25713	68 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SCARB2-223	ENST00000640640	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SCARB2-223	ENST00000640640	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SCARB2-223	ENST00000640640	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SCARB2-223	ENST00000640640	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SCARB2-223	ENST00000640640	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SCARB2-223	ENST00000640640	USH2A	O75445	5202 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SCARB2-223	ENST00000640640	MT1A	P04731	61 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SCARB2-223	ENST00000640640	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.58
SCARB2-223	ENST00000640640	MT4	P47944	62 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SCARB2-223	ENST00000640640	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
SCARB2-223	ENST00000640640	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SCARB2-223	ENST00000640640	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SCARB2-223	ENST00000640640	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SCARB2-223	ENST00000640640	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SCARB2-223	ENST00000640640	KMT2D	O14686	5537 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SCARB2-223	ENST00000640640	PRM1	P04553	51 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SCARB2-223	ENST00000640640	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SCARB2-223	ENST00000640640	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SCARB2-223	ENST00000640640	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCARB2-223	ENST00000640640	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		4.84	□□□□□ -1.64
SCARB2-223	ENST00000640640	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SCARB2-223	ENST00000640640	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCARB2-223	ENST00000640640	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SCARB2-223	ENST00000640640	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCARB2-223	ENST00000640640	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCARB2-223	ENST00000640640	SSPO	A2VEC9	5147 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCARB2-223	ENST00000640640	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SCARB2-223	ENST00000640640	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SCARB2-223	ENST00000640640	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCARB2-223	ENST00000640640	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SCARB2-223	ENST00000640640	KRTAP5-9	P26371	169 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SCARB2-223	ENST00000640640	MDN1	Q9NU22	5596 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SCARB2-223	ENST00000640640	NEB	P20929	6669 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SCARB2-223	ENST00000640640	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SCARB2-223	ENST00000640640	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SCARB2-223	ENST00000640640	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SCARB2-223	ENST00000640640	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SCARB2-223	ENST00000640640	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
SCARB2-223	ENST00000640640	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.9	□□□□□ -1.78
SCARB2-223	ENST00000640640	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.9	□□□□□ -1.78
SCARB2-223	ENST00000640640	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.9	□□□□□ -1.78
SCARB2-223	ENST00000640640	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SCARB2-223	ENST00000640640	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SCARB2-223	ENST00000640640	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SCARB2-223	ENST00000640640	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SCARB2-223	ENST00000640640	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SCARB2-223	ENST00000640640	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SCARB2-223	ENST00000640640	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SCARB2-223	ENST00000640640	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SCARB2-223	ENST00000640640	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SCARB2-223	ENST00000640640	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		3.28	□□□□□ -1.89
SCARB2-223	ENST00000640640	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SCARB2-223	ENST00000640640	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SCARB2-223	ENST00000640640	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SCARB2-223	ENST00000640640	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		2.84	□□□□□ -1.96
SCARB2-223	ENST00000640640	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
SCARB2-223	ENST00000640640	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SCARB2-223	ENST00000640640	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SCARB2-223	ENST00000640640	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SCARB2-223	ENST00000640640	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
SCARB2-223	ENST00000640640	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.44	□□□□□ -2.02
SCARB2-223	ENST00000640640	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		2.33	□□□□□ -2.04
SCARB2-223	ENST00000640640	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.32	□□□□□ -2.04
SCARB2-223	ENST00000640640	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.6	□□□□□ -2.15

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