RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008297.4

Clstn3-201, Transcript of Calsyntenin-3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clstn3, Length 4,014 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Srsf9Q9D0B0 222 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
Clstn3-201ENSMUST00000008297 OtorQ9JIE3 128 aa7.34□□□□□ -1.23
Clstn3-201ENSMUST00000008297 P01724 129 aa7.34□□□□□ -1.23
Clstn3-201ENSMUST00000008297 P01727 129 aa7.34□□□□□ -1.23
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Psmg4P0C7N9 123 aa7.34□□□□□ -1.23
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fam24aQ8CF27 98 aa7.34□□□□□ -1.23
Clstn3-201ENSMUST00000008297 ApomQ9Z1R3 190 aa7.34□□□□□ -1.23
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm3285A0A1W2P7U0 201 aa7.34□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 NpsP0C0P8 89 aa7.34□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 AY761184Q9D848 116 aa7.34□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ighv5-8A0A075B676 92 aa7.33□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Olfr1209Q3SXJ3 310 aa7.33□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fbxl15Q91W61 300 aa7.33□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Mrpl36Q99N90 102 aa7.33□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Dchs1E9PVD3 3291 aa7.33□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Trbv14A0A140T8L9 115 aa7.33□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm26727M0QWT1 121 aa7.33□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cela2aP05208 271 aa7.33□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Srp14P16254 110 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ndufc2Q9CQ54 120 aa7.33□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Map1aQ9QYR6 2776 aa7.33□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm33815A0A087WNV3 176 aa7.33□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm29644A0A087WPG2 191 aa7.33□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm45521A0A1B0GRK0 198 aa7.33□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rbx1P62878 108 aa7.33□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ifitm2Q99J93 144 aa7.33□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gtsf1lQ9CWD0 151 aa7.33□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Slamf6Q9ET39 351 aa7.33□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rs1Q9Z1L4 224 aa7.33□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Wnk1P83741 2377 aa7.33□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 H2al2bA9Z055 111 aa7.32□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Thy1P01831 162 aa7.32□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Wipf1Q8K1I7 493 aa7.32□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gkn1Q9CR36 201 aa7.32□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gnb1lQ9EQ15 326 aa7.32□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ighv1-22A0A075B5U7 117 aa7.32□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ighv1-62-3P01754 117 aa7.32□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 P01794 123 aa7.32□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Trav7-2Q5R1I3 112 aa7.32□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 BC107364E9Q5A2 140 aa7.32□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm20481G3UXK4 153 aa7.32□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Bak1O08734 209 aa7.32□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 BtcQ05928 177 aa7.32□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Hist1h1tQ07133 208 aa7.32□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Wfdc2Q9DAU7 174 aa7.32□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Trav14-2A0A075B694 121 aa7.31□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ighv8-4A0A0A6YW26 117 aa7.31□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Igkv4-81A0A0G2JEY5 119 aa7.31□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Lrcol1Q3URS3 161 aa7.31□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 5730522E02RikQ5SP45 163 aa7.31□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Prr3Q811B5 190 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ly6g5bQ8K1T4 194 aa7.31□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ighv1-80A0A075B5Y3 117 aa7.31□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Trav6-4A0A075B6B4 115 aa7.31□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cd27P41272 250 aa7.31□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Snrpd3P62320 126 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Srsf1Q6PDM2 248 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Dusp14Q9JLY7 198 aa7.31□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 KalrnA2CG49 2964 aa7.31□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm10521E9PZK0 135 aa7.31□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 P0C913 63 aa7.31□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 NdpP48744 131 aa7.31□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Olfr317Q5NCD6 327 aa7.31□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Zfp248Q640N4 576 aa7.31□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Obox1Q9D350 204 aa7.31□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cxcl14Q9WUQ5 99 aa7.31□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Esp4A8R0T8 117 aa7.3□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm5294J3QP53 216 aa7.3□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Itgb1bp1O35671 200 aa7.3□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm10604Q3V0X7 143 aa7.3□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rasl10aQ8K5A4 203 aa7.3□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Olfr1199Q8VF94 310 aa7.3□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Lce6aD3YV94 81 aa7.3□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 CrxO54751 299 aa7.3□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Hint1P70349 126 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Znhit3Q9CQK1 151 aa7.3□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 3110018I06RikQ9CXS0 120 aa7.3□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Q9D131 166 aa7.3□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Bex1Q9R224 128 aa7.3□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Prrc2aQ7TSC1 2158 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Igkv20-101-2A0A0G2JDU3 113 aa7.3□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm20517G3UVU6 152 aa7.3□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 P01756 117 aa7.3□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 P01757 117 aa7.3□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Uqcrfs1Q9CR68 274 aa7.3□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Chd8Q09XV5 2582 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rif1Q6PR54 2419 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ighv3-4A0A0A6YXF1 117 aa7.29□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tctex1d4Q8CDY7 219 aa7.29□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 TdhQ8K3F7 373 aa7.29□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gp9O88186 177 aa7.29□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 NrepQ07475 68 aa7.29□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ptpn13Q64512 2453 aa7.29□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 SbpP15501 199 aa7.29□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Olfr322Q5NCC8 327 aa7.29□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Usmg5Q78IK2 58 aa7.29□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 PpdpfQ9CR37 115 aa7.29□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Dpm3Q9D1Q4 92 aa7.29□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm28038F7BCN9 126 aa7.28□□□□□ -1.24
Clstn3-201ENSMUST00000008297 PolP10400 120 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 40.6 ms