RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443120.5

ANKRD39-202, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD39, Length 4,965 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39-202ENST00000443120 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39-202ENST00000443120 TNXBP22105 4242 aa4.72□□□□□ -1.65
ANKRD39-202ENST00000443120 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39-202ENST00000443120 MUC2Q02817 5179 aa4.67□□□□□ -1.66
ANKRD39-202ENST00000443120 MT1MQ8N339 61 aa4.66□□□□□ -1.66
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.66□□□□□ -1.66
ANKRD39-202ENST00000443120 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.61□□□□□ -1.67
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD39-202ENST00000443120 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.58□□□□□ -1.68
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ANKRD39-202ENST00000443120 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD39-202ENST00000443120 RNF213Q63HN8 5207 aa4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39-202ENST00000443120 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.49□□□□□ -1.69
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.48□□□□□ -1.69
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ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.46□□□□□ -1.7
ANKRD39-202ENST00000443120 FSIP2Q5CZC0 6907 aa4.45□□□□□ -1.7
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.43□□□□□ -1.7
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ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39-202ENST00000443120 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.35□□□□□ -1.71
ANKRD39-202ENST00000443120 LCE1DQ5T752 114 aa4.27□□□□□ -1.73
ANKRD39-202ENST00000443120 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.27□□□□□ -1.73
ANKRD39-202ENST00000443120 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.27□□□□□ -1.73
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.21□□□□□ -1.74
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39-202ENST00000443120 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39-202ENST00000443120 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.12□□□□□ -1.75
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ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
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ANKRD39-202ENST00000443120 LCE4AQ5TA78 99 aa4.02□□□□□ -1.77
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.02□□□□□ -1.77
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD39-202ENST00000443120 KMT2DO14686 5537 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD39-202ENST00000443120 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
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ANKRD39-202ENST00000443120 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
ANKRD39-202ENST00000443120 LCE1CQ5T751 118 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD39-202ENST00000443120 LCE1EQ5T753 118 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD39-202ENST00000443120 LCE1FQ5T754 118 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP5-9P26371 169 aa3.59□□□□□ -1.84
ANKRD39-202ENST00000443120 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.55□□□□□ -1.84
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ANKRD39-202ENST00000443120 SSPOA2VEC9 5147 aa3.51□□□□□ -1.85
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.48□□□□□ -1.85
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.47□□□□□ -1.85
ANKRD39-202ENST00000443120 MDN1Q9NU22 5596 aa3.46□□□□□ -1.86
ANKRD39-202ENST00000443120 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.44□□□□□ -1.86
ANKRD39-202ENST00000443120 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.41□□□□□ -1.86
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.12□□□□□ -1.91
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.92□□□□□ -1.94
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.92□□□□□ -1.94
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.91□□□□□ -1.94
ANKRD39-202ENST00000443120 MUC5ACP98088 5654 aa2.81□□□□□ -1.96
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.77□□□□□ -1.97
ANKRD39-202ENST00000443120 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.76□□□□□ -1.97
ANKRD39-202ENST00000443120 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.67□□□□□ -1.98
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP5-8O75690 187 aa2.51□□□□□ -2.01
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.44□□□□□ -2.02
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.3□□□□□ -2.04
ANKRD39-202ENST00000443120 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
ANKRD39-202ENST00000443120 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
ANKRD39-202ENST00000443120 PHGR1C9JFL3 82 aa2.25□□□□□ -2.05
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.23□□□□□ -2.05
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.22□□□□□ -2.05
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.18□□□□□ -2.06
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.88□□□□□ -2.11
ANKRD39-202ENST00000443120 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.33□□□□□ -2.2
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