RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617474.1

PTPRT-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRT, Length 4,521 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-210ENST00000617474 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPRT-210ENST00000617474 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.26■■□□□ 1.8
PTPRT-210ENST00000617474 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
PTPRT-210ENST00000617474 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRT-210ENST00000617474 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRT-210ENST00000617474 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRT-210ENST00000617474 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
PTPRT-210ENST00000617474 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
PTPRT-210ENST00000617474 TRIM41Q8WV44 630 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRT-210ENST00000617474 HRCP23327 699 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRT-210ENST00000617474 APLP2Q06481 763 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRT-210ENST00000617474 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
PTPRT-210ENST00000617474 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
PTPRT-210ENST00000617474 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
PTPRT-210ENST00000617474 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
PTPRT-210ENST00000617474 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
PTPRT-210ENST00000617474 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
PTPRT-210ENST00000617474 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRT-210ENST00000617474 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.64■■□□□ 1.37
PTPRT-210ENST00000617474 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PTPRT-210ENST00000617474 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
PTPRT-210ENST00000617474 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PTPRT-210ENST00000617474 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
PTPRT-210ENST00000617474 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
PTPRT-210ENST00000617474 ERICH6Q7L0X2 663 aa23■■□□□ 1.27
PTPRT-210ENST00000617474 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PTPRT-210ENST00000617474 NEFLP07196 543 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRT-210ENST00000617474 ITGAEP38570 1179 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRT-210ENST00000617474 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PTPRT-210ENST00000617474 MYT1Q01538 1121 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRT-210ENST00000617474 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRT-210ENST00000617474 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PTPRT-210ENST00000617474 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRT-210ENST00000617474 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRT-210ENST00000617474 BCANQ96GW7 911 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRT-210ENST00000617474 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PTPRT-210ENST00000617474 ABCC9O60706 1549 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRT-210ENST00000617474 NEUROD1Q13562 356 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRT-210ENST00000617474 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRT-210ENST00000617474 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRT-210ENST00000617474 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PTPRT-210ENST00000617474 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
PTPRT-210ENST00000617474 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRT-210ENST00000617474 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRT-210ENST00000617474 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRT-210ENST00000617474 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PTPRT-210ENST00000617474 ANP32CO43423 234 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRT-210ENST00000617474 TRIM52Q96A61 297 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRT-210ENST00000617474 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
PTPRT-210ENST00000617474 P3H3Q8IVL6 736 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRT-210ENST00000617474 MIER1Q8N108 512 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRT-210ENST00000617474 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
PTPRT-210ENST00000617474 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
PTPRT-210ENST00000617474 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRT-210ENST00000617474 FKBP8Q14318 412 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRT-210ENST00000617474 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PTPRT-210ENST00000617474 SCRIBQ14160 1630 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRT-210ENST00000617474 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRT-210ENST00000617474 ARID3CA6NKF2 412 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRT-210ENST00000617474 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PTPRT-210ENST00000617474 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRT-210ENST00000617474 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
PTPRT-210ENST00000617474 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRT-210ENST00000617474 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PTPRT-210ENST00000617474 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PTPRT-210ENST00000617474 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
PTPRT-210ENST00000617474 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRT-210ENST00000617474 TONSLQ96HA7 1378 aa21.31■■□□□ 1
PTPRT-210ENST00000617474 CEP162Q5TB80 1403 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRT-210ENST00000617474 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
PTPRT-210ENST00000617474 CLIP1P30622 1438 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRT-210ENST00000617474 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
PTPRT-210ENST00000617474 FBLN2P98095 1184 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRT-210ENST00000617474 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.2■□□□□ 0.98
PTPRT-210ENST00000617474 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
PTPRT-210ENST00000617474 NBR1Q14596 966 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRT-210ENST00000617474 BCL11AQ9H165 835 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRT-210ENST00000617474 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRT-210ENST00000617474 MRS2Q9HD23 443 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRT-210ENST00000617474 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.06■□□□□ 0.96
PTPRT-210ENST00000617474 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
PTPRT-210ENST00000617474 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
PTPRT-210ENST00000617474 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
PTPRT-210ENST00000617474 GOLGA3Q08378 1498 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRT-210ENST00000617474 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRT-210ENST00000617474 ANP32EQ9BTT0 268 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRT-210ENST00000617474 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRT-210ENST00000617474 TMC1Q8TDI8 760 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRT-210ENST00000617474 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRT-210ENST00000617474 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
PTPRT-210ENST00000617474 CECR2Q9BXF3 1484 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRT-210ENST00000617474 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRT-210ENST00000617474 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRT-210ENST00000617474 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.88■□□□□ 0.93
PTPRT-210ENST00000617474 SOGA1O94964 1423 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRT-210ENST00000617474 EEA1Q15075 1411 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRT-210ENST00000617474 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20.86■□□□□ 0.93
PTPRT-210ENST00000617474 ARXQ96QS3 562 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRT-210ENST00000617474 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa20.79■□□□□ 0.92
PTPRT-210ENST00000617474 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.76■□□□□ 0.91
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