RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.52□□□□□ -1.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MT1LQ93083 61 aa5.51□□□□□ -1.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.51□□□□□ -1.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.5□□□□□ -1.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MT1EP04732 61 aa5.45□□□□□ -1.54
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.36□□□□□ -1.55
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRM1P04553 51 aa5.34□□□□□ -1.55
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.28□□□□□ -1.56
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MUC2Q02817 5179 aa5.28□□□□□ -1.56
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MT1MQ8N339 61 aa5.27□□□□□ -1.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MT3P25713 68 aa5.2□□□□□ -1.58
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MT4P47944 62 aa5.19□□□□□ -1.58
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.18□□□□□ -1.58
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.13□□□□□ -1.59
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.02□□□□□ -1.61
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.02□□□□□ -1.61
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LCE1DQ5T752 114 aa4.99□□□□□ -1.61
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.98□□□□□ -1.61
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.98□□□□□ -1.61
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.98□□□□□ -1.61
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.97□□□□□ -1.61
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.94□□□□□ -1.62
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MT1AP04731 61 aa4.91□□□□□ -1.62
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.88□□□□□ -1.63
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.83□□□□□ -1.64
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 USH2AO75445 5202 aa4.75□□□□□ -1.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.74□□□□□ -1.65
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.7□□□□□ -1.66
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.68□□□□□ -1.66
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.68□□□□□ -1.66
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.65□□□□□ -1.67
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.59□□□□□ -1.68
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.55□□□□□ -1.68
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LCE4AQ5TA78 99 aa4.53□□□□□ -1.68
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KMT2DO14686 5537 aa4.49□□□□□ -1.69
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP5-9P26371 169 aa4.36□□□□□ -1.71
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LCE1CQ5T751 118 aa4.36□□□□□ -1.71
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LCE1EQ5T753 118 aa4.36□□□□□ -1.71
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LCE1FQ5T754 118 aa4.36□□□□□ -1.71
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SSPOA2VEC9 5147 aa4.35□□□□□ -1.71
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NEBP20929 6669 aa4.22□□□□□ -1.73
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.21□□□□□ -1.74
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.04□□□□□ -1.76
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.97□□□□□ -1.77
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.93□□□□□ -1.78
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.93□□□□□ -1.78
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MDN1Q9NU22 5596 aa3.92□□□□□ -1.78
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.83□□□□□ -1.8
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.69□□□□□ -1.82
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.55□□□□□ -1.84
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.53□□□□□ -1.84
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.43□□□□□ -1.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.43□□□□□ -1.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.32□□□□□ -1.88
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MUC5ACP98088 5654 aa3.22□□□□□ -1.89
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.13□□□□□ -1.91
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP5-8O75690 187 aa3.04□□□□□ -1.92
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.01□□□□□ -1.93
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.97□□□□□ -1.93
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.78□□□□□ -1.96
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.68□□□□□ -1.98
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PHGR1C9JFL3 82 aa2.61□□□□□ -1.99
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.57□□□□□ -2
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.45□□□□□ -2.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.38□□□□□ -2.03
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.27□□□□□ -2.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.53□□□□□ -2.17
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