RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255198.2

ZBED3-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED3, Length 6,172 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.99□□□□□ -1.45
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa5.94□□□□□ -1.46
ZBED3-201ENST00000255198 PCLOQ9Y6V0 5065 aa5.94□□□□□ -1.46
ZBED3-201ENST00000255198 MUC17Q685J3 4493 aa5.9□□□□□ -1.47
ZBED3-201ENST00000255198 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ZBED3-201ENST00000255198 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.85□□□□□ -1.47
ZBED3-201ENST00000255198 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
ZBED3-201ENST00000255198 MT1AP04731 61 aa5.82□□□□□ -1.48
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.8□□□□□ -1.48
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.8□□□□□ -1.48
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.76□□□□□ -1.49
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.76□□□□□ -1.49
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.76□□□□□ -1.49
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.68□□□□□ -1.5
ZBED3-201ENST00000255198 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
ZBED3-201ENST00000255198 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
ZBED3-201ENST00000255198 LCE1CQ5T751 118 aa5.65□□□□□ -1.51
ZBED3-201ENST00000255198 LCE1EQ5T753 118 aa5.65□□□□□ -1.51
ZBED3-201ENST00000255198 LCE1FQ5T754 118 aa5.65□□□□□ -1.51
ZBED3-201ENST00000255198 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.65□□□□□ -1.51
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.58□□□□□ -1.52
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.53□□□□□ -1.52
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.52□□□□□ -1.53
ZBED3-201ENST00000255198 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.42□□□□□ -1.54
ZBED3-201ENST00000255198 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.38□□□□□ -1.55
ZBED3-201ENST00000255198 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.36□□□□□ -1.55
ZBED3-201ENST00000255198 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.35□□□□□ -1.55
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.33□□□□□ -1.56
ZBED3-201ENST00000255198 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
ZBED3-201ENST00000255198 LCE4AQ5TA78 99 aa5.3□□□□□ -1.56
ZBED3-201ENST00000255198 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.29□□□□□ -1.56
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.24□□□□□ -1.57
ZBED3-201ENST00000255198 MUC2Q02817 5179 aa5.21□□□□□ -1.58
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.2□□□□□ -1.58
ZBED3-201ENST00000255198 RNF213Q63HN8 5207 aa5.18□□□□□ -1.58
ZBED3-201ENST00000255198 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.1□□□□□ -1.59
ZBED3-201ENST00000255198 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.09□□□□□ -1.59
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.93□□□□□ -1.62
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.77□□□□□ -1.65
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.61□□□□□ -1.67
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.53□□□□□ -1.68
ZBED3-201ENST00000255198 KMT2DO14686 5537 aa4.53□□□□□ -1.68
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.52□□□□□ -1.69
ZBED3-201ENST00000255198 USH2AO75445 5202 aa4.47□□□□□ -1.69
ZBED3-201ENST00000255198 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.44□□□□□ -1.7
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.44□□□□□ -1.7
ZBED3-201ENST00000255198 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
ZBED3-201ENST00000255198 NEBP20929 6669 aa4.33□□□□□ -1.72
ZBED3-201ENST00000255198 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP5-9P26371 169 aa4.18□□□□□ -1.74
ZBED3-201ENST00000255198 SSPOA2VEC9 5147 aa4.15□□□□□ -1.74
ZBED3-201ENST00000255198 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.96□□□□□ -1.78
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.95□□□□□ -1.78
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
ZBED3-201ENST00000255198 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.89□□□□□ -1.79
ZBED3-201ENST00000255198 MDN1Q9NU22 5596 aa3.67□□□□□ -1.82
ZBED3-201ENST00000255198 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.58□□□□□ -1.84
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.43□□□□□ -1.86
ZBED3-201ENST00000255198 MUC5ACP98088 5654 aa3.33□□□□□ -1.88
ZBED3-201ENST00000255198 PHGR1C9JFL3 82 aa3.29□□□□□ -1.88
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP5-8O75690 187 aa3.23□□□□□ -1.89
ZBED3-201ENST00000255198 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.05□□□□□ -1.92
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.05□□□□□ -1.92
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.98□□□□□ -1.93
ZBED3-201ENST00000255198 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.88□□□□□ -1.95
ZBED3-201ENST00000255198 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.79□□□□□ -1.96
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.64□□□□□ -1.99
ZBED3-201ENST00000255198 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.52□□□□□ -2.01
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.44□□□□□ -2.02
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
ZBED3-201ENST00000255198 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.03□□□□□ -2.08
ZBED3-201ENST00000255198 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.8□□□□□ -2.12
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 6.6 ms