RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638372.1

SCARB2-208, Transcript of scavenger receptor class B member 2, human

TSL 5

Gene SCARB2, Length 4,811 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCARB2-208	ENST00000638372	MT1E	P04732	61 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCARB2-208	ENST00000638372	SPRR2D	P22532	72 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCARB2-208	ENST00000638372	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SCARB2-208	ENST00000638372	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SCARB2-208	ENST00000638372	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCARB2-208	ENST00000638372	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.59	□□□□□ -1.68
SCARB2-208	ENST00000638372	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCARB2-208	ENST00000638372	MT1M	Q8N339	61 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCARB2-208	ENST00000638372	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCARB2-208	ENST00000638372	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCARB2-208	ENST00000638372	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SCARB2-208	ENST00000638372	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SCARB2-208	ENST00000638372	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
SCARB2-208	ENST00000638372	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
SCARB2-208	ENST00000638372	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
SCARB2-208	ENST00000638372	USH2A	O75445	5202 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SCARB2-208	ENST00000638372	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SCARB2-208	ENST00000638372	MT4	P47944	62 aa		4.3	□□□□□ -1.72
SCARB2-208	ENST00000638372	KMT2D	O14686	5537 aa		4.28	□□□□□ -1.72
SCARB2-208	ENST00000638372	MT3	P25713	68 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SCARB2-208	ENST00000638372	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SCARB2-208	ENST00000638372	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SCARB2-208	ENST00000638372	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SCARB2-208	ENST00000638372	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SCARB2-208	ENST00000638372	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SCARB2-208	ENST00000638372	MT1A	P04731	61 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SCARB2-208	ENST00000638372	PRM1	P04553	51 aa		4.15	□□□□□ -1.74
SCARB2-208	ENST00000638372	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SCARB2-208	ENST00000638372	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SCARB2-208	ENST00000638372	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SCARB2-208	ENST00000638372	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SCARB2-208	ENST00000638372	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SCARB2-208	ENST00000638372	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SCARB2-208	ENST00000638372	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SCARB2-208	ENST00000638372	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SCARB2-208	ENST00000638372	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SCARB2-208	ENST00000638372	SSPO	A2VEC9	5147 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SCARB2-208	ENST00000638372	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		3.93	□□□□□ -1.78
SCARB2-208	ENST00000638372	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SCARB2-208	ENST00000638372	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	3.92	□□□□□ -1.78
SCARB2-208	ENST00000638372	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SCARB2-208	ENST00000638372	MDN1	Q9NU22	5596 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SCARB2-208	ENST00000638372	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SCARB2-208	ENST00000638372	LCE4A	Q5TA78	99 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SCARB2-208	ENST00000638372	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SCARB2-208	ENST00000638372	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.64	□□□□□ -1.83
SCARB2-208	ENST00000638372	KRTAP5-9	P26371	169 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SCARB2-208	ENST00000638372	NEB	P20929	6669 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SCARB2-208	ENST00000638372	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SCARB2-208	ENST00000638372	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SCARB2-208	ENST00000638372	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SCARB2-208	ENST00000638372	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SCARB2-208	ENST00000638372	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SCARB2-208	ENST00000638372	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SCARB2-208	ENST00000638372	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SCARB2-208	ENST00000638372	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SCARB2-208	ENST00000638372	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SCARB2-208	ENST00000638372	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SCARB2-208	ENST00000638372	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SCARB2-208	ENST00000638372	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SCARB2-208	ENST00000638372	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SCARB2-208	ENST00000638372	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SCARB2-208	ENST00000638372	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SCARB2-208	ENST00000638372	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		2.79	□□□□□ -1.96
SCARB2-208	ENST00000638372	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SCARB2-208	ENST00000638372	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		2.53	□□□□□ -2
SCARB2-208	ENST00000638372	KRTAP5-8	O75690	187 aa		2.51	□□□□□ -2.01
SCARB2-208	ENST00000638372	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		2.48	□□□□□ -2.01
SCARB2-208	ENST00000638372	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	2.34	□□□□□ -2.03
SCARB2-208	ENST00000638372	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	2.3	□□□□□ -2.04
SCARB2-208	ENST00000638372	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		2.26	□□□□□ -2.05
SCARB2-208	ENST00000638372	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.18	□□□□□ -2.06
SCARB2-208	ENST00000638372	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.17	□□□□□ -2.06
SCARB2-208	ENST00000638372	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.02	□□□□□ -2.09
SCARB2-208	ENST00000638372	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	1.98	□□□□□ -2.09
SCARB2-208	ENST00000638372	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.83	□□□□□ -2.12
SCARB2-208	ENST00000638372	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		1.76	□□□□□ -2.13
SCARB2-208	ENST00000638372	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.33	□□□□□ -2.2

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