RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462351.5

PTPRN-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRN, Length 5,099 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-211ENST00000462351 NISCHQ9Y2I1 1504 aa24.93■■□□□ 1.58
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PTPRN-211ENST00000462351 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
PTPRN-211ENST00000462351 MYT1Q01538 1121 aa23.02■■□□□ 1.28
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PTPRN-211ENST00000462351 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.71■■□□□ 1.23
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PTPRN-211ENST00000462351 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRN-211ENST00000462351 APLP2Q06481 763 aa22.13■■□□□ 1.13
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PTPRN-211ENST00000462351 CECR2Q9BXF3 1484 aa19.48■□□□□ 0.71
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PTPRN-211ENST00000462351 SLC24A1O60721 1099 aa19.4■□□□□ 0.7
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PTPRN-211ENST00000462351 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
PTPRN-211ENST00000462351 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
PTPRN-211ENST00000462351 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
PTPRN-211ENST00000462351 EEA1Q15075 1411 aa19.22■□□□□ 0.67
PTPRN-211ENST00000462351 GOLGA6L22H0YM25 854 aa19.2■□□□□ 0.66
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PTPRN-211ENST00000462351 CEP162Q5TB80 1403 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRN-211ENST00000462351 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
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