RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.61□□□□□ -1.51
SCARB2-201ENST00000264896 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.6□□□□□ -1.51
SCARB2-201ENST00000264896 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.58□□□□□ -1.52
SCARB2-201ENST00000264896 MT1MQ8N339 61 aa5.58□□□□□ -1.52
SCARB2-201ENST00000264896 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.53□□□□□ -1.52
SCARB2-201ENST00000264896 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.44□□□□□ -1.54
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.43□□□□□ -1.54
SCARB2-201ENST00000264896 MUC2Q02817 5179 aa5.42□□□□□ -1.54
SCARB2-201ENST00000264896 MT3P25713 68 aa5.28□□□□□ -1.56
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.28□□□□□ -1.56
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.28□□□□□ -1.56
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.28□□□□□ -1.56
SCARB2-201ENST00000264896 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.23□□□□□ -1.57
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.17□□□□□ -1.58
SCARB2-201ENST00000264896 MT1AP04731 61 aa5.17□□□□□ -1.58
SCARB2-201ENST00000264896 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.16□□□□□ -1.58
SCARB2-201ENST00000264896 PRM1P04553 51 aa5.14□□□□□ -1.59
SCARB2-201ENST00000264896 MT4P47944 62 aa5.05□□□□□ -1.6
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.04□□□□□ -1.6
SCARB2-201ENST00000264896 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
SCARB2-201ENST00000264896 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.96□□□□□ -1.62
SCARB2-201ENST00000264896 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
SCARB2-201ENST00000264896 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.93□□□□□ -1.62
SCARB2-201ENST00000264896 USH2AO75445 5202 aa4.92□□□□□ -1.62
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.9□□□□□ -1.63
SCARB2-201ENST00000264896 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
SCARB2-201ENST00000264896 LCE1DQ5T752 114 aa4.86□□□□□ -1.63
SCARB2-201ENST00000264896 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.84□□□□□ -1.63
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.8□□□□□ -1.64
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.74□□□□□ -1.65
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.74□□□□□ -1.65
SCARB2-201ENST00000264896 KMT2DO14686 5537 aa4.73□□□□□ -1.65
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.73□□□□□ -1.65
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.59□□□□□ -1.67
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
SCARB2-201ENST00000264896 LCE4AQ5TA78 99 aa4.52□□□□□ -1.69
SCARB2-201ENST00000264896 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.5□□□□□ -1.69
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.49□□□□□ -1.69
SCARB2-201ENST00000264896 SSPOA2VEC9 5147 aa4.43□□□□□ -1.7
SCARB2-201ENST00000264896 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.39□□□□□ -1.71
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP5-9P26371 169 aa4.32□□□□□ -1.72
SCARB2-201ENST00000264896 MDN1Q9NU22 5596 aa4.17□□□□□ -1.74
SCARB2-201ENST00000264896 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.1□□□□□ -1.75
SCARB2-201ENST00000264896 NEBP20929 6669 aa4.07□□□□□ -1.76
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.02□□□□□ -1.77
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.96□□□□□ -1.78
SCARB2-201ENST00000264896 LCE1CQ5T751 118 aa3.93□□□□□ -1.78
SCARB2-201ENST00000264896 LCE1EQ5T753 118 aa3.93□□□□□ -1.78
SCARB2-201ENST00000264896 LCE1FQ5T754 118 aa3.93□□□□□ -1.78
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.81□□□□□ -1.8
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.73□□□□□ -1.81
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.64□□□□□ -1.83
SCARB2-201ENST00000264896 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.59□□□□□ -1.84
SCARB2-201ENST00000264896 MUC5ACP98088 5654 aa3.5□□□□□ -1.85
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.46□□□□□ -1.86
SCARB2-201ENST00000264896 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.38□□□□□ -1.87
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.37□□□□□ -1.87
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.37□□□□□ -1.87
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.2□□□□□ -1.9
SCARB2-201ENST00000264896 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.17□□□□□ -1.9
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.11□□□□□ -1.91
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.07□□□□□ -1.92
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP5-8O75690 187 aa2.93□□□□□ -1.94
SCARB2-201ENST00000264896 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.71□□□□□ -1.98
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.7□□□□□ -1.98
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.65□□□□□ -1.99
SCARB2-201ENST00000264896 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.38□□□□□ -2.03
SCARB2-201ENST00000264896 PHGR1C9JFL3 82 aa2.36□□□□□ -2.03
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.21□□□□□ -2.06
SCARB2-201ENST00000264896 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.58□□□□□ -2.16
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.1 ms