RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617474.1

PTPRT-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRT, Length 4,521 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-210ENST00000617474 SPRR2BP35325 72 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRT-210ENST00000617474 SPRR2AP35326 72 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRT-210ENST00000617474 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRT-210ENST00000617474 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRT-210ENST00000617474 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRT-210ENST00000617474 USH2AO75445 5202 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRT-210ENST00000617474 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRT-210ENST00000617474 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-210ENST00000617474 MT1MQ8N339 61 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRT-210ENST00000617474 SPRR2DP22532 72 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRT-210ENST00000617474 KMT2DO14686 5537 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRT-210ENST00000617474 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRT-210ENST00000617474 PRM1P04553 51 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRT-210ENST00000617474 MT3P25713 68 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRT-210ENST00000617474 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
PTPRT-210ENST00000617474 MT1AP04731 61 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRT-210ENST00000617474 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRT-210ENST00000617474 MT4P47944 62 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRT-210ENST00000617474 SSPOA2VEC9 5147 aa4.34□□□□□ -1.72
PTPRT-210ENST00000617474 LCE1DQ5T752 114 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRT-210ENST00000617474 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRT-210ENST00000617474 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRT-210ENST00000617474 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRT-210ENST00000617474 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRT-210ENST00000617474 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRT-210ENST00000617474 MDN1Q9NU22 5596 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP5-9P26371 169 aa3.71□□□□□ -1.81
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRT-210ENST00000617474 NEBP20929 6669 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRT-210ENST00000617474 LCE4AQ5TA78 99 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRT-210ENST00000617474 LCE1CQ5T751 118 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRT-210ENST00000617474 LCE1EQ5T753 118 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRT-210ENST00000617474 LCE1FQ5T754 118 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRT-210ENST00000617474 MUC5ACP98088 5654 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRT-210ENST00000617474 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.15□□□□□ -1.9
PTPRT-210ENST00000617474 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRT-210ENST00000617474 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP5-8O75690 187 aa2.58□□□□□ -2
PTPRT-210ENST00000617474 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.42□□□□□ -2.02
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRT-210ENST00000617474 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.13□□□□□ -2.07
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
PTPRT-210ENST00000617474 PHGR1C9JFL3 82 aa1.93□□□□□ -2.1
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.92□□□□□ -2.1
PTPRT-210ENST00000617474 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.33□□□□□ -2.2
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