RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252211.6

ZKSCAN3-201, Transcript of zinc finger with KRAB and SCAN domains 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZKSCAN3, Length 4,725 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ZKSCAN3-201ENST00000252211 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
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ZKSCAN3-201ENST00000252211 MT1MQ8N339 61 aa3.96□□□□□ -1.78
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MUC2Q02817 5179 aa3.94□□□□□ -1.78
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ZKSCAN3-201ENST00000252211 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.84□□□□□ -1.79
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ZKSCAN3-201ENST00000252211 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.74□□□□□ -1.81
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ZKSCAN3-201ENST00000252211 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.16□□□□□ -1.9
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ZKSCAN3-201ENST00000252211 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.97□□□□□ -1.93
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ZKSCAN3-201ENST00000252211 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.51□□□□□ -2.01
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ZKSCAN3-201ENST00000252211 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.5□□□□□ -2.01
ZKSCAN3-201ENST00000252211 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.48□□□□□ -2.01
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.44□□□□□ -2.02
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KRTAP5-8O75690 187 aa2.29□□□□□ -2.04
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ZKSCAN3-201ENST00000252211 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.03□□□□□ -2.09
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa1.99□□□□□ -2.09
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.98□□□□□ -2.09
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PHGR1C9JFL3 82 aa1.94□□□□□ -2.1
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.84□□□□□ -2.11
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.82□□□□□ -2.12
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.81□□□□□ -2.12
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.67□□□□□ -2.14
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.17□□□□□ -2.22
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