RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264658.10

FBXL20-201, Transcript of F-box and leucine rich repeat protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FBXL20, Length 10,388 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL20-201ENST00000264658 BIRC6Q9NR09 4857 aa2.94□□□□□ -1.94
FBXL20-201ENST00000264658 HERC2O95714 4834 aa2.92□□□□□ -1.94
FBXL20-201ENST00000264658 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
FBXL20-201ENST00000264658 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa2.83□□□□□ -1.96
FBXL20-201ENST00000264658 MT3P25713 68 aa2.83□□□□□ -1.96
FBXL20-201ENST00000264658 MUC17Q685J3 4493 aa2.8□□□□□ -1.96
FBXL20-201ENST00000264658 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
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FBXL20-201ENST00000264658 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.74□□□□□ -1.97
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FBXL20-201ENST00000264658 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa2.69□□□□□ -1.98
FBXL20-201ENST00000264658 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.69□□□□□ -1.98
FBXL20-201ENST00000264658 MT1AP04731 61 aa2.69□□□□□ -1.98
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FBXL20-201ENST00000264658 FSIP2Q5CZC0 6907 aa2.54□□□□□ -2
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FBXL20-201ENST00000264658 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa2.35□□□□□ -2.03
FBXL20-201ENST00000264658 USH2AO75445 5202 aa2.29□□□□□ -2.04
FBXL20-201ENST00000264658 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.27□□□□□ -2.05
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FBXL20-201ENST00000264658 KMT2DO14686 5537 aa2.24□□□□□ -2.05
FBXL20-201ENST00000264658 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.22□□□□□ -2.05
FBXL20-201ENST00000264658 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.21□□□□□ -2.06
FBXL20-201ENST00000264658 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.21□□□□□ -2.06
FBXL20-201ENST00000264658 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.15□□□□□ -2.07
FBXL20-201ENST00000264658 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
FBXL20-201ENST00000264658 SSPOA2VEC9 5147 aa2.11□□□□□ -2.07
FBXL20-201ENST00000264658 KRTAP5-9P26371 169 aa2.07□□□□□ -2.08
FBXL20-201ENST00000264658 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
FBXL20-201ENST00000264658 OBSCNQ5VST9 7968 aa1.98□□□□□ -2.09
FBXL20-201ENST00000264658 NEBP20929 6669 aa1.95□□□□□ -2.1
FBXL20-201ENST00000264658 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP1.94□□□□□ -2.1
FBXL20-201ENST00000264658 MUC12Q9UKN1 5478 aa1.89□□□□□ -2.11
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FBXL20-201ENST00000264658 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa1.87□□□□□ -2.11
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FBXL20-201ENST00000264658 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa1.62□□□□□ -2.15
FBXL20-201ENST00000264658 KRTAP5-8O75690 187 aa1.58□□□□□ -2.16
FBXL20-201ENST00000264658 MUC5ACP98088 5654 aa1.51□□□□□ -2.17
FBXL20-201ENST00000264658 PHGR1C9JFL3 82 aa1.51□□□□□ -2.17
FBXL20-201ENST00000264658 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.51□□□□□ -2.17
FBXL20-201ENST00000264658 GPR98Q8WXG9 6306 aa1.47□□□□□ -2.17
FBXL20-201ENST00000264658 KRTAP5-2Q701N4 177 aa1.44□□□□□ -2.18
FBXL20-201ENST00000264658 HMCN1Q96RW7 5635 aa1.43□□□□□ -2.18
FBXL20-201ENST00000264658 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa1.43□□□□□ -2.18
FBXL20-201ENST00000264658 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa1.41□□□□□ -2.18
FBXL20-201ENST00000264658 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa1.38□□□□□ -2.19
FBXL20-201ENST00000264658 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.31□□□□□ -2.2
FBXL20-201ENST00000264658 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
FBXL20-201ENST00000264658 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.28□□□□□ -2.2
FBXL20-201ENST00000264658 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.24□□□□□ -2.21
FBXL20-201ENST00000264658 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.22□□□□□ -2.21
FBXL20-201ENST00000264658 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.17□□□□□ -2.22
FBXL20-201ENST00000264658 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.07□□□□□ -2.24
FBXL20-201ENST00000264658 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.87□□□□□ -2.27
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 129.4 ms