RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613894.3

CU633980.1-201, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CU633980.1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU633980.1-201ENST00000613894 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
CU633980.1-201ENST00000613894 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
CU633980.1-201ENST00000613894 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.14□□□□□ -1.43
CU633980.1-201ENST00000613894 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.13□□□□□ -1.43
CU633980.1-201ENST00000613894 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.13□□□□□ -1.43
CU633980.1-201ENST00000613894 CRIPTQ9P021 101 aa6.13□□□□□ -1.43
CU633980.1-201ENST00000613894 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.12□□□□□ -1.43
CU633980.1-201ENST00000613894 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.11□□□□□ -1.43
CU633980.1-201ENST00000613894 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.11□□□□□ -1.43
CU633980.1-201ENST00000613894 TPRXLQ17RH7 258 aa6.09□□□□□ -1.43
CU633980.1-201ENST00000613894 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
CU633980.1-201ENST00000613894 J3QL48 77 aa6.06□□□□□ -1.44
CU633980.1-201ENST00000613894 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CU633980.1-201ENST00000613894 FAT1Q14517 4588 aa6.06□□□□□ -1.44
CU633980.1-201ENST00000613894 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.05□□□□□ -1.44
CU633980.1-201ENST00000613894 NDUFAF8A1L188 74 aa6.05□□□□□ -1.44
CU633980.1-201ENST00000613894 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.04□□□□□ -1.44
CU633980.1-201ENST00000613894 MYCBP2O75592 4640 aa6.04□□□□□ -1.44
CU633980.1-201ENST00000613894 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CU633980.1-201ENST00000613894 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.98□□□□□ -1.45
CU633980.1-201ENST00000613894 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CU633980.1-201ENST00000613894 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.92□□□□□ -1.46
CU633980.1-201ENST00000613894 A0A0A0MQY5 61 aa5.91□□□□□ -1.46
CU633980.1-201ENST00000613894 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.91□□□□□ -1.46
CU633980.1-201ENST00000613894 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.9□□□□□ -1.47
CU633980.1-201ENST00000613894 KRTAP10-2P60368 255 aa5.89□□□□□ -1.47
CU633980.1-201ENST00000613894 Q5VSD8 79 aa5.88□□□□□ -1.47
CU633980.1-201ENST00000613894 S4R3F8 94 aa5.85□□□□□ -1.47
CU633980.1-201ENST00000613894 A0A0D9SG42 100 aa5.83□□□□□ -1.48
CU633980.1-201ENST00000613894 LCE2BO14633 110 aa5.83□□□□□ -1.48
CU633980.1-201ENST00000613894 XP32Q5T750 250 aa5.83□□□□□ -1.48
CU633980.1-201ENST00000613894 KRTAP10-1P60331 282 aa5.8□□□□□ -1.48
CU633980.1-201ENST00000613894 C9orf92A6NGG3 77 aa5.79□□□□□ -1.48
CU633980.1-201ENST00000613894 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
CU633980.1-201ENST00000613894 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
CU633980.1-201ENST00000613894 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.77□□□□□ -1.49
CU633980.1-201ENST00000613894 KRTAP12-2P59991 146 aa5.77□□□□□ -1.49
CU633980.1-201ENST00000613894 KRTAP12-1P59990 96 aa5.74□□□□□ -1.49
CU633980.1-201ENST00000613894 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.73□□□□□ -1.49
CU633980.1-201ENST00000613894 LUZP6Q538Z0 58 aa5.72□□□□□ -1.49
CU633980.1-201ENST00000613894 RNF213Q63HN8 5207 aa5.7□□□□□ -1.5
CU633980.1-201ENST00000613894 LRP2P98164 4655 aa5.67□□□□□ -1.5
CU633980.1-201ENST00000613894 M0QZ58 72 aa5.64□□□□□ -1.51
CU633980.1-201ENST00000613894 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
CU633980.1-201ENST00000613894 TNXBP22105 4242 aa5.6□□□□□ -1.51
CU633980.1-201ENST00000613894 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.59□□□□□ -1.51
CU633980.1-201ENST00000613894 PLAC4Q8WY50 150 aa5.58□□□□□ -1.52
CU633980.1-201ENST00000613894 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
CU633980.1-201ENST00000613894 MT1HL1P0DM35 61 aa5.53□□□□□ -1.52
CU633980.1-201ENST00000613894 KRTAP10-8P60410 259 aa5.52□□□□□ -1.53
CU633980.1-201ENST00000613894 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
