RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462351.5

PTPRN-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRN, Length 5,099 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-211ENST00000462351 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRN-211ENST00000462351 MT1EP04732 61 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRN-211ENST00000462351 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
PTPRN-211ENST00000462351 MT3P25713 68 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRN-211ENST00000462351 MT1MQ8N339 61 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRN-211ENST00000462351 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
PTPRN-211ENST00000462351 FSIP2Q5CZC0 6907 aa4.3□□□□□ -1.72
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PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRN-211ENST00000462351 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRN-211ENST00000462351 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRN-211ENST00000462351 LCE1DQ5T752 114 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRN-211ENST00000462351 MT1AP04731 61 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRN-211ENST00000462351 MT4P47944 62 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRN-211ENST00000462351 USH2AO75445 5202 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRN-211ENST00000462351 KMT2DO14686 5537 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRN-211ENST00000462351 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRN-211ENST00000462351 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.89□□□□□ -1.79
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PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
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PTPRN-211ENST00000462351 SSPOA2VEC9 5147 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRN-211ENST00000462351 LCE4AQ5TA78 99 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRN-211ENST00000462351 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRN-211ENST00000462351 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRN-211ENST00000462351 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRN-211ENST00000462351 LCE1CQ5T751 118 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRN-211ENST00000462351 LCE1EQ5T753 118 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRN-211ENST00000462351 LCE1FQ5T754 118 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRN-211ENST00000462351 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP5-9P26371 169 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRN-211ENST00000462351 NEBP20929 6669 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRN-211ENST00000462351 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.18□□□□□ -1.9
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PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.65□□□□□ -1.98
PTPRN-211ENST00000462351 MUC5ACP98088 5654 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRN-211ENST00000462351 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.57□□□□□ -2
PTPRN-211ENST00000462351 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.46□□□□□ -2.02
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP5-8O75690 187 aa2.38□□□□□ -2.03
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.19□□□□□ -2.06
PTPRN-211ENST00000462351 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.17□□□□□ -2.06
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.13□□□□□ -2.07
PTPRN-211ENST00000462351 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRN-211ENST00000462351 PHGR1C9JFL3 82 aa2.02□□□□□ -2.09
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.98□□□□□ -2.09
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.94□□□□□ -2.1
PTPRN-211ENST00000462351 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.22□□□□□ -2.21
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