CU633980.1-201ENST00000613894 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.5□□□□□ -1.53
CU633980.1-201ENST00000613894 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.49□□□□□ -1.53
CU633980.1-201ENST00000613894 PP632Q6XCG6 107 aa5.43□□□□□ -1.54
CU633980.1-201ENST00000613894 LPAP08519 4548 aa5.38□□□□□ -1.55
CU633980.1-201ENST00000613894 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.38□□□□□ -1.55
CU633980.1-201ENST00000613894 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
CU633980.1-201ENST00000613894 MUC2Q02817 5179 aa5.34□□□□□ -1.55
CU633980.1-201ENST00000613894 LCE3BQ5TA77 95 aa5.28□□□□□ -1.56
CU633980.1-201ENST00000613894 R4GN34 69 aa5.28□□□□□ -1.56
CU633980.1-201ENST00000613894 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.26□□□□□ -1.57
CU633980.1-201ENST00000613894 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.26□□□□□ -1.57
CU633980.1-201ENST00000613894 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.23□□□□□ -1.57
CU633980.1-201ENST00000613894 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.23□□□□□ -1.57
CU633980.1-201ENST00000613894 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.21□□□□□ -1.58
CU633980.1-201ENST00000613894 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.19□□□□□ -1.58
CU633980.1-201ENST00000613894 LCE2CQ5TA81 110 aa5.14□□□□□ -1.59
CU633980.1-201ENST00000613894 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.14□□□□□ -1.59
CU633980.1-201ENST00000613894 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.13□□□□□ -1.59
CU633980.1-201ENST00000613894 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.11□□□□□ -1.59
CU633980.1-201ENST00000613894 MUC17Q685J3 4493 aa5.09□□□□□ -1.59
CU633980.1-201ENST00000613894 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
CU633980.1-201ENST00000613894 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.07□□□□□ -1.6
CU633980.1-201ENST00000613894 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.06□□□□□ -1.6
CU633980.1-201ENST00000613894 INE1O15225 51 aa5.02□□□□□ -1.61
CU633980.1-201ENST00000613894 TNP1P09430 55 aa5□□□□□ -1.61
CU633980.1-201ENST00000613894 LCE1DQ5T752 114 aa4.92□□□□□ -1.62
CU633980.1-201ENST00000613894 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.92□□□□□ -1.62
CU633980.1-201ENST00000613894 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.87□□□□□ -1.63
CU633980.1-201ENST00000613894 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.86□□□□□ -1.63
CU633980.1-201ENST00000613894 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
CU633980.1-201ENST00000613894 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.84□□□□□ -1.63
CU633980.1-201ENST00000613894 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.81□□□□□ -1.64
CU633980.1-201ENST00000613894 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa4.8□□□□□ -1.64
CU633980.1-201ENST00000613894 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa4.8□□□□□ -1.64
CU633980.1-201ENST00000613894 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa4.78□□□□□ -1.64
CU633980.1-201ENST00000613894 MT1HP80294 61 aa4.73□□□□□ -1.65
CU633980.1-201ENST00000613894 SSPOA2VEC9 5147 aa4.64□□□□□ -1.67
CU633980.1-201ENST00000613894 LCE3AQ5TA76 89 aa4.63□□□□□ -1.67
CU633980.1-201ENST00000613894 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa4.62□□□□□ -1.67
CU633980.1-201ENST00000613894 USH2AO75445 5202 aa4.61□□□□□ -1.67
CU633980.1-201ENST00000613894 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.59□□□□□ -1.67
CU633980.1-201ENST00000613894 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
CU633980.1-201ENST00000613894 SPRR2GQ9BYE4 73 aa4.58□□□□□ -1.68
CU633980.1-201ENST00000613894 M0R2T5 61 aa4.56□□□□□ -1.68
CU633980.1-201ENST00000613894 KRTAP10-12P60413 245 aa4.46□□□□□ -1.69
CU633980.1-201ENST00000613894 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
CU633980.1-201ENST00000613894 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
CU633980.1-201ENST00000613894 KRTAP12-3P60328 96 aa4.41□□□□□ -1.7
CU633980.1-201ENST00000613894 KRTAP10-10P60014 251 aa4.4□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms